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《铜绿假单胞菌随机扩增多态性dna指纹法基因分型研究》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、铜绿假单胞菌随机扩增多态性指纹法基因分型研究郭永建朱忠勇DNA摘要建立了铜绿假单胞菌(PA)随机扩增多态性DNA(RAPD)指纹图基因分型方法,并应用于流行病学相关或不相关的75个PA菌株的基因分型。分型率为100%。32株新生儿暴发感染菌株,可分成4个血清型和5个RAPD谱型,其中25株属于同一谱型。在8例患者的垂直追踪菌株中,除有1例其第1和第3个分离株的血清型和RAPD谱型均相同,但与第2个分离株的血清型和RAPD谱型不同外,其余7例前后菌株的谱型相同。13株散发菌株可分成3个血清型和10个RAPD谱型;12株流行病学无关菌株的
2、RAPD谱型均不相同。本研究结果表明,RAPD指纹图基因分型法具有分型率高、分辨力强、比较快速简便等优点,并且不需要已知核酸序列,是在分子水平上对微生物感染的病原学、发病机理及流行病学研究的较理想的方法。主题词指纹图基因分型铜绿假单胞菌GenotypingofPseudomonasaeruginosabyrandomlyamplifiedpolymorphicDNAfingerprintingGuoYongjian3,ZhuZhongyong.3DepartmentofClinicalMicrobiology,FujianMedica
3、lUniversity,Fuzhou350004AbstractRandomlyamplifiedpolymorphicDNAfingerprintingwasestablishedandusedtotype75epidemiologicalrelatedorunrelatedstrainsofPseudomonasaeruginosa.Typeabilitywas100%.Thir2ty2twoepidemicstrainsfromthenewbornsweredividedinto4serotypesand5RAPDprofile
4、s;amongwhich25strainshadasameprofile.ThefirstandthethirdisolatefrompatientCwerethesamebothinserotypeandRAPDprofile,butdifferentfromthesecondonebothinserotypeandRAPDprofile.Thefollow2upstrainsfromeachof7otherpatientshadasameprofile.Thirteensporadicisolatesweredivid2edint
5、o3serotypesand10RAPDprofiles.TwelveepidemiologicalunrelatedstrainsweredistinguishableeachotherinRAPDprofiles.TheresultsshowedthatRAPDfingerprintgenotypingissuitableforstud2iesontheetiology,pathogenesisandepidemiologyofmicrobeinfectionatmolecularlevelwithhighty2peability
6、,powerfuldiscrimination,rapidnessandsimplicity.SubjectwordsFingerprintGenotypingPseudomonasaeruginosa高分辨力和广泛适用的快速细菌学分型方法,是感染性疾病病原学和流行病学的极为有用的研究工具。传统的细菌表型分型技术存在许多不足之处,应用受限。近年来,发展了一些分子生物学的方法,从基因水平研究菌株间的差异,建立了一些具有广泛应用前景的细菌基因分型技术。最近,由Welsh和McClelland〔1〕以及Willams等〔2〕同时创立的随机扩
7、增DNA多态性分析(randomlyamplifiedpolymorphicDNAanalysis,RAPD,又称随机引物多聚酶链反应,arbitraryprimerpolymerasechainreac2tion,AP2PCR),经国外一些学者证实,是一项应用广泛、分辨力高、技术操作比较简便的快速分型方法〔3,4〕。本研究摸索了RAPD的最佳实验条件,建立了铜绿假单胞菌(Pseudomonas本课题受福建省卫生厅科学基金资助(项目编号94102)作者单位:350004福州,福建医科大学临床微生物学教研室(郭永建);南京军区福州总医院
8、全军医学检验中心(朱忠勇)aeruginosa,PA)的RAPD基因分型方法,并应渐减弱。MgCl2浓度在410～415mmolƒL和短的片段均能得到很好扩增(图1)。时,长用于临床PA菌株的基因分型。现报道如下。材料与
