不同土壤dna提取和纯化试剂盒及方法的比较学号

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1、内蒙古大学本科毕业论文(设计)学校代码学号分类号密级本科毕业论文不同土壤DNA提取和纯化试剂盒及方法的比较学院、系环境与资源学院专业名称环境科学年级2010级学生姓名指导教师2014年5月内蒙古大学本科毕业论文(设计)不同土壤DNA提取和纯化试剂盒及方法的比较摘要环境样品DNA的提取和纯化不仅是土壤微生物进行研究的前提条件,而且是环境宏基因组学中最关键的技术问题之一,DNA的产量和纯度对后续的一系列的分子生物学技术操作如:多聚酶链反应(PCR)扩增、核酸内切酶酶切消化、核酸分子杂交等等,都会产生很大

2、的影响,所以后续试验有效进行,必须要先获得一定纯度、数量、有较好代表性和适当片段长度的DNA。本文针对三种典型的土壤类型(壤土、粘土和沙土),对目前应用比较广泛的三种不同的DNA提取方法和四种不同的DNA纯化方法的效果进行了比较。经过NanoDrop分光光度计和琼脂糖凝胶电泳对从三种典型土壤中提取和纯化的DNA的浓度和纯度进行检测,结果表明:PowerSoil®DNA提取试剂盒和苯酚-氯仿抽提,异丙醇沉淀纯化方法的结合能提供满足环境组学研究的宏基因组测序要求的DNA。关键词:土壤微生物,DNA,提取

3、,纯化内蒙古大学本科毕业论文(设计)ComparisonofDNAextractionandpurificationmethodsfromdifferentsoilsAbstractTheextractionandpurificationofDNAfromenvironmentalsamplesisnotonlyaprerequisiteformicrobialresearch,andisoneoftheenvironmentalmetagenomicsmostcriticaltechnicalis

4、sues,theyieldandpurityofDNAonthesubsequentseriesofmolecularbiologytechniquesoperatesuchas:polymerasechainreaction(PCR)amplification,restrictionenzymedigestion,thenucleicacidhybridization,etc.willhaveahugeimpact,iffollow-uptestseffectively,youmustfirsto

5、btainacertainpurity,quantity,betterDNAfragmentsrepresentativeandappropriatelength.Inthispaper,wehavecomparedseveraldifferentmethodsofDNAextractionandpurificationforthreedifferentsoil,loam,sandyclay.AfteraNanoDropspectrophotometerandbyagarosegelelectrop

6、horesisandpurifiedfromtheextractofthesoilofthreeDNAconcentrationandpurity,andtheresultsshowedthat:PowerSoil®DNAextractionkitandphenol-chloroformextractionandisopropanolprecipitationpurificationmethods'combinedprovidestherightDNAforthestudyofenvironment

7、algroupsmetagenomicsequencing.Keywords:Microbialsoil,DNA,Extraction,Purification内蒙古大学本科毕业论文(设计)目录1.绪论11.1研究背景11.2国内外研究进展21.3本文研究意义42.DNA的提取方法和纯化方法52.1土壤样品52.2DNA提取方法的比较52.2.1原位裂解法52.2.2PowerSoil®DNA提取试剂盒(MoBio)62.2.3Meta-G-NomeDNA提取试剂盒(Illumina)72.3DNA

8、纯化方法的比较72.3.1QIAEXIIGel纯化试剂盒82.3.2PowerCleanDNAClean-UpKit(MoBio)82.3.3TheAgencourtAMPureXPPCRPurificationsystem92.3.4苯酚/氯仿抽提和异丙醇沉淀92.4DNA纯度与浓度的检测103.结果与讨论113.1DNA提取方法的比较结果113.2DNA纯化方法的比较结果11结论14致谢15参考文献16第18页内蒙古大学本科毕业论文(设计)不同土壤DNA提取和纯化

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