桉树高密度遗传图谱构建及生长和材性相关qtl解析

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1、分类号S722密级公开UDC学位论文桉树高密度遗传图谱构建及生长和材性相关QTL解析ConstructionofDenseGeneticMapsinEucalyptusandDetectionofQuantitativeTraitLoci(QTLs)forGrowthandWoodPropertyTraits于晓丽指导教师姓名甘四明申请学位级别博士专业名称林木遗传育种研究方向林木分子育种论文提交日期2015年5月论文答辩日期2015年6月学位授予日期2015年7月答辩委员会主席评阅人北京·中国林业科学研究院学位论文桉

2、树高密度遗传图谱构建及生长和材性相关QTL解析学位论文作者于晓丽指导教师姓名甘四明研究员指导小组成员翁启杰高级工程师申请学位级别农学博士专业名称林木遗传育种研究方向林木分子育种论文答辩日期2015年6月中国·北京DissertationfortheDegreeConstructionofDenseGeneticMapsinEucalyptusandDetectionofQuantitativeTraitLoci(QTLs)forGrowthandWoodPropertyTraitsCandidate:XiaoliYu

3、Supervisor:Prof.SimingGanAssociateSupervisor:AssociateProf.QijieWengAcademicDegreeAppliedfor:Ph.DSpeciality:ForestTreeGeneticsandBreedingDateofDefence:June2015Degree-conferring-institution:ChineseAcademyofForestry独创性声明本人声明所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行的研巧工作及取得的研究成果。尽

4、我所知［ｉｕ示注和致谢的地方外，论文中不包含其他人己经发表，除了文中特别加或撰写过的研充成果，也不包含为获得本研巧生培养单位或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确。与我的说明并表示谢意。学位论文作者签名：：日期地＾月日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解中国林业科学研究院有关保留、使用学位论文的规定，中国林业科学研究院有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅。本人授权中国林业科学研究院

5、可将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可Ｗ采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。（保密的学位论文在解密后适用本授权书）？一＾学位论文作者签名：而导师签名：／＾＾＾７谷月备心＇Ｊ：年ｉ月曰啤曰？摘要高密度遗传图谱和数量性状位点(Quantitativetraitlocus,QTL)定位是基因组学和分子育种研究的有力工具。桉树是全球范围内广泛种植的阔叶树种。本研究致力于桉树遗传图谱构建和重要性状的QTL定位，作图树种为尾叶桉(Eucalyptusurophylla)和细

6、叶桉(E.tereticornis)，作图标记包括多态性阵列技术(Diversityarraytechnology,DArT)以及基于表达序列标签(Expressedsequencetag,EST)的简单序列重复(Simplesequencerepeat,SSR，也称微卫星)、插入/缺失(Insert-Deletion,InDel)、切割扩增多态性序列(Cleavedamplifiedpolymorphicsequence,CAPS)和单核苷酸多态性(Singlenucleotidepolymorphism,SNP)

7、，QTL定位的性状包括树高、胸径、木材基本密度和纤维素含量。主要内容如下：(1)尾叶桉和细叶桉树高、胸径和木材密度的初步定位。对于树高(10、23、32、44和56月生)、胸径(23、32、44和56月生)和56月生木材密度，在课题组前期构建的基于DArT标记的两树种遗传图谱上，共有31个和22个QTLs分别定位于尾叶桉的9个连锁群和细叶桉的4个连锁群。有12个区域影响多个性状，未重叠的独立QTL区域共有27个，其中15个在尾叶桉连锁群上、12个在细叶桉连锁群上。每个表型性状在图谱上都有1到4个QTLs，LOD范围从

8、3.4到7.1。这些QTL解释了各自性状表型变异的8.3%到18.9%。生长和木材密度的QTL通常是相互独立的。对于56月生树高、胸径和木材密度，通过比较QTL的置信区间和巨桉(E.grandis)基因组序列，发现单个QTL有2–560个位置候选基因。(2)利用GenBank中的桉树EST序列新开发了144个EST-InDel标记。在作图亲本尾