正文描述:《甘蔗s-腺苷甲硫氨酸合成酶基因(scsam)的克隆及表达》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、作物学报ACTAAGRONOMICASINICA2014,40(6):1002−1010http://zwxb.chinacrops.org/ISSN0496-3490;CODENTSHPA9E-mail:xbzw@chinajournal.net.cnDOI:10.3724/SP.J.1006.2014.01002甘蔗S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因(ScSAM)的克隆及表达1221,2,*1,2,*宋修鹏张保青黄杏杨丽涛李杨瑞12广西大学农学院/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,广西南宁530004;广西农业科学院/中国农业科学院甘蔗研究中心/农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良
2、重点实验室/广西甘蔗遗传改良重点实验室,广西南宁530007摘要:利用RT-PCR和RACE技术从甘蔗品种新台糖22(ROC22)中克隆获得SAM基因的cDNA序列,命名为ScSAM,GenBank登录号为KC172558。用生物信息学方法预测分析其序列,cDNA全长1466bp,含有1个1191bp的完整开放阅读框(ORF),编码396个氨基酸,与高粱和玉米等植物的SAM蛋白有很高的相似性。系统进化树分析显示,甘蔗ScSAM与高粱的SAM蛋白亲缘关系较近。Real-timePCR分析表明ScSAM为组成型表达,在根中的表达量最高,是叶中表达量的3.6倍。其在黑穗病菌胁迫和低温(4℃
3、)、聚乙二醇(PEG)、NaCl非生物胁迫下均被诱导表达,但表达模式不同;在H2O2胁迫下其表达被抑制。推测其可能参与甘蔗抗黑穗病过程,且在甘蔗抗寒、抗旱、抗盐和抗氧化等胁迫过程中也起某种作用。关键词:甘蔗;S-腺苷甲硫氨酸合成酶;克隆;表达分析CloningandExpressionofSugarcaneS-adenosylmethionineSynthetaseGeneScSAM1221,2,*1,2,*SONGXiu-Peng,ZHANGBao-Qing,HUANGXing,YANGLi-Tao,andLIYang-Rui1AgriculturalCollege/StateKe
4、yLaboratoryofConservationandUtilizationofSubtropicalAgro-bioresources,GuangxiUniversity,Nanning530004,2China;GuangxiAcademyofAgriculturalSciences/SugarcaneResearchCenter,ChineseAcademyofAgriculturalSciences/KeyLaboratoryofSugarcaneBiotechnologyandGeneticImprovement(Guangxi),MinistryofAgricultur
5、e/GuangxiKeyLaboratoryofSugarcaneGeneticImprove-ment,Nanning530007,ChinaAbstract:Thefull-lengthsequencecDNAofScSAM(GenBankaccessionnumber:KC172558)wasclonedfromsugarcanevari-etyROC22usingRT-PCRcombinedwithRACEtechniques.Thissequenceconsistsof1466bpwithanintactopenreadingframeof1191bp,encodingap
6、olypeptideof396aminoacids.HomologyanalysisshowedthatthededucedScSAMproteinwashighlyhomologoustoSAMproteinsfromdifferentspecies.PhylogeneticanalysisindicatedthatScSAMwascloselyrelatedtotheSAMofsorghum.Real-timePCRresultsshowedthattheScSAMgeneconstitutivelyexpressedinplant,withdifferentexpression
7、levelsinroot,stalkandleaf.ThetranscriptofScSAMinrootwasthehighestamongthethreeorgans,whichwas3.6timeshigherthanthatinleaf.Furthermore,ScSAMtranscriptionwasinducedbybiotic(smutinfection)andabiotic(lowtemperature,PEGandNaCl)stresses
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