基于分子互作网络的MMPs相关基因在胃癌组织中的表达研究-论文.pdf

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1、一56一ChinJLabDiagn，January，2015，Vol19，No．1文章编号：1007—4287(2015)01—0056—04基于分子互作网络的MMPs相关基因在胃癌组织中的表达研究许建婷，金浩范，王冀邯，牛超。，高长璺，王国庆，李凡(1．吉林大学基础医学院，吉林长春130021；2．吉林大学第一医院肿瘤中心，吉林长春130021)摘要：目的探讨MMPs相关分子互作网络在胃癌组织中的表达情况。方法运用1O对胃癌及相应癌旁组织芯片筛选胃癌组织中差异表达基因，结合BioGRID数据库，构建胃癌组织中表达异常的

2、MMPs相关分子互作网络。结果胃癌中多个MMPs家族成员及其互作网络中的18个基因均呈高表达状态，主要参与的生物学过程及通路和癌症细胞的侵袭、转移等过程密切相关。结论高通量组学及相关数据库、分析工具的结合有助于构建癌症中表达异常的分子互作网络，为后续的研究提供较全面的分子学机制基础。关键词：分子互作网络；MMPs；BioGRID数据库；GO；Pathway中图分类号：R735．2文献标识码：AExpressionanalysisofMMPsandtheirrelatedgenesbasedonthemolecularin

3、teractionnetworkingastriccancertissuesXUJian—ting，JINHao一，n，W_ANGJi—han，eta1．(CollegeofBasicMedicalSciences，JilinUniversity，Changchun130021，China)Abstract：ObjectiveToexploretheexpressionofMMPs—relatedmolecularinteractionnetworkingastriccancertissues．Methods10pair

4、sofgastriccancerandtheircorrespondingpara-carcinomatissueswereanalyzedwithmicroar—rayforscreeningofthedifferentiallyexpressedgenes，thenconstructedthedifferentiallyexpressedMMPs—relatedmo—lecularinteractionnetworkingastriccancertissuesbyintegratingtheinformationfr

5、omBioGRIDdatabasesandthemi—croarrayresults．Results18genesintheMMPs—relatedmolecularinteractionnetwork(alsoincludingseveralMMPsmembers)wereup-regulatedingastriccancertissues，themainbiologicalprocessesandpathwaysthattheyparticipatedinwerecloselyrelatedwithcancerinv

6、asionandmetastasisprogression．ConclusionThecombinationofhigh-through—putgenomics，bioinformaticdatabasesandanalyticaltoolsisnecessaryfortheanalysisofcancer-relatedmolecularinter—actionnetwork，whichwillprovidemorecomprehensivemolecularmechanismsforthefutureresearch

7、．Keywords：molecularinteractionnetwork；MMPs；BioGRID；G0；Pathway(ChinJLabDiagn，2015，19：0056)胃癌作为临床常见的消化道恶性肿瘤，多年来解释疾病的发生发展至关重要。本研究以胃癌组织困扰着我国的国民健康[1]。早期检出率低是胃癌死高通量芯片为信息基础，整合BioGRID数据库信亡率居高不下的关键原因，往往被诊断出中晚期的息，构建了胃癌组织中MMPs家族相关的分子互作病例已伴随着癌细胞的广泛侵袭及远处转移，直接网络，旨在为胃癌的侵袭、转移研究提

8、供更多的分子否决了手术根治的可能性]。基质金属蛋白酶学机制。(matrixmetalloproteinase，MMPs)家族因其能够降1材料与方法解细胞基底膜和基质、突破细胞外基质屏障，被认为1．1标本采集与细胞的侵袭、扩散、转移等过程直接相关[3]。已有研究选取2012年5月至2013年5月吉林大学研究显示胃癌中部