2013年最新生化讲义归纳

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1、生化期末考试纲要▲▲第二章蛋白质化学三氨基酸的结构特点及分类1.根据R的化学结构(1)脂肪族氨基酸:Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Met、Cys;Arg、Lys、Asp、Glu、Asn、Gln、Ser、Thr(2)芳香族氨基酸:Phe、Tyr(3)杂环氨基酸:Trp、His(4)杂环亚氨基酸:Pro2.根据R的极性(1)非极性氨基酸:Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Phe、Met、Pro、Trp(2)极性氨基酸:1)不带电:Ser、Thr、Asn、Gln、Tyr、Cys;2)带正电:His、Lys、Arg;3)带负电:As

2、p、Glu四两性解离和等电点氨基酸在水溶液中或在晶体状态时都以离子形式存在,在同一个氨基酸分子上带有能放出质子的—NH3+正离子和能接受质子的—COO-负离子,为两性电解质。实验证明氨基酸在水溶液中或固体状态时是以两性离子(dipolarion)形式存在的。所谓两性离子是指在同一个氨基酸分子上带有等量的正负两种电荷,由于正负电荷相互中和而呈电中性,这种形式又称兼性离子(zwitterions)或偶极离子。调节氨基酸溶液的pH,使氨基酸分子上的—NH3+基和—COO-基的解离程度完全相等时,即所带净电荷为零,此时氨基酸所处溶液的pH值称为该氨

3、基酸的等电点(pI)。等电点的含义定义:当氨基酸在其某一PH值时,氨基酸所带正电荷和负电荷相等,即净电荷为零,此时的PH值成为氨基酸的等电点,用PI表示。氨基酸在等电点时主要以偶极离子形式存在氨基酸等电点的特点:v净电荷数等于零,在电场中不移动;v此时氨基酸的溶解度最小氨基酸等电点在生化中的应用:通过电泳法或离子交换法将氨基酸进行分离制备.氨基酸等电点的确定:1、酸碱滴定2、根据pK值(即解离常数的负对数)计算:等电点等于两性离子两侧pK值的算术平均数。对于含有三个可解离基团的氨基酸来说,只要依次写出它从酸性经过中性至碱性溶液解离过程的各种

4、离子形式,然后取两性离子两侧的pK值的平均值,即可求出其pI。由此可见,氨基酸的等电点相当于该氨基酸的两性离子状态两侧的基团pK值之和的一半,根据此原则可求出任何一种氨基酸的等电点。五、蛋白质的高级结构指蛋白质分子中所有原子在三维空间的排列分布和肽链的走向。由于羰基碳-氧双键的靠拢,允许存在共振结构(resonancestructure),碳与氮之间的肽键有部分双键性质,由-CO-NH构成的肽单元呈现相对的刚性和平面化,肽键中的4个原子和它相邻的两个α-碳原子多处于同一个平面上。氨基的H与羰基的O几乎总是呈反式(trans)而不是顺式(ci

5、s)。蛋白质构象稳定的原因:1)酰胺平面;2)R的影响。1.蛋白质的二级结构——指蛋白质多肽链本身的折叠和盘绕方式(1)α-螺旋(α-helix)结构要点:1)螺旋的每圈有3.6个氨基酸,螺旋间距离为0.54nm,每个残基沿轴旋转1002)每个肽键的羰基氧与远在第四个氨基酸氨基上的氢形成氢键(hydrogenbond),氢键的走向平行于螺旋轴,所有肽键都能参与链内氢键的形成。(2)β-折叠结构(β-pleatedsheet)是一种肽链相当伸展的结构。肽链按层排列,依靠相邻肽链上的羰基和氨基形成的氢键维持结构的稳定性。肽键的平面性使多肽折叠成

6、片,氨基酸侧链伸展在折叠片的上面和下面β-折叠片中,相邻多肽链平行或反平行(较稳定)。(3)β-转角(β-turn)为了紧紧折叠成紧密的球蛋白,多肽链常常反转方向,成发夹形状。一个氨基酸的羰基氧以氢键结合到相距的第四个氨基酸的氨基氢上。β-转角经常出现在连接反平行β-折叠片的端头。(4)不规则卷曲2.超二级结构和结构域超二级结构是指若干相邻的二级结构中的构象单元彼此相互作用,形成有规则的,在空间上能辨认的二级结构组合体。是蛋白质二级结构至三级结构层次的一种过渡态构象层次。结构域是球状蛋白质的折叠单位。多肽链在超二级结构的基础上进一步绕曲折叠

7、成紧密的近似球行的结构,具有部分生物功能。对于较大的蛋白质分子或亚基,多肽链往往由两个以上结构域缔合而成三级结构。3.蛋白质的三级结构蛋白质的三级结构(TertiaryStructure)是指在二级结构基础上,肽链的不同区段的侧链基团相互作用在空间进一步盘绕、折叠形成的包括主链和侧链构象在内的特征三维结构。维系这种特定结构的力主要有氢键、疏水键、离子键和范德华力等。尤其是疏水相互作用,在蛋白质三级结构中起着重要作用。3、蛋白质的四级结构蛋白质的四级结构(QuaternaryStructure)是指由多条各自具有一、二、三级结构的肽链通过非共

8、价键连接起来的结构形式,即各个亚基在这些蛋白质中的空间排列方式及亚基之间的相互作用关系。这种蛋白质分子中,最小的单位通常称为亚基或亚单位Subunit,它一般由一条肽链构成,无生

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