canoco 4.5 进行CCA分析

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1、Canoco4.5做CCA分析1.canoco4.5包括很多模块，我们一般使用到的就是WCanolmp，canocoforWindows4.5，canoDrawforWindows这三个。2.首先我们打开WCanolmp，将环境因子和物种信息分别保存为.dat文件。2.1用Excel打开环境因子文件同样用Excel打开物种信息文件需要注意的是，两个dat文件的数据组数要一样，也就是enviro.dat里面复制保存了5列，spice.dat里面也要复制保存同样名称的5列，这5列一定包括图中红色区域。否则后面就会出现错

2、误。见3.22.2如果我们的数据一列表示一组数据，那么我们就要选择eachcolumnisasample。2.3保存好两个.dat文件后，不要着急打开工程模块，先新建一个文本文档，将文档后缀名改成sol，后面要用到。3.3.1打开canocoforWindows4.5模块，通过图中红色区域的图标新建一个project，或者打开file—newproject。选择spicesandenvironmentdataavailable，点下一步。3.2按照要求点击Browse，将两个dat文件分别输入，最下面一栏将之前新建

3、的sol文件输入。点击下一步。这时如果保存的数据组数不一样，就会出现错误。这个问题改好后，重新建一个project，不然会一直跳出来这个错误。之后一直下一步就好，最后点完成后出现con文件，命名后保存。3.4在project中点击Analyze进行分析。3.5分析后出现下图，点击CanoDraw，保存cdw文件，跳到作图3.6点击create-biplotsandjointplots-samplesandenv.Variables作图。出现下图，这时发现样点序号不是自己的标注，需要进行更改。如下图所示，点击Proj

4、ect-Setting，选择Appearance，在Samplelables里选择Names，选择insertlegend，置于底部。重新create作图。