Canoco 4.5使用说明_中文版

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1、CanocoforWindows4.5中文简明教程2009-9第一章CANOCO简介一软件功能CanocoforWindows是新一代的CANOCO软件，是生态学应用软件中用于约束与非约束排序的最流行工具。CanocoforWindows整合了排序以及回归和排列方法学，以便得到健全的生态数据统计模型。CanocoforWindows包括线性和曲线单峰方法。使用CanocoforWindows进行排序，能够洞察：●生物群落结构●植物与动物群落以及它们的环境之间的联系●一个对环境和(或)其生物群落的假设冲击所

2、能造成的影响●在生物群落上进行的复杂生态学和生态毒理学实验的相关处理所能造成的影响一个排序被计算出来后，排序图可以立即显示在显示器上。Canoco具体独特的能力，可以说明用协变量表示的背景变异，而用它的扩展工具来进行排列测试，包括测试的互动效果。这些独特的特性使得CanocoforWindows能特别有效的解决应用研究方面的问题。二软件模块TheCanocoforWindows软件包主要包含以下几个模块：●CanocoforWindows：软件包的核心，用来指定要分析的数据和排序模型，排序方法以及分析结果

3、的查看等基本操作命令均被集中在该模块的对话框中●WcanoImp：将以电子表格形式（Excel等）保存的外部数据转化为CANOCO识别的形式●CanoDraw4.0forWindows：用来绘制各种类型的排序图，同时也可以生成多种等值线和回归模型图，并进一步深层次发掘排序结果，该模块可以直接从主程序界面工具栏激活●CanoMerge：合并Canoco识别的dta类型数据文件，并可以将数据文件以带制表分隔符的文本形式输出（基本常用统计软件均兼容该类型文件），同时该模块具有滤掉低频率物种的功能●PrCoord

4、：对特定数据集进行主坐标分析以及冗余分析三统计方法这里只简要阐述CANOCO具有的统计分析方法，不做赘述，后面章节将详细论述操作步骤。主要分析方法有以下四大类型：A非约束型排序方法（Unconstrainedordinationmethods）主成分分析（Principalcomponentsanalysis，PCA）对应分析（Correspondenceanalysis，CA）降趋对应分析（去趋势对应分析）（Detrendedcorrespondenceanalysis，DCA）主坐标分析（Princi

5、palcoordinatesanalysis，PCoA或PCO）B约束性排序方法（Constrainedordinationmethods）冗余分析（Redundancyanalysis，RDA）典型对应分析（典范对应分析）（Canonicalcorrespondenceanalysis，CCA）降趋典范对应分析（Detrendedcanonicalcorrespondenceanalysis，DCCA）典型变量分析（Canonicalvariateanalysis，CVA）distance-basedr

6、edundancyanalysis(db-RDA)C非约束性偏分析法（Partialmethodsofunconstrainedordination）partialPCA、partialCA、partialDCA2D约束性偏分析法（Partialmethodsofconstrainedordination）partialRDA、partialCCA、partialDCCA、partialCVA四软件模块界面介绍CanocoforWindows模块进入软件后会出现图1-1界面，红色矩形所标记部分为快捷工具栏

7、，鼠标做短暂停留会有英文提示出现，不再赘述。左侧的ProjectView窗口是数据指定，分类类型选择等一系列功能设置的引导窗口，按步骤操作即可；右边LogView窗口用来记录分析过程和部分统计结果（如四个排序轴统计结果、轴与环境因子的相关性、蒙特卡罗检验结果等），其他一些分析结果（如物种、环境因子及样方坐标等）均保存在相应的*.sol文件中，该文件可以用记事本打开。图1-1CanocoforWindows模块界面窗口WCanolmp模块该模块在核心模块中没有快捷激活命令，必须常规方式打开。进入后界面如图1

8、-2，上边红色框标记部分是关于如何使用该模块的简短说明，下面部分是可选框。一般情况下在Excel中组织原数据时，以行代表样方，以列代表变量，这时第一个选择框就不需选择；Excel中组织数据时如果没有将第一行第一列作为样方名行和变量名列，则需要选择第二和第三选择框，这样该模块会自动为导入的数据添加样方名和变量名；最后一个选择框可以不用理会，采用默认的不选择状态。设置完成后点击保存按钮，在弹出的对话框中命名并选择存放位置，即可将剪