讨论二:RNA检测课件.ppt

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1、RNA药学1201班1组基本内容1、人类细胞质RNA的提取2、RT-PCR技术3、RNA的琼脂糖凝胶电泳基本内容1、人类细胞质RNA的提取2、RT-PCR技术3、RNA的琼脂糖凝胶电泳RNARNA概论常见提取方法技术应用DNA,RNA和蛋白质是三种重要的生物大分子,是生命现象的分子基础。DNA是遗传信息的主要载体,蛋白质是生命的物质基础,在DNA和蛋白质之间,RNA起着中介作用。与DNA相比,RNA种类较多,分子量相对较小,在遗传信息表达和调控过程中各类RNA分别发挥作用。这是我们对RNA的基本知

2、识。下面图示为中心法则:1、人类细胞质RNA的提取RNA概论rRNA基因组RNAmRNA样非编码RNA小胞质RNA小核RNA核仁小RNA端粒酶RNA反义RNAtmRNAGuideRNA核酶RNAtRNAmRNARNA信使RNA(mRNA)携带从DNA转录来的遗传信息转运RNA(tRNA)负责蛋白质合成时氨基酸的转运核糖体RNA(rRNA)在核糖体中起装配和催化作用具有催化作用的RNA即核酶RNA和其它RNA的自我催化分子基因组RNA指一些病毒以RNA为遗传物质指导RNAmRNA样非编码RNA其转录

3、和加工方式同mRNA,但不翻译为蛋白质tmRNA本身既是mRNA又是tRNA,翻译时一身二任,如大肠杆菌中的10SaRNA小胞质RNA存在于细胞质中的小RNA分子,如信号识别颗粒小核RNA是剪接体的组分是指导RNA编辑的小RNA分子核仁小RNA参与rRNA的加工端粒酶RNA是真核生物端粒的模板反义RNA可通过与靶位序列互补而与之结合的RNA,或直接阻止靶位序列功能,或改变靶部位构象而影响其功能。1、人类细胞质RNA的提取常见提取方法异硫氰酸胍一步法提取RNA异硫氰酸胍氯化铯超速离心法盐酸胍-有机溶

4、剂法氯化锂-尿素法1)异硫氰酸胍一步法提取RNA主要原理异硫氰酸胍是蛋白质强变性剂,能裂解组织细胞,释放RNA,抑制RNA酶的活性,同时与RNA形成可溶性复合物,经过酚/氯仿抽提,使RNA与组织中的DNA和蛋白质分离开,达到分离提取总RNA的目的。1)异硫氰酸胍一步法提取RNA操作流程1.100mg组织加1ml变性液冰浴匀浆。 2. 将匀浆液移人5ml Eppendorf管内,加 0.1ml 2mol/L乙酸钠 pH4.0,颠倒混匀,加 1ml水饱和酚,彻底混匀,加 0.2ml 49:1 氯仿/异

5、戊醇,彻底混匀,0-4℃培育 15min。 3. 于4℃以 10000r/min离心 20min,移上清水相到另一管。 4.加lml100%异戊醇沉淀RNA-20℃30min,于4℃以10000r/min离心10min,弃上清液。 5.溶解RNA沉淀在0.3ml变性液中,移入1.5ml离心管中。 6.用0.3ml100%异丙醇沉淀RNA-20℃30min,10000r/min离心10min弃上清液。 7. 悬RNA在75%乙醇中,振荡,室温孵育10-15min。 8. 10000r/min弃上清液

6、,真空干燥5-10min。 9. 用DEPC水100-200ul溶解RNA样品,可存于-70℃或在乙醇中置-20℃保存。1)异硫氰酸胍一步法提取RNA注意事项1 .操作时必须戴手套。 2. 所用的器皿和试剂均须经 DEPC水处理或 250-300℃干烤4h。 3. DEPC致癌。2)异硫氰酸胍氯化铯超速离心法主要原理异硫氰酸胍抑制RNA酶的活性,以CSCl为介质,进行密度梯度离心,分离RNA时,因RNA在CSCl溶液中的密度比蛋白质和DNA大,经离心后,RNA沉降到管底而DNA与蛋白质溶于上清液中

7、,达到分离RNA的目的。2)异硫氰酸胍氯化铯超速离心法操作流程1.加5-7倍于组织细胞体积的异硫氰酸肌匀浆液至含样品的勾浆器中。高速匀浆l-2min。 2.加十二烷基肌酸钠(SLS)至终浓度0.5%,混匀,5000r/min室温离心10min。 3.在Beckman离心机相应离心管中,20℃按下表超速离心。4 .弃2/3 GIT溶液,用吸管将下1/3吸出,用于染色体DNA的制备,管底胶状沉淀即总RNA。 5 .用70%乙醇洗RNA沉淀,弃乙醇,干燥。 6. 用300ul TE pH7.6(含0.1

8、%SDS)溶解 RNA沉淀,用等容积酚、酚/氯仿、氯仿各抽提一次。 7.上清加人0.1体积3mol/LNaAc(PH5.2),2倍体积乙醇混匀,-70℃30min。 8.于4℃以12000r/min离心10min,弃上清液,70%乙醇漂洗RNA沉淀,12000r/min离心5min,弃上清液,真空抽干燥。 9.DEPC水适量溶解RNA,测定OD260与OD280,计算RNA的质量与浓度,-20℃或加3倍体积的乙醇-70℃保存。2)异硫氰酸胍氯化铯超速离心法注意事项1 .本方法适用于

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