加工番茄核心种质构建及其遗传背景分析

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1、园艺学报，2015，42(7)：1299–1312.ActaHorticulturaeSinicadoi：10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0134；http：//www.ahs.ac.cn1299加工番茄核心种质构建及其遗传背景分析***邓学斌，刘磊，闫喆，李涛，刘希艳，冯晶晶，池海娟，郑峥，**李君明（中国农业科学院蔬菜花卉研究所，北京100081）摘要：基于50年来收集的3026份加工番茄不同类型种质资源，分别利用20个表型性状和均匀覆盖12条染色体的46个SNP标记

2、，采用5种不同方法（Mstrat、Random、REMC、SBS和SFS）构建了10种初始核心种质。通过对其代表性评价与分析，最终确定了加工番茄最佳核心种质。Mstrat是构建加工番茄亚群核心种质的最佳方法，采用10%抽样比例所构建的302份最佳核心种质GCC1对原始种质的遗传结构和多样性均具有较好的代表性。通过对原始种质群体结构和主成分分析，加工番茄种质资源可分为2个较大的群体，遗传背景分别是基于代表性材料普通栽培番茄E6203和M82，所构建的GCC1核心种质均匀分布在原始种质资源群体。关键词：加

3、工番茄；SNP标记；核心种质；遗传背景中图分类号：S641.2文献标志码：A文章编号：0513-353X（2015）07-1299-14DevelopmentofaCoreCollectionofProcessingTomatoGermplasmsandAnalysisofGeneticBackground*DENGXue-bin，LIULei，YANZhe，LITao，LIUXi-yan，FENGJing-jing，CHIHai-juan，ZHENG****Zheng，andLIJun-ming（I

4、nstituteofVegetablesandFlowersofChineseAcademyofAgriculturalSciences，Beijing100081，China）Abstract：Basedon3026accessionsofprocessingtomatogermplasmscollectedinthelast50years，10kindsofprimarycorecollectionswereestablishedbyusing20phenotypictraitsand46SNPm

5、arkersevenlydistributedover12chromosomescombiningwith5differentstrategies（Mstrat，Random，REMC，SBSandSFS）.Finallyacorecollectionofprocessingtomatowasdeterminedaftertheevaluationandanalysisoftheirrepresentativeness.Mstrategyisavalidmethodtodevelopacorecoll

6、ectionforthesubgroupofprocessingtomato.ThecollectedprocessingtomatogermplasmscouldbedividedintotwoclustersandtheirgeneticbackgroundsarebasedoncultivatedtomatoaccessionE6203andM82astherepresentativeaccessionsofprocessingtomato，respectively.Theestablished

7、corecollectionGCC1evenlydistributedinthepopulationoftheinitialprocessingtomatogermplasms.Keywords：processingtomato；SNPmarker；corecollection；geneticbackground收稿日期：2015–03–18；修回日期：2015–05–21基金项目：国家自然科学基金项目（31171962）；公益行业（农业）科研专项经费项目（201303115）；‘十二五’国家科技支撑

8、计划项目（2012BAD02B04）；中国农业科学院科技创新工程项目（CAAS-ASTIP-IVFCAAS）；农业部园艺作物生物学与种质创新重点实验室项目*共同第一作者**通信作者Authorforcorrespondence（E-mail：lijunming@caas.cn；zhengzheng@caas.cn）DengXue-bin，LiuLei，YanZhe，LiTao，LiuXi-yan，FengJing-jing，ChiHai-juan，Zhe