YRDC在肺癌中的表达及其功能分析.pdf

《YRDC在肺癌中的表达及其功能分析.pdf》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、硕士学位论文YRDC在肺癌中的表达及其功能分析THEEXPRESSIONANDFUNCTIONANALYSISOFYRDCINLUNGCANCER李元龙哈尔滨工业大学2018年6月国内图书分类号：Q71学校代码：10213国际图书分类号：577.21密级：公开理学硕士学位论文YRDC在肺癌中的表达及其功能分析硕士研究生：李元龙导师：李钰教授申请学位：理学硕士学科：生物学所在单位：生命科学学院答辩日期：2018年6月授予学位单位：哈尔滨工业大学ClassifiedIndex:Q71U.D.C:577.21Dissertat

2、ionfortheMasterDegreeinEngineeringTHEEXPRESSIONANDFUNCTIONANALYSISOFYRDCINLUNGCANCERCandidate：LiYuanlongSupervisor：Prof.LiYuAcademicDegreeAppliedfor：MasterofScienceSpeciality：BiologyAffiliation：SchoolofLifeScience&TechnologyDateofDefence：June,2018Degree-Conferrin

3、g-Institution：HarbinInstituteofTechnology哈尔滨工业大学理学硕士学位论文摘要探究功能未知基因在肿瘤中的表达和功能，有助于了解该基因对肿瘤发生发展的影响及其分子机制，对指导癌症治疗具有重要意义。课题组前期研究发现c1orf109所在染色体1p34.1区域存在基因协同共表达特性，YRDC为其中的一个在癌症中预测高表达的基因，该基因命名为YRDC（yrdCN6-threonylcarbamoyl-transferasedomaincontaining），但生物学功能仍不清楚。本论文在前期

4、研究的基础上，重点分析了YRDC基因在肺癌中的表达情况，检测了YRDC基因对肺癌细胞生物学功能的影响，并初步探究了YRDC基因编码蛋白可能的生物学功能。首先，利用生物信息学分析并结合TCGA数据库，研究了YRDC基因在肺癌病例组织中的表达，分析其与不同临床分期、性别、年龄以及吸烟习惯表达关系，进而检测YRDC基因在肺癌细胞系的表达。随后，构建YRDC基因低表达细胞株和YRDC过表达细胞株，观察了YRDC基因肺癌细胞的增殖，迁移和侵袭能力的影响。最后，利用生物信息学预测YRDC相互作用蛋白及其在临床肺癌组织中的表达，并通过

5、构建YRDC原核表达载体，表达纯化YRDC蛋白，进一步确定YRDC蛋白的生物学活性。结果表明，YRDC基因非小细胞肺癌中高表达，但与临床分期、性别、年龄和吸烟习惯无显著差异；YRDC基因在表达下调时，细胞的增殖、迁移和侵袭受到了抑制，而过表达YRDC能促进肿瘤细胞的增殖、迁移和侵袭。YRDC同源结构分析显示，人源YRDC与大肠杆菌的YRDC蛋白结构相似度较低，提示它们的生物学特性可能不同。相互作用蛋白预测分析结果提示，YRDC存在多个相互作用分子，相互作用蛋白预测分析结果提示，YRDC存在多个相互作用分子，其中UPP1、

6、VPS29、TMSB10以及OSGEPL1等蛋白分子在肺癌组织样本中与YRDC存在共表达，由此为进一步的深入研究奠定了基础。蛋白活性检测发现，YRDC具有tRNA修饰所必需的ATP酶活性，并且显著高于大肠杆菌的YRDC蛋白。综上所述，本研究结果证实YRDC基因在肺癌中高水平表达，并且YRDC基因的表达变化能够影响肿瘤细胞的生物学特性，人类的YRDC基因编码蛋白具有tRNA修饰的活性，其分子机制可能和蛋白质的翻译相关。关键词：YRDC；tRNA修饰；细胞增殖；细胞迁移；细胞侵袭-II-哈尔滨工业大学理学硕士学位论文ABST

7、RACTStudyingtheexpressionandfunctionofgenesincancercanhelpusunderstandtheimpactofcancergenesandthemechanismsofcancerdevelopment.Itisofgreatsignificancetoguidecancertreatment.Inthestudyofcancergenec1orf109inhumanchromosome1p34.1,foundthatgenesinthisregioncanexpres

8、stogether.YRDC(namedyrdCN6-threonylcarbamoyl-transferasedomaincontaining)isoneofthesegenesinthisregionwhichpredictedtobehighlyexpressedincancer,butit’sbiologyf