基于microrna深度测序的猕猴桃性别分化初探

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1、园艺学报，2015，42(7)：1260–1272.ActaHorticulturaeSinica1260doi：10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0166；http：//www.ahs.ac.cn基于microRNA深度测序的猕猴桃性别分化初探1,23111,*闫明科，徐强，刘春燕，张琼，姚小洪12（中国科学院武汉植物园，中国科学院种质创新与特色农业重点实验室，武汉430074；中国科学院大学，北京3100049；上饶职业技术学院，江西上饶334109）摘要：利用新一代高通量测序技术，对猕猴桃雌花和雄花中表达的小RNA进行了测序，分别得

2、到雌花18408610条序列和雄花11191469条序列。通过生物信息学分析，共鉴定和预测得到39个保守miRNA家族和400个新的miRNA家族，其中有170个miRNA家族在雌、雄花样品间显著差异表达。对差异表达miRNA进行靶基因的预测及注释，结果显示，靶基因产物具有包含核苷三磷酸水解酶的磷酸环结构域的miRNA数量最多。在猕猴桃25号连锁群（Chr25）上共预测得到3个miRNA，其中novel-ach-miR362的靶基因Achn298021可能与猕猴桃花的性别发育有关。关键词：猕猴桃；microRNA；深度测序；性别分化中图分类号：S663.4文献标志码

3、：A文章编号：0513-353X（2015）07-1260-13PreliminaryInvestigationonSexDifferentiationofActinidiachinensisbyHigh-throughputmicroRNAsSequencing1,23111,*YANMing-ke，XUQiang，LIUChun-yan，ZHANGQiong，andYAOXiao-hong1（KeyLaboratoryofPlantGermplasmEnhancementandSpecialtyAgriculture，WuhanBotanicalGarden，C

4、hinese2AcademyofSciences，Wuhan430074，China；UniversityofChineseAcademyofSciences，Beijing100049，China；3ShangraoVocational&TechnicalCollege，Shangrao，Jiangxi334109，China）Abstract：ThemiRNAsinfemaleandmaleflowersofkiwifruitweresequencedbynext-generationsequencing，andreceived18408610and111914

5、69reads，respectively.Usingbioinformaticsmethods，39conservedand400novelmiRNAfamiliesincluding170miRNAfamiliesthatweredifferentlyexpressedbetweenthetwosampleswereidentified.TargetspredictionandannotationofidentifiedmiRNAsrevealedthemostenrichmentofP-loopcontainingnucleosidetriphosphatehy

6、drolasedomaininInterProterms.ThreemiRNAswerepredictedtobelocatedonthekiwifruitsexchromosome（Chr25），amongwhich，targetgeneAchn298021ofnovel-ach-miR362waspredictedtoberelatedtoflowerdevelopment，andshouldbedrawnspecialattentioninfuturestudy.Keywords：kiwifruit；microRNA；high-throughputsequen

7、cing；sexdetermination猕猴桃是功能性雌雄异株植物，其花芽在发育初期是双性的，但在发育过程中雌、雄株各所对应的另一种性别的花器官败育，形成单性植株：雌株的雄蕊败育不产生有生活力的花粉，而雄株的雌蕊败育不形成胚珠（Ferguson，1984）。由于猕猴桃雌、雄株的幼苗外形相似，对其性别分化的分收稿日期：2015–03–06；修回日期：2015–06–11基金项目：国家自然科学基金项目（31370251）*通信作者Authorforcorrespondence（E-mail：yaox@wbgcas.cn）闫明科，徐强，刘春燕，张琼，姚小洪.基于mi