铁皮石斛原球茎内参基因的筛选及LEA基因家族表达分析.pdf

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1、戀禱慧pM:学位论masterdissertate^賺議^论古顕目:铁皮石解原球茎内参基因的筛选及篆鏡醜族表繼邏—::1:i年级三公二齡:国内图书分类号:於)巧密级:公开国际图书分类号:西南交通大学研究生学位论文鉄皮石餅原球塞内参基因的筛选及基因家族表达分析年级二〇—四级姓名安红强申请学位级别硕±专业尘物工程指导老师王万军教授二〇—七年五月十九日9ClassifiedIndex:?U‘.D.C:Sou

2、thwestTiaotonUniversitgyMasterDegreeThesis犯站CTIONOFINTERNALREFERENCEGENESINPROTOCORMANDTHEE如ElESSIONANALY别SOF編GENEFAMILYOFDENDROBIUMOFFICINALEKiMURA必rivnooGrade:2014Candidate:HongqianAngA苗idemicDegreeApplied化r:MasterSpeci

3、ality:BiotechnologySuervisor:WanunWanro技巧orpjg,pMa.119207y,西南交通大学学位论文版权使用授权书本学位文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定,同意学校保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子版。本人授,允许论文被查阅和借阅权西南交通;^学可W将本论文的全部或部分内容编入有关数据库进巧检索,可W采用影印、缩^或扫描等复印手段保存和汇编本学位论文。本学短论文属于1.保□,在3年解密后适用本授权书;^2.不

4、占密图,使用本授权书。""(请^队h方框内打V):学位论文作者签名:指导老师签名3'团期:曰期:’w-y,巧八?巧南交通大学硕±学位论文主要工作(贡献)声明本人在李位论文中所做的主要工作或贡献如下:(1)查闻文献了解了铁皮石解原球茎发育的形态特征,并通过体视显微镜和扫描电子盛微镜对特定发育时期的形态特征进行了观察。(2)额了大量有关内参基因筛选评价的国内外相关文献,了解了各种内参基因筛选的候选基因来源及评价方法。3基于原球茎不同发育时期的转录组测序数据确定候选,()内参基因并通过

5、geNorm、NormFinder、BestKeeper方法评价了候选基因的稳定化筛选出适合原孫茎发育时期基因表达分析的内参基因,并评价了候选基因在温度、干旱胁迫案件下的稳定性。(4)通aB.last和HMMER方法从全基因组水平上鉴定出铁皮石餅王基因家族的全ip基因成员。5()对^皮石解五基因家族的全部成员进巧了基因结构、蛋白基序及生化特征分誤,发现其保守序列特征。(6)对换皮石解I似基因家族成员进行了原球茎不同发育时期、ABA诱导、PEG:?>及低盛胁迫条件下的表达谱分析,并推

6、测不同基因家族成员可能具有的功能:。9本人#畫声明:所呈交的学位论文,是在导师指导下独立进行研究工作所得的成果。除文中已學注明引用的内容外,本论文不包含任何其它个人或集体已经发表或撰写过的研竞诚果。对本文的研巧做出贡献的个人和集体,均已在文中作了明确说明。?A本人完全了接违反上述声明所引起的一切法律责任将由本人承担。9学位论文作者签名:、嘴如-曰期:l.MiS、叫西南交通大学硕±研究生学位论文第I巧摘要D讯.铁皮石触ewoWm/w0。"幻/eKimuraW

7、Mio是兰科石解属多年生草本植物,具(斯g)有重要的药用和观赏价值,其种子发育成熟时,,种胚仍旧停留在未分化的球形胚阶段种子萌发后通过原球茎发育途径形成完整植株。其形态发生过程历经种胚活化及原球茎的形成、成熟与退化等时期,总体上可W分为8个不同发育时期:种胚活化突破种皮、原球茎形成、原分生组织形成、顶端分生组织形成、楠球形原球茎、叶原基维管系统形根端分生组织形成、原球茎退化和苗的形成。对各时期原球茎核酸含量分析表明,前5个时期单个原球茎中核酸含量逐步上升,楠球形原球茎之后核酸含量>:大幅上升。

8、.内参基因的运用对于基因表达分析具有重要影响,本研巧基于原球茎时期转录组数据和文献报道,筛选了26个表达最稳定的基因和5个常用的管家基因作为测试基因。一步筛选出其中的对测试基因案达稳定性进斤初步评价分析,进19个基因作为候选内参基因,并采用geNorm、No^nFinde

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