桉树遗传图谱的EST-CAPS标记整合及生长和扦插性状的QTL定位.pdf

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1、桉树遗传图谱的EST-CAPS标记整合及生长和扦插性状的QTL定位于晓丽2012届硕士中国林业科学研究院万方数据分类号Q949.762.2密级公开UDC577学位论文桉树遗传图谱的EST-CAPS标记整合及生长和扦插性状的QTL定位IntegrationofEST-CAPSmarkerstolinkagemapsanddetectionofQTLsrelatedwithrootingabilityofcuttingsandfieldgrowthinEucalyptus于晓丽指导教师姓名甘四明研究员申请学

2、位级别硕士专业名称生物化学与分子生物学研究方向林木基因组学论文提交日期2012年5月论文答辩日期2012年6月学位授予日期2012年7月答辩委员会主席徐大平评阅人北京·中国林业科学研究院万方数据学位论文桉树遗传图谱的EST-CAPS标记整合及生长和扦插性状的QTL定位学位论文作者于晓丽指导教师姓名甘四明研究员申请学位级别硕士学位专业名称生物化学与分子生物学研究方向林木基因组学论文答辩日期2012年6月中国·北京万方数据DissertationfortheDegreeIntegrationofEST-CA

3、PSmarkerstolinkagemapsanddetectionofQTLsrelatedwithrootingabilityofcuttingsandfieldgrowthinEucalyptusCandidate:YuXiaoliSupervisor:GanSimingAcademicDegreeAppliedfor:MasterDegreeSpeciality:BiochemistryandmolecularbiologyDateofDefence:2012.6Degree-Conferrin

4、g-Institution:ChineseAcademyofForestry万方数据独创性声明本人声明所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得本研究生培养单位或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名：日期：年月日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解中国林业科学研究院有关

5、保留、使用学位论文的规定，中国林业科学研究院有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅。本人授权中国林业科学研究院可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。（保密的学位论文在解密后适用本授权书）学位论文作者签名：导师签名：年月日年月日学位论文作者毕业联系方式工作单位：联系电话：电子邮件：通讯地址、邮编：万方数据万方数据摘要尾叶桉和细叶桉是世界范围内的重要人工林树种。目前，利用分子标记构建遗传图谱和QTL定位

6、已经成为包括桉树在内的林木基因组研究的重点。公共数据库中的多种桉树的EST序列信息为STS标记的开发提供了便利，如EST-SSR、EST-indel和EST-SNP等。本研究对从公共数据库桉树EST中开发的91个CAPS标记进行了测序验证，并将这些标记整合到原来利用RAPD标记构建的尾叶桉和细叶桉图谱上，尾叶桉和细叶桉分别增加了48个和42个标记，其中，共有标记13个。尾叶桉总图谱长度达到1789.5cM，比原来的RAPD图谱长284.9cM；标记间的平均图距是9.7cM，比原来的图谱小1.3cM。细叶

7、桉总图谱长度达到1488.1cM、标记间的平均图距是10.3cM，比原来的RAPD图谱分别长452.4cM、1.3cM。所有的新增的77个EST-CAPS标记都在最近公开的巨桉基因组序列中找到同源序列，发现在巨桉基因组和我们所构建的图谱中有保守的共线性和同线性。扦插生根和生长是桉树无性系选育的重要性状。本研究在以上构建的遗传图谱的基础上对扦插穗条的根数、最长根长、生根率和根干质量4个扦插生根性状以及13、18和46月生树高和胸径2个生长性状的QTL进行了定位。在母本尾叶桉和父本细叶桉上各检测到6个和7个

8、扦插生根相关的QTL，LOD值2.0～3.9，贡献率15.2～26.8%。尾叶桉上检测到2个和1个QTL分别与46月生树高和胸径相关；细叶桉上检测到显著影响各林龄树高和胸径的QTL。没有检测到与扦插和生长均相关的QTL，表明两类性状可能受不同的基因位点控制。两类性状上均有部分QTL与相邻标记紧密连锁，甚至直接定位到标记上，这为相关性状的标记辅助选择提供了有潜力的候选标记。关键词：桉树，分子标记，遗传图谱，数量性状位点I万方数据Abstrac