噬菌体展示技术操作步骤

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1、筛选多肽试剂及配制(1)LB培养基:胰蛋白胨10g酵母提取物5gNaCl5g溶于去离子水,至1L,高压灭菌,4℃保存。(2)IPTG/Xgal:称取1.25gIPTG,1.0gXgal,溶于二甲基甲酰胺,至总体积25ml,-20℃避光保存。(3)LB/IPTG/Xgal平板:1LLB培养基+15g琼脂粉,高压灭菌,冷却至70℃以下,加入1mlIPTG/Xgal,立即铺板,4℃避光保存。(4)顶层琼脂糖凝胶:胰蛋白胨10g酵母提取物5gNaCl5gMgCl2.6H2O1g琼脂糖7g溶于适量去离子水中,至总体积为1L。高压灭菌,分装为

2、50ml/份,室温保存,使用时于微波炉内融化。(5)2×M9盐:Na2HPO412gKH2PO46gNaCl1gNH4Cl2g溶于适量去离子水中,至终体积为1L。(6)小型平板:500ml2×M9盐500ml3%琼脂粉20ml20%葡萄糖2ml1MMgSO40.1ml1MCaCl21ml硫胺素(10mg/ml)在混合之前,将上述成分分别高压灭菌并冷却至70℃以下,葡萄糖和硫胺素采用过滤除菌。平板储存于4℃。(7)封闭缓冲液:0.1MNaHCO3(PH8.6)5mg/mlBSA0.02%NaN3过滤除菌,储存于4℃。(8)TBS:5

3、0mMTris-HCl(PH7.5)150mMNaCl高压灭菌,室温储存。(9)PEG/NaCl:20%(w/v)聚乙二醇-80002.5MNaCl高压灭菌,室温储存。(10)碘化物缓冲液:10mMTris-HCl(PH8.0)1mMEDTA4MNaI室温避光保存。操作步骤:1.第一天(1)以0.1MNaHCO3(PH8.6)制备100μg/ml的靶分子溶液。如果需要稳定靶分子,可以用含有金属离子的相似离子强度缓冲液。(2)在每孔内加入1.5ml靶分子溶液,重复涡旋直至表面完全湿润(这一步要多注意,尽量避免溶液形成液珠)。(3)在

4、湿盒中,4℃温和振荡孵育过夜。4℃保存于湿盒中备用。2.第二天(4)将ER2537(滴度测定时用来铺板的细菌培养物)接种至10mlLB培养基中。如果是在同一天扩增洗脱的噬菌体,也可以将ER2537过夜培养物接种于含有20mlLB培养基的250ml锥形瓶中(比例为1:100)。37℃剧烈振摇。(5)将平皿反扣在洁净的纸巾上,去除包被液,加满封闭液,4℃孵育至少1h。(6)去除包被液。用TBST(TBS+0.1%Tween-20)快速洗涤6次。反复旋转确保孔底及孔侧面都被洗涤。按照步骤5的方法去除洗涤液(也可利用自动洗板机洗涤)。洗涤

5、要迅速,避免平皿干燥。(注意每次更换纸巾,以避免交叉污染)。(7)用1mlTBST稀释4×1010噬菌体(10μl原库),加至包被后的平皿内,室温下轻缓摇动10-60min。(8)以步骤5的方法去除未结合的噬菌体。(9)以步骤6的方法用TBST洗涤板子10次,每次换用洁净的纸巾,避免交叉污染。(10)用1ml的洗脱缓冲液洗脱结合的噬菌体。洗脱液可以是含有配体(0.1-1mM)的TBS,或是含有靶蛋白(100μg/ml)的TBS以和固化在平皿上的靶蛋白竞争结合噬菌体。室温下轻缓摇动10-60min。将洗脱液转入微量离心管中。(10a

6、)或使用通用缓冲液,0.2M甘氨酸-盐酸(PH2.2),1mg/mlBSA。轻缓摇动不超过10min,将洗脱液转入微量离心管中,以150μl1MTris-HCl(PH9.1)中和。(11)取小量洗脱液(1μl)测定滴度,如果有必要,可将第一轮或第二轮测定滴度的噬斑进行测序(见后续操作)。(未用的洗脱物可4℃保存过夜,第二天进行扩增。在这种情况下,用LB过夜培养ER2537,第二天,用LB培养基以1:100将该培养物稀释至20ml,加入未扩增的洗脱液,在250ml的锥形瓶内,37℃剧烈振摇孵育4.5h,进入步骤13)。(12)将剩余

7、的洗脱物进行扩增:将洗脱物加入20mlER2537培养物中(对数早期),37℃剧烈振摇孵育4.5h。(13)将培养物转入微量离心管中,4℃,10000转离心10min,将上清转入新的离心管中,再次离心。(14)将80%的上清转入新的离心管中,加入1/6体积的PEG/NaCl。4℃沉淀噬菌体至少60min或过夜。1.第三天(15)4℃,10000转离心PEG的沉淀物15min,倾去上清,再次离心,吸去多余的上清。(16)用1mlTBS悬浮沉淀物并转入微量离心管中,4℃离心5min使残留的细胞沉淀。(17)将上清转入新的离心管中,用1

8、/6体积的PEG/NaCl再次进行沉淀,冰上孵育15-60min。4℃离心10min,弃上清,再次短暂离心,用微量枪头吸去残留的上清。(18)用200μlTBS,0.02%NaN3悬浮沉淀物,离心1min,将上清转入新管中,即为扩增的洗脱液。(19

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