第十一章 微生物的分类和鉴定.ppt

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1、第十一章微生物的分类和鉴定定义：按微生物的亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群的科学。任务：分类鉴定命名分类：根据一定的原则(表型特征相似性或系统发育相关性)对微生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列成系统，并对各个分类群的特征进行描述，以便查考和对未被分类的微生物进行鉴定。(根据现有数据建立系统的过程)鉴定：借助于现有的微生物分类系统，通过特征测定，确定未知的、或新发现的、或未明确分类地位的微生物所应归属分类群的过程。(根据现有系统确定未知微生物分类归属的过程)命名：是根据命名法规，给每一个分类群一个专有的

2、名称。(分类系统建立过程中的步骤之一)第一节通用分类单元种以上的系统分类单元界Kingdom门Phylum（或Division）纲Class目Order科Family属Genus种Species种的概念定义：种是一个基本分类单位，是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有明显差异的菌株的总称。在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株（typestrain)作为具体标本，它就是该种的模式种(typespecies)。在Bifidobacteriumbifidum的大量菌株中，只有“ATCC29521”菌株才是

3、模式种。新种（sp.nov.或nov.sp.）：是指权威性的分类、鉴定手册中从未记载过的一种新分离并鉴定过的微生物。新被鉴定的种发表时应在其学名后标上sp.nov.的符号。我国学者筛选到的Corynebacteriumpekinensesp.NovAS1.299(北京棒杆菌）新种发表前应将其模式菌株的培养物存放在一个永久性的保藏机构，并应允许人们从中取得。微生物的命名学名：菌种的科学名称。命名原则：双名法（binominalnomenclature)学名=属名+种的加词+（首次定名人）+（现名定名人和鲜明定名年份）----一般省

4、略属名在前，一般用拉丁字名词表示，字首字母大写种名在后，常用拉丁文形容词表示，全部小写大肠杆菌：Escherichiacoli(Migula)CastellanietChalmers1919若所分离的菌株只鉴定到属，而未鉴定到种，可用sp来表示.例如Bacillussp三名法(trinominalnomenclature)当某种微生物是一个亚种（subspecies,subsp)或变种(variety,var)时，学名就按三名法拼写，即：学名=属名+种名+符名subsp或var+亚种或变种的加词苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种Bacill

5、usthuringiensis(subsp)galleria酿酒酵母椭圆变种Saccharimycescerevisiae(var)ellipsoideus亚种以下的分类单元亚种（subspeciers）：种的进一步细分，一般指除某一明显而稳定的特征外，其余鉴定特征都与模式种相同的种。其命名方法与三名法相同；变种（variety）：容易引起混乱；型form：曾用作菌株的同义词，现已作废；菌株（strain）：表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯遗传型群体及其一切后代。任何一个不同来源的纯培养物均可称为某菌种的一个菌株。一个

6、物种内遗传多态性的客观反应，其数目几乎是无数的;菌株与克隆的概念相同;在同一菌种的不同菌株间，作为鉴定用的一些主要性状相同，但不作为鉴定用的一些小性状却有很大的差异；某菌发生自发或人工变异后，均应标以新的菌株名称；在菌种保藏、科学研究、发表学术论文时，都应在菌种后标出该菌株的名称；菌株的名称可随意确定，一般可用字母加编号表示。如：EscherichiacoliK12;E.coliO157:H7第二节微生物在生物界的地位生物的界级分类学说：二界系统、三界系统、四界系统、五界系统、六界系统和三域系统三域系统是1978年由C.R.Wo

7、ese和L.Margulis提出的。所有生物存在一个共同祖先，由它分三条进化路线，就形成了三个域：古细菌域（Archaebacter）、真细菌原界、真核生物原界。内共生学说：原核生物体与宿主细胞难分难解形成了细胞器----线粒体和叶绿体。三域学说及其生物进化谱系树第三节各大类微生物的分类系统纲要原核生物分类系统纲要——伯杰氏系统细菌学手册-----手册把原核生物分为古生菌界和细菌界，它们相当于三域中的两个域。《伯杰氏鉴定细菌学手册》(Bergey’sManualofDeterminativeBacteriology)美国宾夕法尼

8、亚大学的细菌学教授伯杰伯杰氏手册是目前进行细菌分类、鉴定的最重要依据，其特点是描述非常详细，包括对细菌各个属种的特征及进行鉴定所需做的实验的具体方法。从20世纪80年代末期，该手册改名为：《伯杰氏系统细菌学手册》(Bergey’sManualofSystemat