转录因子DNA结合位点预测分析

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1、转录因子DNA结合位点预测分析DNS-氨基酸的双向聚酰胺薄膜层析凝胶层析分离血红蛋白与鱼精蛋白DNA亲和层析分离目标转录因子蛋白综合性设计性实验-7此实验共包括如下三个部分第一部分，转录因子DNA结合位点预测分析第二部分，DNS-氨基酸的双向聚酰胺薄膜层析、凝胶层析分离血红蛋白与鱼精蛋白第三部分，DNA亲和层析分离目标转录因子蛋白第一部分，转录因子DNA结合位点预测分析基因表达的调控关键在于转录起始水平的调控。转录因子结合位点的预测是研究基因转录调控的重要环节。准确的预测将有助于人们认识和研究不同转录因子对目标基因的转录调控的时空性。http://

2、www.gene-regulation.com/pub/programs.html第二部分，DNS-氨基酸的双向聚酰胺薄膜层析凝胶层析分离血红蛋白与鱼精蛋白背景层析法也称色谱法，是1906年俄国植物学家MichaelTswett发现并命名的。他将植物叶子的色素通过装填有吸附剂的柱子，各种色素以不同的速率流动后形成不同的色带而被分开，由此得名为“色谱法”（Chromatography)。后来无色物质也可利用吸附柱层析分离。英国生物学家Martin和Synge。他们首先提出了色谱塔板理论。1944年出现纸层析以后，层析法不断发展，相继出现薄层层析、亲和

3、层析、凝胶层析、气相层析、高压液相层析等。叶绿素通过碳酸钙管柱所形成的色谱图层析的两种相固定相：固定相是层析的一个基质。它可以是固体物质（如吸附剂，凝胶，离子交换剂等），也可以是液体物质（如固定在硅胶或纤维素上的溶液），这些基质能与待分离的化合物进行可逆的吸附，溶解，交换等作用。流动相：在层析过程中，推动固定相上待分离的物质朝着一个方向移动的液体、气体或超临界体等，都称为流动相。在柱层析中一般称为洗脱剂，薄层层析时称为展层剂。层析法是利用混合物中各组分物理化学性质的差异（如吸附力、分子形状及大小、分子亲和力、分配系数等），使各组分在两相（一相为固定

4、的，称为固定相；另一相流过固定相，称为流动相）中的分布程度不同，即各组分所受的固定相的阻力和流动相的推力影响不同，从而使各组分以不同的速度移动而达到分离的目的。按层析过程的机理分类：分配层析:根据不同组分在不同溶剂中分配系数不同而使物质分离的方法称为分配层析。吸附层析:吸附是两相成一界面，溶质在表面密集的现象。以吸附剂为固定相，根据待分离物与吸附剂之间吸附力不同而达到分离目的的一种层析技术称为吸附层析。常用吸附剂：活性碳、硅。离子交换层析:是以离子交换剂为固定相，根据物质酸碱度、极性和分子大小差异而将物质予以分离的一种方法。凝胶层析（分子筛）利用凝

5、胶颗粒形成具有三维空间多孔性网络结构的物质，不带电荷，可起滤过或“筛”的作用。亲和层析是利用生物分子间所具有的专一性亲和力的层析技术。层析法分类层析法分类按两相所处的状态分类：流动相有两种状态：液体作为流动相气体作为流动相固定相也有两种状态：固体吸附剂作为固定相以吸附在固体上的液体作为固定相按两相所处的状态分为：液相层析和气相层析流动相固定相液体（液相层析)气体（固相层析）液体液-液层析气-液层析固体液-固层析气-固层析层析法分类名称操作形式适用范围柱层析将固定相装于柱内，使样品沿一个方向移动而达到分离的目的。柱层析是常用的层析形式，适用于大量样品

6、分析、分离。生物化学中常用的凝胶层析、离子交换层析、亲和层析、高效液相色谱等都通常采用柱层析形式。薄层层析将适当粘度的固定相均匀涂铺在薄板上，点样后用流动相展开，使各组份分离薄层层析主要适用于小分子物质的快速检测分析和少量分离制备，通常为一次性使用。按操作形式不同分类：吸附层析原理：任何两个相都可以形成表面，其中一个相的物质或溶解在其中的溶质在此表面密集现象称为吸附，利用吸附剂对不同物质具有不同吸附力使混合物得到分的现象就叫吸附层析。凡能将其他物质聚集到自己表面的物质称吸附剂，包括硅皮、氧化铝、活性炭、淀粉、纤维素及陶土，而聚集于聚集于吸附剂表面的

7、物质称被吸附剂。吸附剂与被吸附剂之间的作用除了物理作用外，还有化学作用，如DNS-氨基酸双向聚酰胺薄膜层析时中被分离的物质之所以能吸附在聚酰胺薄膜上就是由于二者之间形成氢键。分配层析技术（液-液层析法）原理：利用混合物在两种不相混溶的液相（固定相和流动相）之间的分配系数的不同而达到分离各组分的目的。纸层析是最广泛的一种分配层析。特点：液-液层析法适合于分离同系物或同分异构体分配层析技术分配系数小的溶质在流动相中分配的数量多，移动快；分配系数大的溶质在固定相中分配的数量多，移动慢。因此可彼此分开。分配系数主要与下列因素有关：①被分离物质本身的性质；②

8、固定相和流动相的性质；③层析柱的温度。相关的概念（一）：分配系数：当一种溶质分布在两个互不相溶的溶剂中时，它在固定相和流动