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时间:2020-06-20
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1、106中国烟草学报2013年12月第19卷第6期云南烟草中烟草花叶病毒株系比较与分析秦西云,卢训,方琦,尹跃艳,丁铭,张仲凯1云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所,云南省农业生物技术重点实验室,农业部西南农业基因资源与种质创制重点实验室,昆明市学云路9号650223;2云南省烟草农业科学研究院,昆明市圆通街33号650031摘要:利用TAS.ELISA方法对采自云南不同烟草种植区的710份花叶病样进行检测,其中546份样品与TMV抗体呈阳性反应。根据地理分布的差异,选择了38个代表性分离物进行T
2、MV外壳蛋白基因的IC—RT-PCR扩增、克隆和测序。测序分析表明,38个TMVcp基因核苷酸序列相似性在95%~100%之间,其推导的氨基酸序列同源性为97.5%~100%。云南不同TMV分离物与TMV-U1、TMV-Fujian核苷酸相似性大于90%,其系统关系与TMV-U1和TMV-Fujian分离物聚为一簇,研究表明云南38个烟草分离物均属于TMV-U1株系。关键词:烟草;烟草花叶病毒;株系doi:10.39690.issn.1004-5708.2013.06.0017中图分类号:S432.
3、41文献标识码:A文章编号:1004-5708(2013)06-0106-08ComparisonoftobaccomosaicvirusstrainsisolatedfromtobaccogrownindiferentareasinYunnanProvinceQINXiyun,LUXun,FangQi,YinYueyan,DINGMing,ZHANGZhongkai1InstituteofBiotechnOlOgyandGermplasmResources,YunnanAcademyofAgric
4、ultura1Sciences,KeyLaboratoryofYunnanAgriculturalBiotechnology,KeyLaboratoryofSouthwesternCropGeneResourcesandGermplasmInnovation,MinistryofAgriculture,Kunming,650223,Yunnan,China;2YunnanAcademyofTobaccoAgriculturalResearch,Yuxi,653100,Yunnan,ChinaAbst
5、ract:710samplesoftobaccoplantsshowingmosaicsymptomwerecollectedfromdifferenttobacco—growingareasinYunnanprovince.546ofthe710samplesweredetectedTMVantigenpositivebyTAS—ELISA.Accordingtogeographicaldistribution.38isolateswereamplified.clonedandsequencedb
6、yIC·RT-PCRforTMVcoatproteingene.Resultshowedthatnucleotidesequencesforcoatproteinofthese38isolateswere95%to100%similarwhileaminoacidsequencesweresimilar97.5%~100%.ThesimilarityamongdiferentTMVisolatesinYunnanandTMV-U1,TMV-Fujianwererelativelyhighinnucl
7、eotidesequencesofcoatproteingene.ThephylogenetictreeofTMVisolatesshowedTMVisolatesinYunnansharecertainevolutionaryrelationshipwithTMV-U1strain.Keywords:tobaccoplant;tobaccomosaicvirus;strain烟草花叶病毒(Tobaccomosaicvirus,TMV)是围,可侵染包括30个科的310多种植物『l】。TMV基烟草花叶
8、病毒属的代表种,该病毒具有较广的寄主范因组全长6395nt,为单链正义RNA,基因组共编码4个ORF『2],其中外壳蛋白基因(coat—protein,CP)基金项目:中国烟草总公司重点科技项目(110200902065),云南省是病毒分类相关基因『3]。在不同的寄主上TMV有许公司科技计划项目(2010YN19)作者简介:秦西云(1963一),主要从事烟草病虫害防控技术研究,多株系,在我国主要有TMV-U1、TMV-U2、番茄株Email:xyqin@yntsti.
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