生物信息学实验教案

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1、教案[Syllabus(teachingperiodplan)]也称课时计划。教师经过备课,以课时为单位设计的具体教学方案。教案是上课的重要依据。通常包括:班级、学科、课题、上课时间、课的类型、教学方法、教学目的、教学内容、课的进程和时间分配等。有的教案还列有教具和现代教学手段(如电影、投影、录像、录音等)的使用、作业题、板书设计和课后自我分析等项目。由于学科教材的性质、教学目的和课的类型不同,教案不必有固定的形式。编写教案要依据教学大纲和教学书。从学生实际情况出发,精心设计。一般要符合以下要求:①明确地制定教学目的,具体规定传授基础知识、培养基本技能、发展能力以及思想政治教

2、育的任务。②合理地组织教材,突出重点,解决难点,便于学生理解并掌握系统的知识。③恰当地选择和运用教学方法,调动学生学习的积极性。要面向大多数学生,同时注意培养优秀生和提高后进生,使全体学生都得到发展。编写教案的繁简,一般有经验的教师写得简略些,而新教师写得详细些。平行班用的同一课题的教案设计,根据上课班级学生的实际差异有所区别。原定教案,在上课进程中根据具体情况做适当必要的调整,课后随时记录教学效果,进行简要的自我分析,有助于积累教学经验,不断提高教学质量。(摘自《中国大百科全书》〈教育〉分册143~144页、1985年10月版)说明本教案以讲授一个单元(2~4学时)或一次实

3、验(实习)为单位填写。填写时要要用钢笔填写,字迹要清晰、工整,按表中项目逐一填写。教师要在授课前将本教案交教研室主任审阅,通过后方可授课。在学期结课后将教案交教研室存档。内蒙古民族大学教案专业年级:09生物技术学科:生物技术课程名程:生物信息学(实验)授课时间:2011年月日授课教师:教研室:生物内蒙古民族大学教务处制本次授课题目(章、节):实验一常用分子数据库的使用和数据格式教学目的:1、掌握常用的生物信息学数据库的类型2、掌握常用的分子数据库的使用方法3、掌握常用的分子数据的格式教学重点及难点:重点:常用的生物信息学数据库的类型难点:1.分子数据库的使用方法2.数据库的数

4、据格式授课内容提要及时间分配:一、常用数据库的使用1.访问国际上权威的核酸序列数据库(EMBL、GenBank、DDBJ)20min2.访问基因组数据库(GDB、AceDB等)20min3.访问蛋白质序列数据库(SWISS-PROT、TrEMBL、UniProt)20min4.访问蛋白质结构数据库(PDB、PDBsum、MMDB)20min二、数据库的格式查询(1)在Genbank中检索NM_000230,并掌握Genbank格式和FASTA格式。20min(2)在EMBL(http://www.ebi.ac.uk/cgi-bin/dbfetch)检索U18915,比较这个数

5、据库格式和Genbank格式有何异同。20min(3)将获得的SWISS-PROTid号在SWISS-PROT数据库中检索,获得Entryinformation相关信息。10min(4)将获得的PDBid号在PDB数据库中检索,获得Title,Authors,PrimaryCitation等相关信息。查看该PDB文件,并下载用RasMol打开,观察不同的模式下的分子结构。30min(5)将获得PDBid号在MMDB数据库检索,获得Reference,Description,MMDBid号等相关信息。下载该文件,用Cn3D打开,观察不同的模式下的分子结构。30min三、写实验报

6、告,答疑10min教学方法:计算机上网操作教具(挂图、幻灯、录像、标本……等):计算机、RasMol、Cn3D软件作业或思考题:1.详细分析NM_000230(或U18915)记录号Genbank格式和FASTA格式的各项内容。2.比较分析一下,Genbank和EMBL格式有何异同。3.记录在GDB、SWISS-PROT和MMDB数据库中获得的信息。本单元教学总结(教学的主要经验效果、存在问题、措施、反馈信息等):教研室主任意见:签字年月日院校教学管理部门抽查意见:签字年月日教案[Syllabus(teachingperiodplan)]也称课时计划。教师经过备课,以课时为单

7、位设计的具体教学方案。教案是上课的重要依据。通常包括:班级、学科、课题、上课时间、课的类型、教学方法、教学目的、教学内容、课的进程和时间分配等。有的教案还列有教具和现代教学手段(如电影、投影、录像、录音等)的使用、作业题、板书设计和课后自我分析等项目。由于学科教材的性质、教学目的和课的类型不同,教案不必有固定的形式。编写教案要依据教学大纲和教学书。从学生实际情况出发,精心设计。一般要符合以下要求:①明确地制定教学目的,具体规定传授基础知识、培养基本技能、发展能力以及思想政治教育的任务。②合理地组织教材,

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