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时间:2018-07-19
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1、多聚酶链式反应(PCR)扩增DNA片段及琼脂糖凝胶电泳产物检测一、实验目的:1、了解PCR技术的基本操作2、理解PCR的原理3、讨论PCR的应用二、实验原理:PCR是一种在体外模拟细胞内环境进行迅速扩增DNA片段的技术,这一技术需要模板、四种脱氧核苷酸等组分条件外,还需要不同温度环境以进行DNA的解旋和聚1、PCR反应组分细胞内DNA复制条件分析:条件参与的组分在DNA复制中的作用实验条件/材料模板DNA的两条单链提供复制的模板模板DNA原料四种脱氧核苷酸合成DNA子链的原料dNTPmixture酶DNA聚合酶催
2、化合成DNA子链TaqDNA聚合酶酶解旋酶打开DNA双链温度控制引物一小段单链DNA或RNA为DNA聚合酶提供合成的3’端起点引物I引物II此外,试验中用到的还有Mgcl2,Mg2+能激活酶的活性;10*Buffer缓冲液,为Taq酶提供合适的PH条件。2、PCR反应条件PCR利用了DNA的热变性原理,通过控制温度来控制双链的解聚与结合,现在使用的PCR仪实质上也是一台能够自动调控温度的仪器。PCR一般经历三十多次循环,每次循环可以分为三个基本步骤──变性、复性和延伸。(!)变性(模板DNA解旋)模板DNA经加热
3、至90℃以上。一定时间后,使模板DNA双链解离,使成为单链,以便于它与引物结合,为下轮反应作准备。(2)复性(退火)模板DNA经加热变性成单链后,温度降到50℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合。(3)延伸DNA模板-引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下以脱氧核苷酸为原料,以母链为模板,按碱基互补配对的原则与半保留复制的原理,合成一条新的DNA链。循环数变性复性延伸第一次(预变性)94°C,30s--30次94℃,20s52℃,20s72℃,20s最后一次(保温)72℃,30s3、PCR产物的检测(1
4、)紫外分光光度计DNA在260nm的紫外波段有一强烈的吸收峰,可以通过与蒸馏水的对比进而计算扩增出DNA的含量。(2)琼脂糖凝胶电泳DNA在电厂作用下,可以由电源的负极向正极泳动,泳动的速度与DNA片段的长度成负相关,与电压强度成正比,因此可以分离不同长度的DNA。在有DNAmarker(不同已知碱基对大小的DNA片段的混合物)的条件下,由于不同碱基大小的DNA片段在琼脂糖凝胶上涌动的速度不同,因此电泳完毕后会出现在胶块的不同位置。通过将扩增出的DNA片段与已知的条带做比较,可以大概推测出该片段的碱基对的大小。如
5、果要进一步检测其大小,可以换另外规格的DNAmarker继续电泳。核酸荧光染料可以与DNA嵌合,一起电泳,DNA图谱观察仪可以激发特定的蓝色光源,荧光染料在该光照射下可见到荧光,荧光的亮度与DNA大小成正比。三、实验仪器及试剂7种PCR组分微量可调移液器离心管PCR仪水平电泳槽电泳仪电源紫外分光光度计250ml锥形瓶(封口膜)记号笔卫生纸四、实验步骤1、DNA体外扩增(1)将所有试剂管瞬时离心一次(4000r/min,1min),使管壁没有残留药品,在引物I和引物II的离心管内用移液器各加入40ul双蒸水(ddH
6、2O),混匀后瞬时离心一次。所有的离心管都摆到双面板上。(2)向装有TaqDNA聚合酶的离心管按下表加入以下成分:10xBuffer50μLMgCl250μLdNTPmixture20μL上游引物(引物I)25μL下游引物(引物II)25μL模板DNA25μLddH2O290μL原有的TaqDNA聚合酶有15ul,此时混合液体系共计500ul,此步骤由第一、二组同学合作完成。(在实验老师的监督指导下操作,确保此后其他同学的实验顺利进行)(3)共分25组,第一、二组的同学并入其他小组进行实验。每组取20ul的上述混
7、合液于0.5ml的离心管中,加入15ul的液体石蜡封闭体系,以防止在加热过程中蒸发。(4)对自己组的离心管上进行标记之后,放到PCR仪上进行DNA扩增。2、琼脂糖凝胶电泳检测DNA(1)用蒸馏水将电泳槽和梳子冲洗干净,放在水平桌面上,并架好梳子。(2)配制浓度为1%(1g/100mL)的琼脂糖凝胶2块。在锥形瓶中,称取1g的琼脂糖粉,加入100ml1x电泳缓冲液,用封口膜封住瓶口后在微波炉内加热,使琼脂糖粉熔化,然后冷却至60℃,倒入电泳槽中(每块胶50ml),插好梳子,待其凝固。(电泳槽首先用透明胶带将两端封住
8、再进行倒胶)(3)待胶凝固后,去掉胶带纸,小心移去梳子,注意不要破坏加样孔。将倒胶槽至于水平电泳槽内,梳井(点样孔)一端朝负极方向。向电泳槽中缓缓倒入1x电泳缓冲液,以没过胶面2mm为宜。(5)将80ul的6xLoadingBuffer加入到80ul的核酸荧光染料中,按1:1比例混合。(6)移液器枪头插入到扩增出的样品离心管的底部,吸取20ul样品于另一0.5ml的离心管
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