石斛高密度遗传图谱构建及茎总多糖含量QTL定位.pdf

《石斛高密度遗传图谱构建及茎总多糖含量QTL定位.pdf》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、分类号：Q341单位代码：10346密级：学号：2015111010066硕士学位论文（学术学位）中文论文题目：石斛高密度遗传图谱构建及茎总多糖含量QTL定位英文论文题目：High-densitygeneticmapconstructionandSTPCrelatedQTLmappingforDendrobium申请人姓名：刘玉洋指导教师：王慧中合作导师：卢江杰专业名称：遗传学研究方向：药用植物分子生物学所在学院：生命与环境科学学院论文提交日期2018年3月杭州师范大学硕士学位论文致谢致谢杭州师范大学

2、，初见你时，犹如烟雨中的江南，充满着神秘，如今却要离开，却要说再见，心中多有不舍。三年时间如白驹过隙，当初的懵懂少年已有些许成熟，当初的迷茫已变为坚韧向前的步伐。在浙江省药用植物种质改良与质量控制技术重点实验室王慧中老师、卢江杰老师的耐心指导下，我顺利完成硕士毕业论文的撰写、修改等工作。在学习上，王老师渊博的学识、严谨的科研精神将一直激励着我，勇敢的面对遇到的任何困难，任何时候都不要轻言放弃；在卢老师的帮助下，我学会了设计实验以及相关实验操作。在生活上，老师们勤俭节约、热爱生活、积极向上的生活态度指引

3、着我更加珍惜现在拥有的一切，积极面对生活中的各种问题，更好的提高自己！感谢王老师和卢老师的谆谆教诲，也感谢实验室应奇才老师、冯尚国老师的在实验过程中提供的帮助，当然也不会忘记邱胜师姐、雷欢欢师姐、姜梦莹师姐、薛洁师姐、孙涛师兄、方雷师兄的关心和爱护，谢谢你们让我在杭州师范大学感受到了家一样的温暖。同窗好友郭宏、郭康、焦凯丽、左紫薇，师妹刘朋丽、师弟何金宇，也谢谢你们的帮助，能跟你们一起生活、学习，真的很快乐。试验田里的挥汗如雨，实验室里的辛勤劳动，休息室里的欢声笑语，多年以后仍会历历在目。感谢我最可爱

4、的父亲、母亲！不论是炎炎夏日，还是烈烈寒风，辛勤劳作的你们从不抱怨，从不放弃，你们默默地为我付出了那么多，却不图回报。在我心里你们才是最勇敢、最坚强、最可爱的人！最后，将高适的一句诗送给自己，莫愁前路无知己，天下谁人不识君！刘玉洋2018年3月Ⅰ杭州师范大学硕士学位论文摘要摘要石斛是兰科植物的一种，具有很高的观赏价值和药用价值，其有效活性成分为多糖、生物碱、黄酮、酚类和苄基化合物等。研究石斛茎总多糖含量(STPC)在石斛种间的遗传基础，对了解石斛多糖的代谢途径及相关基因的调控过程具有重要意义。开发多糖

5、含量高、鲜食口感好、抗虫、耐旱的石斛新品种，一直是石斛育种研究的重点内容之一。然而，传统的石斛杂交育种方法不仅工作量大、成本高，而且周期长、效率低，影响了优质石斛新品种的培育。利用高通量测序技术，绘制石斛连锁图谱，并对石斛重要数量性状进行QTL定位，可为石斛的分子育种研究提供重要依据。本研究构建了可用于重要性状QTL定位的石斛F1代遗传群体，利用SLAF-seq技术对石斛双亲及其杂交后代进行简化基因组高通量测序，开发了大量石斛全基因组多态性SNP标记，绘制了第一张石斛高密度遗传图谱，并对石斛STPC进

6、行了QTL定位。主要研究结果如下：1、将较低STPC的细茎石斛作为母本，较高STPC的铁皮石斛(两者均为2n=38)作为父本，构建了石斛F1代杂交群体，随机挑选111个有足够生物量进行SNP分型和STPC含量生化检测的单株用于实验。2、利用SLAF-seq技术，我们从1,503,626个高质量的SLAF标记中鉴定出7,013,400个SNPs。母本石斛的的测序深度为168.42×，父本石斛的测序深度为158.86×，子代平均测序深度为41.91×。多态性SNP标记有398,083个，用于绘制石斛遗传图

7、谱的标记有8,573个，覆盖了19条连锁群(LGs)，总图距为2,737.49cM，平均图距为0.32cM。3、利用MapQTL软件的区间作图法对石斛STPC数据进行分析，在遗传图谱上定位到11个与STPC相关的QTL。通过与铁皮石斛参考基因组序列比对，在9个QTL的置信区间内有候选基因并且进行了基因注释。本研究绘制了第一张石斛高密度遗传图谱，并完成了石斛STPC相关的QTL定位，为后续石斛碱、黄酮、酚类等石斛重要活性成分相关的QTL定位奠定基础，对其他药用植物的分子杂交育种也具有重要的参考价值。关键

8、词：石斛；遗传连锁图谱；多糖；数量性状位点(QTL)；SNPⅡ杭州师范大学硕士学位论文AbstractAbstractDendrobiumspeciesareorchidplantswithabroadrangeoftherapeuticeffects,themainactiveingredientsarepolysaccharide,alkaloids,flavones,phenols,andbenzyl.Tounderstandthegeneticb