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1、西南农业学报2002年15卷4期106SouthwestChinaJournalofAgriculturalSciencesVol115No14文章编号:1001-4829(2002)04-0106-04SSR分子标记的开发技术研究进展122唐荣华,张君诚,吴为人(11广西农业科学院经济作物研究所,广西南宁530007;21福建农林大学作物科学学院,福建福州350002)摘要:综述简单重复序列标记(SSR)的特点及在作物遗传图谱构建、品种鉴定及分子标记辅助育种等方面的应用价值。重点描述开发SSR标记的两种方法的基
2、本原理和主要步骤,一种是通过克隆酶切片段和大量测序寻找SSR标记的传统方法,一种是应用SAGE原理不需要克隆的STMP技术。介绍这两种方法在创建小麦或大豆SSR标记中的应用。它们都能有效地开发可扩增出特定位点SSR的PCR引物。关键词:SSR;分子标记;引物开发中图分类号:S188文献标识码:AProgressinthewaytodevelopSSRmolecularmarkerTANGRong2hua1,ZHANGJun2cheng2,WUWei2ren2(1.ResearchInstituteofCashCr
3、ops,GuangxiAcademyofAgriculturalSciences,NanningGuangxi530007,China;2.CollegeofCropScience,FujianAgriculture&ForestryUniversity,FuzhouFujian350102,China)Abstract:Thecharacteristicsofsimplesequencerepeats(SSR)anditsimportanceingeneticmapping,varietyidentifying
4、andmolecularmarker2assistantbreeding,etc,arediscussedinthisarticle.AndtwowayswhichcandevelopSSRmolecularmarkerswiththeirbasicprinci2plesandmainstepsarealsoshowninthisarticle.Oneisthetraditionalwaywhichneedsagreatnumberofcloningofenzyme2cutDNAfragmentsandagrea
5、tdealofsequencing,theanotherisanewwaywhichcaneliminatethecloningstepandcanreducemuchmoreworkofsequencingbythebasicprincipleofserialanalysisofgeneexpression(SAGE).TheutilityofthesetwowaysinthedevelopmentofbreadwheatorsoybeanSSRisshown.Theresultsshowedthattheyw
6、ereeffectiveinthedesigningofPCRprimerstoamplifylocus2specificSSR.Keywords:SSR;molecularmarker;primerdevelopment所有真核基因组中均含有一类DNA碱基序微卫星可在多个等位基因间显示差异,因而在作物[1]列,被称为微卫星(LITTandLUTY1989)或简单的遗传图谱构建,遗传多样性发析,亲缘关系鉴定,[2]重复序列(SSRs)(TAUTZetal.1986),它们均由DNA指纹图谱构建,品种鉴定,QTL分
7、析及分子辅1~6个碱基组成的基本序列串连而成,不同等位基助育种中均具有公认的优越性及应用前景。这一分因间的重复数存在丰富的差异,因而是许多真核基子标记的特殊性及重要性在于其有以下特征:¹均因组中普遍存在的遗传标记来源(WANGetal.匀,随机,广泛地分布于水稻、大麦、小麦、大豆等多[3]1994)。微卫星分析的主要技术是聚合酶链式反种作物基因组中。ºSSR序列的两侧顺序常较保应(PCR),比之限制性片段长度多态性(RFLP)分析守,在等位基因间多相同。»多数SSR无功能作容易得多,而且易于分析自动化。在植物当中
8、,微卫用,增加或减少几个重复序列的重复数不影响生物星已被证明在很多物种中是高信息量的,并且是位的正常生长发育,因而在品种间具广泛位点变异,比点特异的分子标记(CONDITandHUBBELL1991,RFLP及RAPD分子标记更具多态性,尤其对花生、[4~6]PROVANetal.1996,SMULDERSetal.1997)。由于六倍体小麦等用常见分子标记技术检测不出很
