生物化学 上部 复习提纲

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1、第一章蛋白质化学一、蛋白质的化学组成二、蛋白质的基本单位——氨基酸1、结构通式:天然蛋白质中获得的氨基酸除Gly外均属L-氨基酸。2、氨基酸的分类3、蛋白质的一般理化性质注:各种氨基酸均不吸收可见光;Phe、Tyr、Trp能显著吸收紫外光;旋光性4、氨基酸的两性性质及等电点氨基酸在水溶液或晶体状态是以两性离子形式存在,即在同一氨基酸分子上带有能放出质子的氨基正离子和能接受质子的羧基负离子的形式,因此,氨基酸是两性电解质。由此可判断氨基酸的电荷状况及在电场中的行为。在等电点时氨基酸的溶解度、导电性、粘度及渗透性都最小。氨基酸的等电点等于两性离子两侧基团pK值之和的一半。对R基团不

2、解离的中性氨基酸pI=(pK1+pK2)/2对R基团有解离的氨基酸:酸性氨基酸:pI==(pK1+pKCOOH)/2碱性氨基酸:pI==(pK2+pKNH2)/25、氨基酸的化学反应1)a-NH2参加的反应与甲醛、HNO2、酰化反应和烃化反应(DNS、DNFB、PITC)及相应的反应条件;;脱氨反应;与酸成盐的反应2)a-COOH参加的反应与碱成盐反应;与醇成酯反应;叠氮反应;脱羧反应;LiBH4反应3)a-NH2和a-COOH共同参加的反应:注意茚三酮反应4)侧链基团的反应三、肽1、肽、肽键、肽链、N端、C端、肽单位的概念2、肽键的特点3、肽的性质四、蛋白质的结构一)、构型与

3、构象的区别构型构象1、指不对称C原子上相连的各原子或取代基团的空间排布;2、其改变涉及共价键的断裂。1、指与碳原子相连的各原子或取代基团的单键旋转所造成的原子或基团在空间上的不同排布;2、不改变共价键二)蛋白质的结构层次1、蛋白质的一级结构1)一级结构的概念2)一级结构的测定程序请参见已发资料。2、蛋白质的高级结构层次1)二级结构的主要类型、各种类型的结构特点、结构稳定性因素及影响因素2)超二级结构和结构域的概念、结构特点、结构稳定性因素61)三级结构的概念、结构稳定性因素2)四级结构的概念及结构稳定性因素结构维系结构的化学键一级结构肽键、二硫键(均为共价键)二级结构主链的氢键

4、(a-螺旋为链内氢键;b-折叠为链间氢键)超二级结构结构域三级结构四级结构二硫键(共价键)侧链间次级键:氢键、离子键、疏水键、酯键、范德华力等五、蛋白质的性质1、亲水胶体性质:由于蛋白质带电荷和分子表面具水化膜2、两性性质及等电点2、蛋白质的沉淀反应:可逆性沉淀反应(盐析、pI、有机溶剂沉淀法)和不可逆沉淀反应(重金属盐沉淀、加热沉淀、生物碱沉淀等)3、蛋白质的变性(变性作用、影响变性的因素及机理、变性的特征、复性等)4、蛋白质的水解(酸、碱、酶水解,其中酶水解是重点)。5、蛋白质序列测定中酶水解与化学法水解的催化部位和限制条件;N-和C-端测定的方法及基本原理(主要:Sang

5、er法和Edmann降解法)六、蛋白质的分类七、蛋白质的分离与纯化注意:电泳的基本原理、层析法(离子交换法等)第一章核酸化学一、核酸的化学组成注意区分DNA与RNA在组成上的区别二、核酸的种类、分布及功能三、核酸的结构一)、核酸的一级结构1、概念2、核酸与蛋白质一级结构的比较区别蛋白质核酸基本结构单位二十种氨基酸4种相应的单核苷酸连接的键肽键3`,5`-磷酸二酯键链端多肽链,具C端和N端多核苷酸链,具3`端和5`端主链的组成(不变部分)由氨基N、a-C、羧基C原子反复循环组成,即-N-Ca-C-由戊糖+磷酸反复组成侧链(可变部分)二十种氨基酸残基的R基的不同排列组合四种碱基的不

6、同排列组合二)、DNA的二级结构1、DNA二级结构的的概念1)DNA碱基组成的特点——Chargaff定律61)DNA二级结构的典型结构——B-DNA双螺旋结构(Watson&Crick模型,1953年)要点2、DNA双螺旋结构与蛋白质α-螺旋的比较比较内容DNA双螺旋结构蛋白质α-螺旋结构类型核酸的二级结构蛋白质的二级结构骨架二条右旋的核苷酸链,绕同一中心轴反向平行排列;磷酸和脱氧核糖的重复一条右旋的肽链-N-Cα-C-的重复直径20Å5Å螺圈每10个核苷酸上升一圈每3.6个Aa上升一圈螺距34Å5.4Å间距及夹角核苷酸间距3.4Å沿中轴转36°氨基酸残基的间距1.5Å(5.

7、4Å/3.6Aa)沿中轴转100°稳定力碱基堆积力、氢键、离子键主链内氢键链端5`端和3`端N端和C端三)其他DNA螺旋的结构1、回文结构——DNA序列中以某一中心区域为对称轴,其两侧的碱基对顺序正读和反读都相同的双螺旋结构,即对称轴一侧的片段旋转180°后,与另一侧片段对称重复。回文结构能形成十字结构和发夹结构。镜像重复——存在于同一股上的某些DNA区段的反向重复序列,此序列各单股中没有互补序列,不能形成十字形或发夹结构。2、DNA三股螺旋(H-螺旋)当多聚嘧啶和多聚嘌呤组成的DNA螺旋区

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