用xp软件画图(晶体结构解析用)

《用xp软件画图(晶体结构解析用)》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。

1、椭圆球图形的画法：1．将后缀为res的文件（比如为50710c.res）复制到硬盘根目录下（比如E：盘）2．启动单晶分析软件XP3．XP>>reade:50710c¿4．XP>>fmol¿5．XP>>kill$q¿6．XP>>proj¿出现画图框，你可以按右上的按钮旋转或显示所有的原子。将分子结构旋转到适当位置，也就是旋转的尽可能使每个原子都不被挡住。当旋转到适当位置后按右上角的exit退出7．XP>>labl1450¿8．XP>>telp0-30¿回车至现plorfile:的提示符9．plot

2、file:mol¿mol是为你所要画的分子结构图起的名字，你也可以起别的名字。注意：当你按了回车后会进入画图界面，这时候鼠标已经变成了一个矩形框。将矩形框移动到显示的原子边上合适位置后点击鼠标左键，就对该原子标注了它的顺序。鼠标在你标注了第一个原子后会自动移到下一个要标注的原子上或旁边，你仍将矩形框移动到合适位置后按鼠标左键进行标注。重复以上的操作，直至将全部原子标注完毕。然后按键盘上的b键保存后自动退出到XP程序的dos操作界面10．XP>>drawmol¿mol还是刚才的文件名11．当你上步操

3、作按完回车后会出现一句话，可能的意思是：将该图形保存成什么格式的文件，有几个选项。请选择按键盘上的a键（可能是保存成可用acrobat打开的文件），然后回车12．为你的图形取一个名字，你可以仍用mol13．上步回车后又会出现一句话，意思是要保存为黑白图形还是彩色图形。按回车即保存成黑白图形，请按回车。以上就画好了分子结构图。你可以在这时候推出XP，即在XP>>提示符后输入quit或exit。你也可以继续画堆积图。14．XP>>cell¿回车后会出现5个数字，前3个数字依次表示的是a、b、c轴。15

4、．XP>>matr1¿这里matr命令后的数字代表上一步显示的前3个数字中的第一个。这个数字的选择要依照这样的规则：选取3个数字中最小的那个，而matr后的数字就是上步操作的最小数字所在的顺序号。比如上步操作最小的数字是第三个，则应该是matr3。如果你选择的是1，那么在提交给晶体学报网站的cif文件中的Figure2的表述里就应该说是“Figure2.Partofthepackingofthetitlecompound,vieweddowntheadirection.Dashedlinesind

5、icatehydrogenbonds.”如果你选择的是2，则应该是vieweddownthebdirection。16．XP>>pack¿当回车后会进入画图界面。这是要让你确定哪些分子是要保留的，而哪些分子是要删除掉的。一般来将在坐标框以外，同坐标框根本不沾边的要删除掉。删除和保留的方法是：先按回车，会看到坐标框在闪动，然后按键盘上的空格键保留所闪动的坐标框或分子，而按回车键则删除闪动的分子。等全部分子都处理完后，用窗口右上角的SG标示保存退出17．XP>>telpcell¿这是要画堆积图（Fig

6、2）的意思18．profile:cell¿这里的cell是为堆积图文件起的名字，你也可以用另外的名字。19．XP>>drawcell¿20．当你上步操作按完回车后会出现一句话，意思是：将该图形保存成什么格式的文件，有几个选项。请选择按键盘上的a键（是保存成可用acrobat打开的文件），然后回车21．为你的图形取一个名字，你可以仍用cell22．上步回车后又会出现一句话，意思是要保存为黑白图形还是彩色图形。按回车即保存成黑白图形，请按回车。等一会儿堆积图就画完了。()双击画好的cell图，用pdf

7、软件打开，既得到所要的图，以PDF形式保存即可（最好用这种形式保存）。也可用photoshop打开cell文件，修改到适当的旋转角度后保存为photoshop(*.PSD;*PDD)这样的文件小很多。计算二面角readE:\50710C(回车)(即需要将所有的源文件先拷贝到E盘的根目录下)（read和reap效果一样）fmol(回车)kill$q(回车)proj(回车给出分子结构图及原子排序的序列号)mplnn1c1c6c5c4c3c2c8c9c10c11c12c7(回车计算二面角)mplnc1

8、toc6(回车计算c1到c6组成的平面与上个平面间的二面角)mplnc7toc12(回车计算c7到c12组成的平面与上个平面c1到c6组成的平面之间的二面角）如果计算一条直线c13c14和c1到c6组成的平面之间的二面角，则为mplnc7toc12(回车）linec13c14(回车）即可得到二者之间的二面角计算两条直线的角度及长度：如计算氢键的C15A-H15A---O1B的角度核长度：linkc15ah15a，linkh15ao1b，bangh15a（回车），得到H15AC15A