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1、应用生态学报 2003年4月 第14卷 第4期 CHINESEJOURNALOFAPPLIEDECOLOGY,Apr.2003,14(4)∶609~612微生物系统发育多样性及其保护生物学意义333田春杰 陈家宽 钟 扬(复旦大学生物多样性科学研究所,上海200433)【摘要】 近年来,分子系统发育分析方法,特别是rRNA基因同源性分析方法,在微生物多样性的研究中
发挥着越来越重要的作用.它克服了传统的微生物分离培养方法的限制,极大地促进了人们对微生物多样
性的理解.在遗传信息同源性分析基础上得出的微生物系统发育
2、多样性为多样性的保护提供了新的视点.
它不但可以作为微生物多样性评价的手段,而且为多样性保护中优先秩序的确定提供了依据.同时也为
生物多样性保护确定了目标,即最大程度地保护系统发育关系中所包含的信息.本文对微生物系统发育多
样性的特点及其保护生物学意义进行了简要评述.关键词 微生物 系统发育多样性 保护生物学文章编号 1001-9332(2003)04-0609-04 中图分类号 Q344 文献标识码 APhylogeneticdiversityofmicrobesanditsperspectivesinconservationbiology.TIANChunjie,C
3、HENJiakuan,
ZHONGYang(KeyLaboratoryforBiodiversityScienceandEcologyEngineering,MinistryofEducationand
InstituteofBiodiversityScience,FudanUniversity,Shanghai200433,China).2Chin.J.Appl.Ecol.,2003,
14(4):609~612.Molecularphylogeneticanalysisplaysaveryimportantroleinthestudyofmicrobialdiver
4、sity.Forbothcultivat2
edanduncultivatedmicrobes,thecomparativesequenceanalysisof16SrRNAenabledtheinvestigationofphylo2
geneticrelationshipsamongmicroorganismsinamannerthatwasnotfeasiblethroughtraditionalmicrobiological
methods.Asaresult,therearedrasticrevisionsinourunderstandingofmicrobi
5、ology.Thephylogeneticdiversi2
tybasedonthecomparativesequenceanalysisof16SrRNAproducednewinsightsintothebiodiversityconserva2
tion.Itprovidesamethodforbiodiversityjudgmentandaguidelineforbiodiversityconservation.Also,itpro2
ducestheaimofconservation,whichistokeepthephylogeneticinformatio
6、nasmuchaspossible.Inthisreview,
somecharactersofmicrobialphylogeneticdiversityandtheperspectivesinconservationbiologyareoutlined.Keywords Microbe,Phylogeneticdiversity,Conservationbiology.1 引 言2 微生物系统发育多样性的特点微生物的物种资源极其丰富,是地球上仅次于昆虫的第传统意义上的生物多样性研究,以及生物多样性与生态二大类群的生物,微生物多样性的研究是整个生物多样性研系统结构和
7、功能关系的研究,主要是根据分类多样性标准进究的重要组成部分.通常情况下,生物多样性可以理解为生行的[35].分类多样性的研究主要基于分类研究的基础上,对物物种的多样化及其变异的程度和广度,是物种多样性、遗分类群(通常是物种)的丰富度和均匀度进行测定,然后利用传(基因)多样性和生态系统多样性3个层次上的综合表多样性指数中多样性的大小[25].因而,分类多样性的研究要述[8].微生物多样性则包括生活环境的多样性、生长繁殖速
有合理准确的分类标准和手段,只有对群落某一分类水平度的多样性、营养和代谢类型的多样性、生活方式的多样性、(通常是物种水平