最新obh[医药]癌旁肺组织基因表达谱与肺鳞癌进展的相关性研究幻灯片.ppt

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1、进入夏天，少不了一个热字当头，电扇空调陆续登场，每逢此时，总会想起那一把蒲扇。蒲扇，是记忆中的农村，夏季经常用的一件物品。　　记忆中的故乡，每逢进入夏天，集市上最常见的便是蒲扇、凉席，不论男女老少，个个手持一把，忽闪忽闪个不停，嘴里叨叨着“怎么这么热”，于是三五成群，聚在大树下，或站着，或随即坐在石头上，手持那把扇子，边唠嗑边乘凉。孩子们却在周围跑跑跳跳，热得满头大汗，不时听到“强子，别跑了，快来我给你扇扇”。孩子们才不听这一套，跑个没完，直到累气喘吁吁，这才一跑一踮地围过了，这时母亲总是，好似生气的样子，边扇边训，“你看热的，跑什么？”此

2、时这把蒲扇，是那么凉快，那么的温馨幸福，有母亲的味道！　　蒲扇是中国传统工艺品，在我国已有三千年多年的历史。取材于棕榈树，制作简单，方便携带，且蒲扇的表面光滑，因而，古人常会在上面作画。古有棕扇、葵扇、蒲扇、蕉扇诸名，实即今日的蒲扇，江浙称之为芭蕉扇。六七十年代，人们最常用的就是这种，似圆非圆，轻巧又便宜的蒲扇。　　蒲扇流传至今，我的记忆中，它跨越了半个世纪，也走过了我们的半个人生的轨迹，携带着特有的念想，一年年，一天天，流向长长的时间隧道，袅obh[医药]癌旁肺组织基因表达谱与肺鳞癌进展的相关性研究慢性炎症与肿瘤癌旁组织广泛存在炎症反应。

3、炎症反应诱发局部DNA损伤，诱导EMT，诱导血管生成。慢性炎症与肝癌，胃癌，结直肠癌，肺癌的发生具有重要关系。癌旁组织与某些肿瘤的预后相关肝癌癌旁组织的基因表达谱肝癌预后相关（Budhuetal.，2006）。肺腺癌癌旁组织中15个细胞因子的表达谱与肺腺癌转移相关（Seikeetal.，2007）。研究背景样本15例非癌症病人外周肺组织。60例原发性肺鳞癌病人癌旁肺组织。技术手段Agilent4×44k基因表达谱芯片分析。基于表达谱的基因网络分析。现有Pathway的GSEA分析。研究目的：探索癌旁肺组织与肺鳞癌发生发展的关系实验方案：肺鳞

4、癌癌旁组织中基因共表达网络分析表达数据预处理标准化。同一个基因选取表达均值最大的探针。选取在60例肺鳞癌癌旁组织中表达变异最大的前2000个基因进行网络分析。“WGCNA”分析根据拓扑结构建立基因之间的Subnetwork。Scanfreenetwork。实验结果13modules:13subnetworks参数设定实验结果：肺鳞癌癌旁组织基因共表达网络分析基因网络概况实验结果：肺鳞癌癌旁组织基因共表达网络分析各基因网络与临床表形的相关性实验结果：肺鳞癌癌旁组织基因共表达网络分析Modulepink结构信息87genes实验结果：肺鳞癌癌旁

5、组织基因共表达网络分析Modulepink基因功能分析PvalueNameIDName6.52E-104510Focaladhesion1.27E-094512ECM-receptorinteraction4.30E-091430CellCommunication0.0008144610Complementandcoagulationcascades0.0019415222Smallcelllungcancer0.0021735219Bladdercancer0.00224350TGF-betasignalingpathway0.00958

6、65218MelanomaKEGGpathwaysGOtermsPvalueGOTypeGODescription3.64E-38Componentextracellularregion8.13E-21Componentproteinaceousextracellularmatrix5.70E-15Functionextracellularmatrixstructuralconstituent8.13E-14Componentextracellularspace4.18E-12Componentcollagen3.18E-07Process

7、skeletalsystemdevelopment3.68E-07Functiongrowthfactoractivity8.34E-07Componentmicrofibril8.34E-07Functionnucleotidediphosphataseactivity9.99E-07Componentbasementmembrane实验结果：肺鳞癌癌旁组织基因共表达网络分析根据基因表达谱建立的基因网络显示与淋巴结转移、临床分期相关。直接考察现有的基因Pathway与淋巴结转移的关系，是否仍有类似的结果？实验结果针对Pathway的GSE

8、A分析淋巴结转移KEGG：ECM-receptorinteractionbioCarta;CXCR4SignalingPathway实验结果：针对Pathway的GSEA分析KE