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1、应用生态学报2003年4月第14卷第4期CHINESEJOURNALOFAPPLIEDECOLOGY,Apr.2003,14(4)∶609~6123微生物系统发育多样性及其保护生物学意义33田春杰陈家宽钟扬(复旦大学生物多样性科学研究所,上海200433)【摘要】近年来,分子系统发育分析方法,特别是rRNA基因同源性分析方法,在微生物多样性的研究中发挥着越来越重要的作用.它克服了传统的微生物分离培养方法的限制,极大地促进了人们对微生物多样性的理解.在遗传信息同源性分析基础上得出的微生物系统发育多样性为多样性的保护提供了新的视点.它不但可以作为微生物多样性评
2、价的手段,而且为多样性保护中优先秩序的确定提供了依据.同时也为生物多样性保护确定了目标,即最大程度地保护系统发育关系中所包含的信息.本文对微生物系统发育多样性的特点及其保护生物学意义进行了简要评述.关键词微生物系统发育多样性保护生物学文章编号1001-9332(2003)04-0609-04中图分类号Q344文献标识码APhylogeneticdiversityofmicrobesanditsperspectivesinconservationbiology.TIANChunjie,CHENJiakuan,ZHONGYang(KeyLaboratoryfo
3、rBiodiversityScienceandEcologyEngineering,MinistryofEducationandInstituteofBiodiversityScience,FudanUniversity,Shanghai200433,China).2Chin.J.Appl.Ecol.,2003,14(4):609~612.Molecularphylogeneticanalysisplaysaveryimportantroleinthestudyofmicrobialdiversity.Forbothcultivat2edanduncult
4、ivatedmicrobes,thecomparativesequenceanalysisof16SrRNAenabledtheinvestigationofphylo2geneticrelationshipsamongmicroorganismsinamannerthatwasnotfeasiblethroughtraditionalmicrobiologicalmethods.Asaresult,therearedrasticrevisionsinourunderstandingofmicrobiology.Thephylogeneticdiversi
5、2tybasedonthecomparativesequenceanalysisof16SrRNAproducednewinsightsintothebiodiversityconserva2tion.Itprovidesamethodforbiodiversityjudgmentandaguidelineforbiodiversityconservation.Also,itpro2ducestheaimofconservation,whichistokeepthephylogeneticinformationasmuchaspossible.Inthis
6、review,somecharactersofmicrobialphylogeneticdiversityandtheperspectivesinconservationbiologyareoutlined.KeywordsMicrobe,Phylogeneticdiversity,Conservationbiology.1引言2微生物系统发育多样性的特点微生物的物种资源极其丰富,是地球上仅次于昆虫的第传统意义上的生物多样性研究,以及生物多样性与生态二大类群的生物,微生物多样性的研究是整个生物多样性研系统结构和功能关系的研究,主要是根据分类多样性标准进[3
7、5]究的重要组成部分.通常情况下,生物多样性可以理解为生行的.分类多样性的研究主要基于分类研究的基础上,对物物种的多样化及其变异的程度和广度,是物种多样性、遗分类群(通常是物种)的丰富度和均匀度进行测定,然后利用[25]传(基因)多样性和生态系统多样性3个层次上的综合表多样性指数中多样性的大小.因而,分类多样性的研究要[8]述.微生物多样性则包括生活环境的多样性、生长繁殖速有合理准确的分类标准和手段,只有对群落某一分类水平度的多样性、营养和代谢类型的多样性、生活方式的多样性、(通常是物种水平)的准确鉴定,才能对其数量、概率及生物[19,42]基因的多样性和
8、微生物资源开发利用的多样性等等.量进行定量分析.分类多样性实际上在