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《南四湖泥鳅与大鳞副泥鳅COI基因序列分析.pdf》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、第26卷第3期济南大学学报(自然科学版)Vol_26No.32012年7月JOURNALOFUNIVERSITYOFJINAN(Sci.andTech.)Ju1.2012文章编号:1671—3559(2012)03—0266—05南四湖泥鳅与大鳞副泥鳅COI基因序列分析顾林林h,李殿香,杨小萌,王元秀(1.济南大学a.化学化工学院;b.医学与生命科学学院,山东济南250022;2.山东省医学科学院,山东济南250022)摘要:利用PCR一测序技术,对山东省南四湖的泥鳅与大鳞副泥鳅COI(线粒体氧化酶)基因约900bp的片段进行测序和分析。这些C
2、OI基因片段的碱基平均含量AT为55.5%,GC为44.5%;序列同源性分析发现,泥鳅和大鳞副泥鳅种内平均遗传距离分别为0.012和0.001,都小于0.02,与其他鱼类的种间遗传距离都大于0.02。利用种间遗传距离构建系统树表明,泥鳅和大鳞副泥鳅样本各自成支,两支的关系比其他鱼种要近,这与形态学分类结果一致,说明该COI基因序列可以作为DNA条形码用于物种的鉴定。关键词:南四湖;泥鳅;大鳞副泥鳅;线粒体氧化酶基因;DNA条形码中图分类号:Q781文献标志码:ASequenceAnalysisofCOIGeneinMisgurnusAnguil
3、licaudatusandParamisgurnusDabryanusfromNansiLakesGULin·lin,LIDian-xiang,YANGXiao—meng。,WANGYuan-xiu(1a.SchoolofChemistryandChemicalEngineering;1b.SchoolofMedicineandLifeSciences,UniversityofJinan,Jinan250022,China;2.ShandongAcademyofMedicalSciences,Jinan250022,China)Abstract
4、:UsingPCR—sequencingtechnologytodeterminethemitoehondrialcytochromeoxidasesubunit(COI)gene’ssequenceswithalen~hof900bpinmisgurnusanguillicaudatusandparamisgurnusdabryanusfromNansilake,theresultsshowthattheaveragelevelofbasesforAandTis55.5%,CandGis44.5%,respectively.Theaverag
5、egeneticdistancesamongCOIsequencesfromindi—vidualsamplesare0.001forparamisgurnusdabryanusand0.012formisgurnusanguillicaudatus,botharelessthan0.02.Additionally,theaveragegeneticdistancesofmisgurnusanguillicaudatusandparamisgurnusdabryanuswithotherfishspeciesaremorethan0.02.Th
6、etreeshowsthatthesamplesfrommisgurnusanguillicaudatusandparamisgurnusdabryanusareclustereddiferentgroupsbasedontheirgeneticdistancesseparately,whichisconsistentwiththeresultofmorphologicalclassification.So,theCOIgenesequencesofmis—gurnusanguillicaudattL~andparamisgurnusdabry
7、anuscanbeusedtoDNAbarcodes.Keywords:Nansilakes;misgurnusanguillicaudatus;paramisgurnusdabryanus;COIgene;DNAbarcode南四湖位于山东省西南部,面积1266hm。,是大鳞副泥鳅(Paramisgurnusdabryanus)在南四湖4山东省第一大湖,也是中国北方5大淡水湖泊之一,个湖区均有分布,资源丰富,但两者形态差别很小,自北向南由南阳湖、独山湖、昭阳湖和微山湖4个湖尤其在幼鱼期更难以区分,从而限制了单一物种}白串联而成⋯。泥鳅(Mis
8、gurnusanguillicaudatus)与的利用与开发。收稿Et期:2011—12—05网络出版时间:2012—04—1715:06基金项目:山
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