武汉植物研究---甘蓝型油菜a基因组候选bac克隆的筛选及其插入片段大小分析

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1、武汉植物研究---甘蓝型油菜A基因组候选BAC克隆的筛选及其插入片段大小分析武汉植物学研究2010,28(6):660~665JournalofWuhanBotanicalResearchDOI:10.3724/SP.J.1142.2010.60660甘蓝型油菜A基因组候选BAC克隆的筛选及其插入片段大小分析王太霞,闫晓红,查敏敏,王力军,魏文辉?12122(1.河南师范大学生命科学学院,河南新乡453007;2.中国农业科学院油料作物研究所/农业部油料作物生物学重点开放实验室,武汉430062)摘要:选择甘蓝型油菜A基因组10个连锁群上特有的85个SSR分子标记,合成其引物

2、序列,采用四维PCR法筛选甘蓝型油菜-新疆野生油菜二体异附加系BAC文库,成功筛选到甘蓝型油菜A基因组39个BAC克隆,其插入片段介于50~300kb之间,平均为120kb。甘蓝型油菜A基因组10个连锁群BAC克隆的获得,对后续开展甘蓝型油菜A基因组染色体识别、基因染色体定位、遗传距离与物理距离间关系分析等均具有重要价值。关键词:甘蓝型油菜;A基因组;SSR标记;四维PCR;BAC克隆中图分类号:S565.403文献标识码:A文章编号:1000-470X(2010)06-0660-06——————————————————————————————————————————————

3、———————ScreeningandInsertSizeAnalysisofCandidateBACClonesfromBrassicanapusAGenomeWANGTai-Xia,YANXiao-Hong,ZHAMin-Min,WANGLi-Jun,WEIWen-Hui?12122(1.CollegeofLifeSciences,HenanNormalUniversity,Xinxiang,Henan453007,China;2.OilCropsResearchInstituteoftheChineseAcademyofAgriculturalSciences/KeyL

4、aboratoryofOilCropBiologyoftheMinistryofAgriculture,Wuhan430062,China)Abstract:Thirty-nineAgenomespecificBACclonesweresuccessfullyscreenedbyfour-dimensionalPCR,withtheprimersequencesofeighty-fiveSSRmarkerslocatedinthetenlinkagegroupsofBrassicanapusAgenomefromtheBAClibraryofBrassicanapus-Xin

5、jiangwildrapedisomicalienadditionline.Thethirty-ninescreenedBACcloneshadanaverageinsertsizeof120kb(range50to300kb).ThissetofBACcloneswillbeofinteresttoAgenomechromosomeidentification,genelocating,andrelationshipanalysisbetweenphysicaldistanceandgeneticdistanceinBrassicanapus.Keywords:Brassi

6、canapus;Agenome;SSRmarkers;Four-dimensionalPCR;BACclones自Landry和Hubert成功构建甘蓝型油菜第—————————————————————————————————————————————————————一张分子标记遗传连锁图以来,国内外不同实验室又分别构建了其多张遗传图谱[2?8][1]锁图上的位置相同,然而在染色体上并不等位。基因在染色体上真实位置的确定,对于深刻认识基因组结构、染色体结构及目的基因的分离等均具有重要作用。本研究从甘蓝型油菜-新疆野生油菜二体异附加系BAC(bacterialartificial

7、chro-mosome)文库中筛选到一套甘蓝型油菜A基因组十个连锁群特异的BAC克隆,对今后进行特定材,这些遗传图谱在甘蓝型油菜的基因组研究中起到了重要作用。遗传图谱是根据基因或分子标记间的重组频率确定其相对位置,与其在染色体上的真实位置并不完全相符,有许多基因或分子标记在遗传连收稿日期:2010-04-08,修回日期:2010-05-17。基金项目:国家自然科学基金面上项目(30671312)。作者简介:王太霞(1964?),女,河南新乡市人,博士,从事植物遗传与生物化学研究。?通讯作者(Author