中国黄牛亲缘关系分析

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1、综合实验：中国黄牛mtDNAcytb基因进化分析中国黄牛mtDNAcytb基因进化分析报告题目中国黄牛mtDNAcytb基因进化分析作者姓名占晶班级学号0802/2008114010241指导教师张润锋完成时间2010年12月生物学实验教学中心2综合实验：中国黄牛mtDNAcytb基因进化分析目录引言11实验材料42实验方法42.1血样采集和DNA样品制备52.2PCR引物62.3PCR反应和PCR产物检测72.4PCR产物回收测序82.5数据分析与结果处理83结果与分析103.1中国黄牛基因组DNA提取结果。103.2中

2、国黄牛mtDNAcytB基因PCR扩增结果。113.3中国黄牛mtDNAcytB基因序列分析结果。163.4中国黄牛mtDNAcytB分子进化分析，进化树的构建。17总结18参考文献182综合实验：中国黄牛mtDNAcytb基因进化分析中国黄牛mtDNAcytb基因分子进化分析占晶（指导老师：张润锋）（湖北师范学院生命科学学院生物科学0802班湖北黄石435002）摘要：利用分子生物学方法，结合生物信息学技术，利用线粒体基因序列分析中国黄牛的亲缘关系及起源进化。中国家牛多元说虽然在国内外得到公认，然而黄牛品种也同样面临着遗

3、传资源的保护问题，因此，尽快从分子水平对我国固有黄牛品种的亲缘关系及起源进化进行研究十分重要。测定了秦岭以北秦川牛、渤海黑牛、蒙古牛、鲁西牛以及秦岭以南宣汉牛、闽南牛、南阳牛七个品种牛与V00654牛线粒体DNA细胞色素b基因片段，其中18个位点检出变异，分析其碱基组成和变异情况，并以V00654牛为标准，应用DnaSPVersion3.5软件[214]分析所有序列的变异(多态)位点、应用MEGAversion4.1软件计算品种内和品种之间基于Kimura’stwo-parameter的平均遗传距离和应用MEGAversi

4、on4.1软件构建所有单倍型基于Kimura’stwo-parameter的平均遗传距离的NJ以及UPGMA分子系统进化树，在分子水平从母系遗传的角度澄清7个黄牛品种的起源分化关系。结果显示，V00654牛与南阳牛和闽南牛亲缘关系最近，与宣汉牛关系较近，与鲁西牛关系较远。秦川牛、渤海黑牛、蒙古牛这三个种群为亲缘关系较近。2综合实验：中国黄牛mtDNAcytb基因进化分析关键词：黄牛线粒体细胞色素BDNA进化ChineseoxmtDNAcytbgeneevolutionanalysis    zhanjing  （Tutor

5、：Zhangrunfeng）（CollegeofLifeSciences,HubeiNormalUniversity, Huangshi,435002）Abstract:Usingmolecularbiologicalmethods,combinedwithbioinformatics,theuseofmitochondrialDNAsequenceanalysisandgeneticrelationshipofChinesecattleoriginandevolution.Cattlemultiplecountriesr

6、ecognizedthatwhileathomeandabroad,butalsofacedcattlebreedsintheprotectionofgeneticresources,soassoonaspossibleatthemolecularlevelinherentincattlebreedsinChinaandtheoriginofthegeneticrelationshipisveryimportanttostudyevolution.DeterminationoftheQinlingMountainsnort

7、hofthecattle,BohaiBlack,Mongolianbeef,cattle,andcattleXuanhansouthoftheQinlingMountains,southerncattle,sevenvarietiesofNanyangcattlebeefcattleandV00654mitochondrialDNAcytochromebgenefragments,18ofwhichsitesofmutationdetectiontoanalyzethebasecompositionandvariation

8、,andV00654cattlestandard,applicationDnaSPVersion3.5software[214]analysisofallsequencevariation(polymorphism)sites,applicationMEGAversion4.1progarmcalcul