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《短芽孢杆菌代谢物组测定中抽提方法的比较分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、短短芽孢杆菌代谢物组测定中灭活方式的优化陈梅春，刘波基金项目：国家“973”前期项目（2011CB111607），国家“948”项目（2011-G25）作者简介：陈梅春（1985-），女，博士，助理研究员，主要从事微生物代谢组学研究通讯作者：刘波（1957-），博士,男，研究员,从事微生物生物技术与农业生物药物研究，E-mail：fzliubo@163.com，朱育菁，陈峥，史怀，刘国红，潘志针福建省农业科学院农业生物资源研究所，福建福州350003摘要：微生物代谢组学在发酵控制分析、代谢物控制分析及其它组学联用进行菌种改良等方面得到了应用，其
2、定性和定量分析细胞内外中所有低分子量代谢产物。胞内代谢物变化非常迅速，因此快速冻结代谢反应，使代谢物失活是非常重要的，必须有效率高和可靠的灭活方式，减少代谢物的流失。本研究以短短芽孢杆菌JK-2为研究对象，以LC-MS测定为评价标准，考察了五种灭活方式对胞内代谢物保留程度。结果表明，冷甲醇/水(含HEPES)灭活方法能够保留的代谢物最多，效率最高及重现性好，在LC-MS正离子模式下，能够提取出三千多种胞内代谢物。同时也考察了样品在正负模式下测试情况,结果表明正离子模式下能够检测到的代谢物的数目远远超过负离子模式下检测的数目。关键词：短短芽胞杆菌
3、、代谢组学、灭活、胞内代谢物、正负离子模式中图分类号：TheoptimizingquenchingsolutionformetaboliteanalysisofBrevibacillusbrevisCHENMei-chun,LIUBo,ZHUYu-jin,CHENZhen,SHIHuai,LIUGuo-hong,PANZhi-zhenAgriculturalBioresourcesResearchInstitute，FujianAcademyofAgriculturalSciences，Fuzhou，350003,ChinaAbstract:M
4、icrobialmetabolomicshasbeenwidelyappliedinthecontroloffermentationprocess,metabolitesanalysisandupgradingstrainscombinedwithotheromics.Microbialmetabolomicsreferstothequalitativeandquantitativeanalysisofthecompletesetofalllowmolecularweightmetabolitespresentinandaroundthecel
5、ls.Forgrowingmicroorganisms,theturnoverofintracellularmetabolitescanbeextremelyfast.Consequently,instantaneousfixationofthemetabolismduringsamplingisessential.Therefore,thedevelopmentofhighefficiencyandreliablequenchingprotocolisrequiredtopreventsignificantleakageofintracell
6、ularmetabolites.Inthispaper,fivedifferentquenchingsolutionsarepromotedtoassesstheleakageofintracellularmetabolitesbasedonLC-MSusingthecoldmethanolextractionmethod.Theresultsindicatedthatthecold-methanol/water(V:V=3:2)containingthebufferagentHEPESquenchingmethodforBrevibacill
7、usbreviscellculturesisthehighestefficiencyandreproduciblequenchingmethods,andmorethan3000intracellularmetabolitescanbedetectedunderthepositiveionESImode.TheinfluenceofthepositiveandnegativeionsESImodesarealsoinvestigatedwhichshowedthattheformercandetectmoremetabolitesthanthe
8、later.Keywords:Brevibacillusbrevis,Metabonomics,quenching,intracellularmeta
