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时间:2020-10-05
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1、第二章氨基酸Chapter2Aminoacid教学目标:掌握氨基酸的结构特点与理化性质。1.从氨基酸的结构特点上理解氨基酸的分类和生物学特性。2.掌握氨基酸的理化性质,重点掌握两性解离与等电点的含义、氨基酸参加的化学反应,特别是侧链的反应。了解氨基酸的光谱学特征。第一节氨基酸(Aminoacid,AA)—蛋白质的构件分子ProteinArchitectureP123一蛋白质的水解酸水解:6mol/LHCL,4mol/LH2SO4回流煮沸20h。缺点:Trp破坏,Asn、Gln脱酰胺基,羟基氨基酸(SerThr)部分破坏。优点:不消旋
2、碱水解:5mol/LNaOH共煮10-20小时缺点:消旋优点:色氨酸稳定酶水解:水解位点特异,得到多肽片段和AA的混合物,用于一级结构分析。二.氨基酸的结构(StructureofPr-AA)1.20种氨基酸的结构通式:不变部分可变部分非解离形式解离形式2.结构特点(1)除脯氨酸(亚氨基酸)外,这些天然氨基酸在结构上的共同特点为:与羧基相邻的α-碳原子上都有一个氨基,因而称为α-氨基酸.----C-C-C-C-COOHγβα----C-C-C-C(NH2)-COOHα-氨基酸----C-C-C(NH2)-C-COOHβ-氨基酸---
3、-C-C(NH2)-C-C-COOHγ-氨基酸什么是α-氨基酸?(2)除甘氨酸外,其它所有氨基酸分子中的α-碳原子都为不对称碳原子,所以:A.除甘氨酸外都具有旋光性.除甘氨酸外,都具有D-型和L-型两种立体异构体。B.除胱氨酸和酪氨酸外,其余AA都能溶于水。三.氨基酸的分类AAandclassification基本氨基酸:编码的蛋白质氨基酸20种修饰(稀有)氨基酸:多肽合成后由基本aa经酶促修饰而来。存在于生物体内但不组成蛋白质(约150种)。蛋白质AAPr-AA非蛋白质AANon-PrAA(一).基本20种氨基酸按照R基的化学结构
4、分类1.脂肪族氨基酸(1).中性氨基酸:含一氨基一羧基GlyAlaValLeuIleSer、ThrCys、Met含有羟基和硫的氨基酸含羟基:Ser、Thr含硫:Cys、Met含羟基的氨基酸:Ser、Thr★Ser的-OH(PKa=15),在生理条件下不解离,但它是一个极性基团,能与其它基团形成氢键,具有重要的生理意义,常出现在大多数酶的活性中心。★Thr中的-OH是仲醇,具有亲水性。★Ser和Thr的-OH往往与糖链相连,通过O-糖苷键形成糖蛋白。★Cys的R中含巯基-SH,具有两个重要性质:(1)在较高pH值条件,巯基离解。(2)
5、两个Cys的巯基氧化生成二硫键,生成胱氨酸。Cys—s—s—Cys胱氨酸共价键★二硫键在蛋白质的结构中具有重要意义。Cys还常出现在酶的活性中心。★Met的R基中含有甲硫基(-S-CH3),硫原子有亲核性,易发生极化,因此,在生物合成中是一种重要的甲基供体。(2)酸性氨基酸及其酰胺:Asp、Glu、Gln、Asn酸性氨基酸及其酰胺:Asp、Glu、Gln、Asn(3).含碱性基团:His、Lys、ArgLys侧链氨基的pKa为10.53,生理条件下,Lys侧链带有一个正电荷(NH3+).Arg是碱性最强的氨基酸,侧链上的胍基是已知碱
6、性最强的有机碱,pKa值为12.48,生理条件下完全质子化。His含咪唑环,它是20种氨基酸中侧链pK值最接近生理pH值的一种,在接近中性pH时,可离解平衡。它是在生理pH条件下唯一具有缓冲能力的氨基酸。(2).芳香族氨基酸:Phe、Tyr、Trp苯丙氨酸酪氨酸色氨酸这三种氨基酸在紫外区280nm处有特殊吸收峰,蛋白质的紫外吸收主要来自这三种氨基酸,在280nm处,三种氨基酸的紫外吸收值Trp>Tyr>PhePhe疏水性最强。Tyr的-OH磷酸化是一个十分普遍的调控机制,Tyr在较高pH值时,酚羟基离解。。(3).杂环族氨基酸:Pr
7、o(His)Pro的α-亚氨基是环的一部分,因此具有特殊的刚性结构,一般出现在两段α-螺旋之间的转角处,Pro残基所在的位置必然发生骨架方向的变化.(二)按照R基的极性性质(疏水性程度)分为:1.非极性氨基酸在维持蛋白质的三维结构中起着重要作用(蛋白质的疏水核心)非极性氨基酸2.极性氨基酸:这类氨基酸的侧链都能与水形成氢键,因此很容易溶于水。(1)不带电荷的极性氨基酸(2).带负电荷的AA(酸性AA)(3).带正电何的AA(碱性AA)*胶原蛋白中的Lys侧链氧化时能形成很强的分子间(内)交联。*Arg的胍基碱性很强,与NaOH相当。
8、*His是一个弱碱,是天然的缓冲剂,它往往存在于许多酶的活性中心。*非极性AA一般形成蛋白质的疏水核心,带电荷的AA和极性AA位于表面。酶的活性中心:His、Ser、Cys(三).根据人体能否自身合成必需氨基酸(定义):成年人:Thr
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