烟草脉带花叶病毒和马铃薯a病毒hc-pro调控rna沉默抑制、协生和致病力的机制

烟草脉带花叶病毒和马铃薯a病毒hc-pro调控rna沉默抑制、协生和致病力的机制

ID:34123106

大小:21.21 MB

页数:111页

时间:2019-03-03

上传者:U-24835
烟草脉带花叶病毒和马铃薯a病毒hc-pro调控rna沉默抑制、协生和致病力的机制_第1页
烟草脉带花叶病毒和马铃薯a病毒hc-pro调控rna沉默抑制、协生和致病力的机制_第2页
烟草脉带花叶病毒和马铃薯a病毒hc-pro调控rna沉默抑制、协生和致病力的机制_第3页
烟草脉带花叶病毒和马铃薯a病毒hc-pro调控rna沉默抑制、协生和致病力的机制_第4页
烟草脉带花叶病毒和马铃薯a病毒hc-pro调控rna沉默抑制、协生和致病力的机制_第5页
资源描述:

《烟草脉带花叶病毒和马铃薯a病毒hc-pro调控rna沉默抑制、协生和致病力的机制》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在学术论文-天天文库

山东农业大学博士学位论文烟草脉带花叶病毒和马铃薯A病毒HC--Pro调控RNA沉默抑制、协生和致病力的机制姓名:王洁申请学位级别:博士专业:植物病理学指导教师:李向东20120611 山东农业大学博:}:学位论文中文摘要马铃薯Y病毒属病毒编码的辅助成分.蛋白酶(Helpercomponent.proteinase,lIC—Pro)是一种多功能蛋白,参与病毒的蚜传、症状表达、基因组复制、移动、抑制RNA沉默,以及与其他属病毒的协生等过程。本文利用不同体系分析了烟草脉带花叶痫群(7bbaccoveinbandingmosaicvirus,TVBMV)和马铃薯A病毒(PotatovirusA,PVA)l—IC.Pro不同突变对RNA沉默抑制、协生活性和致病力的影响,明确马铃薯Y病础属病毒HC.Pro调控这些过程的机制,为利用弱毒株系防治TVBMV提供物质基础和础沦指导。本研究主要研究结果如下:构建了包含pCaGFP、pCahpGFP和pCaHC(含有TVBMVHC—Pro基因)三个载体的RNA沉默抑制瞬时表达分析体系,并利用此体系比较了TVBMVHC.Pro野生型和18个突变体的抑制RNA沉默活性,这些突变体抑制RNA沉默的活性分为四类:(1)5个突变体抑制RNA沉默活性升高;(2)5个突变体抑制RNA沉默活性不变;(3)2个突变体抑制RNA沉默活性降低;(4)6个突变体丧失了抑制RNA沉默活性。用抑制RNA衫C默活性强的突变体浸润本氏烟叶片中GFP蛋白的表达量更大,而用抑制RNAj!『C默活性挺失的突变体浸润的本氏烟叶片中检测不到GFP蛋白的表达。利用pAGFP、pAhpGFP和pAHC(含有PVAHC-Pro基因)三个载体构成的瞬时农达体系研究了PVAHC.Pro突变对其抑制RNA沉默活性的影响。结果表明,9个突变休的抑制RNA沉默活性降低,另外9个突变体丧失了抑制RNA沉默活性。相同的突变对TVBMV和PVA两种病毒HC.Pro抑制RNA沉默活性的影响不同,如TVBMVlIC.Pro突变体D198A抑制RNA沉默活性降低,而PVAHC.Pro相同突变体丧失了抑制RNA沉默活性。第6位保守氨基酸F缺失后,PVAHC.Pro抑制RNA沉默活性降低,Iflf,1’V13MVHC.Pro抑制RNA沉默活性丧失。携带野生型HC.Pro的马铃薯X病毒(PotatovirusZPVX)侵染性克隆接种本氏炽I后引起{!I.f株的系统坏死。利用PVX载体研究了TVBMV和PVAHC—Pro突变对协生作J11的jI够I礼’FVBMVHC.Pro的6个突变体在本氏烟上不引起坏死症状,另外12个突变体oJ野生型IIC.Pro一样在本氏烟上引起坏死症状。TVBMVHC.Pro丧失抑制RNA杉C:|扶活性的突变都同时世失了协生作用,表明TVBMVHC.Pro这两种功能间具有相关性。PVAHC.Pro的11个突变体失去了协生功能,其中、9个突变体丧失了抑制RNA沉默沂性,2个突变体抑制RNA沉默活性降低。 烟革脉带化叶病毒和马铃薯A病毒HC.Pro调控RNA沉默抑制、协生和致炳力的机制利用携带GFP的TVBMV侵染性克隆pCaTVBMV-GFP测定了HC.Pro17个突变对‘I’VBMV致病力的影响。野生型pCaTVBMV-GFP在本氏烟上能够引起脉明、花叶、畸形和械株矮化等症状,在紫外灯下表现出明显的绿色荧光。突变体EITC、AGS和SQN表现脉明及叶片畸形症状,与野生型TVBMV症状一致,说明这些位点的突变对病毒的致病力无影响。突变体PAK、D198Y、D198F和D198G在接种后第8天症状表现轻微f门脉明,但后期症状与野生型病毒相似,说明这些位点的突变延迟了症状的产生。突变体APS、D198H、D198R、D198K、FINK、F6Del、D198A、DEN、IQI和ART接种的{!lJ【株初期仅表现脉明症状。紫外灯下观察发现,症状明显的植株都表现出较明显的绿色荧光,而症状变轻的突变体中,D198R初期荧光强度与野生型病毒一致,其余突变体仪染植株均表现较微弱的绿色荧光。抑制RNA沉默丧失的6个突变体致病力都减弱,酏I刃I·IC.Pro抑制RNA沉默活性与病毒致病力之间存在相关性。关键词:烟草脉带花叶病毒;马铃薯A病毒:HC.Pro:定点突变;抑制RNA沉默;协生作用:致病力:农杆菌共浸润:马铃薯Y病毒属2 山东农业大学博:J:学位论文MechanismoftobaccoveinbandingmosaicvirusandpotatovirusAHC—ProregulatingRNAsilencingsuppression,synergismandvirulenceAbstractThchclpercomponent-proteinase(HC-Pro)encodedbypotyvirusesisamultifunctionalproteininvolvedinmanyprocessesinlifecycle,includinggenomeamplification,movement,symptomexpression,aphidtransmission,RNAsilencingsuppressionandsynergismwithvirusesofothergenus.Inthepresentstudy,weanalyzedtheeffectsofdifferentmutantsofpotatovirusA(PVA)andtobaccoveinbandingmosaicvirus(TVBMV)HC.ProontheactivitiesofRNAsilencingsuppression(RSS),synergism,andvirulence.Themainresultsreadasfollows.WcfirstconstructedatransientassaysystemforRNAsilencingsuppressionthatincludesthreevectors,pCaGFP,pCahpGFPandpCaHC(carryingTVBMVHC.Progene).Withthissystem,wedeterminedtheactivitiesofwildtypeand18mutantsonRSS.TheRSSactivitiesofTVBMVHC—Promutantswereclassifiedintofourcategories:(1)Fivemutantsshowcdincreasedactivity;(2)FivemutantsshowedsimilarRSSactivitywithwildtype1IC·pro;(3)Twoshowedreducedactivity;(4)SixlostRSSactivitycompletely.MoreGFPWaSdctcctcdinNicotianabenthamianaleafpatchesagroinfiltratedTVBMVHC—PromutantsthatshowedstrongerRSSactivity.ThereisnoGFPdetectedinⅣbenthamianaleafpatchesagoinfiltratedTVBMVHC-PromutantsthatlosttheirRSSactivity.1’hcRSSactivitiesofwildtypeand18mutantsofPVAHC—Prowerecomparedusingthreevectors,pAGFP,pAhpGFPandpAHC(carryingPVAHC.Progene).TheresultsshowedthatninemutantsshowedreducedRSSactivities,andtheotherninemutantslosttheirRSSactivities.SamemutationmayshowdifferenteffectsonRSSactivityindifferentviruses.Forexamples,themutationD198ApartiallyreducedtheRSSactivityofTVBMV1IC-Pro,butabolishedthatofPVAHC-Pro;F6DelreducedtheRSSactivityofPVAHC.Pro,butabolishedthatofTVBMVHC—Pro.RecombinantPVXvectorscarryingTVBMVandPVAHC.Progenewillresultin 烟华:脉带花叶稍毒和马铃薯A病毒HC.Pro调控RNA沉默抑制、协生和致病力的机制systemicnecrosisofⅣbenthamianaplants.ThesamemutationsofTVBMVandPVA1IC—Progenewereanalyzedfortheirsynergismactivity.TwelvemutantsofTVBMVHC—Proresultedinsystemicnecrosisasthewildtypeone,whileothersixmutantsjustinducedmosaic.’l'hemutationsinTVBMVHC—ProgenethatabolishedRSSactivityalsolostthesynergismactivity,indicatingtheassociationbetweenthesetwofunctions.ElevenPVA1IC一1’romutantslosttheirsynergismactivity,amongwhichninelosttheirRSSactivityandtwoshowedreducedRSSactivity.Theeffectsofl7TVBMVHC—PromutantsonthevirulenceofTVBMVwereanalyzedwithpCaTVBMV-GFP,aninfectiousclonecarryingJpgene.AswildtypepCaTVBMV-GFP,mutantsEI'I’C,AGSandSQNinducedveinclearing,mosaicandmalformationinⅣbenlhamianaplants,implyingthatthesemutationshadnoeffectonvirulenceofTVBMV.MutantsAPS,PAK,DI98YD198FandD198Gshowedslightveinclearing8dpiandsimilarsymptomaSwildtypeviruslater,implyingthatthesemutationsjustdelayedthesymptomexpression.MutantsD198H,D198R,D198K,FINK,F6Del,D198A,DEN,IQIandARTinducedslightsymptomonN.benthamianaplants,fromwhichonlyweakfluorescencewasobserved.ThemutantsthatshowedabolishedRSSactivityalsoshowedreducedvirulence,implythesetwoprocesseswerecloselyrelated.Keywards:Tobaccoveinbandingmosaicvirus;potatovirus么;HC-Pro;RNAsilencingsuppression;Synergism;Virulence;Agrobacteriumco-infiltration;Potyrvirus}4 本研究受国家自然科学基金(30971895、3047138)资助 ASBCIPbpBSACbCPDEPCDIGDMSOdNTPdpidsRN人EDCELlSAGFPGUSIl(:.ProhpRNAKankDaI。BMESMOPSNBTntPVAacetosyringone符号说明5-Bromo··4··chloro··3··indolylphosphatep-toluidinesaltbasepairbovineserumalbumenCarbenicillincoatprotein.diethelpyrocarbonatedigoxigenindimethylsulfoxidedeoxyribonucleosidetriphosphatedayspostinoculationdoublestrandRNA乙酰丁香酮5.溴.4.氯.3.吲哚基磷酸酯对甲苯胺盐碱基对牛血清蛋白羧苄青霉素外壳蛋白焦碳酸二乙酯地高辛二甲基亚砜脱氧核糖核苷三磷酸接种后天数双链RNAl-Ethyl.3.(3-dimethylaminopropyl)carbodiimidel-(3·二甲氨基丙基)·3·乙基碳二亚胺盐酸盐Enzyme-linkedImmunosorbentAssaygreenfluorescentprotein13-Glucuronidasehelpercomponent·proteinasehairpinRNAkanamycin‘。kilodaltonLuria.Bertanimedium2-(N-Morpholino)ethanesulfonicacid3-fN-morphplino)propanesulfonicNitrotetrazoliumBluechloridenucleotidePotatovirusA酶联免疫吸附测定绿色荧光蛋白13.葡萄糖苷酸酶辅助成分.蛋白酶发夹RNA卡那霉素千道尔顿LB培养基2-(N一吗啉)-乙基磺酸3-洲-吗啉代)丙磺酸氮蓝四唑核营酸马铃薯A病毒 PVPPVXRdRpRifRISCRNAir/rainRT--PCRSDSSiRNASpSSC7I’cpolyvinylpyrrolidone尸otalovirusXRNA-dependentRNApolymeraserifampicinRNAinducedsilencingcomplexRNAinterferencerevolutionsperminute聚乙烯吡咯烷酮马铃薯X病毒依赖于RNA的RNA聚合酶利福平RNA诱导的沉默复合体RNA干扰转|食Reversetranscriptase—polymerasechainreaction反转录酶-聚合酶链式反应sodiumdodecylsulfatesmallinterferingRNAspectinomycinstandardsalinecitratetetracyclineTVBMVTobaccoveinbandingmosaicvirusUTRuntranslatedregion十二烷基硫酸钠小干扰RNA壮观霉素标准柠檬酸盐溶液四环素烟草脉带花叶病毒非翻译区 山东农业火学博士学位论文1前言马铃薯Y病毒科(Potyviridae)马铃薯Y病毒属(Potyvirus)是侵染植物最大的属(洪健等,2005)。该属病毒主要以蚜虫通过非持久性方式传播,能在世界范围内引起刁i同寄主植物的病害,给农业生产带来巨大的危害。马铃薯Y病毒属病毒粒体为线状,长680"--'900nm,直径1l~15nm。其基因组由一个正单链RNA分子组成,长约10kb,袋_ffI『被2000个CP单位所包围。基因组编码一个大的开放阅读框(ORF),翻译成的多聚蛋白(340.370kDa)随即被病毒本身编码的三个蛋白酶切割成lO个成熟的蛋白,从N端到C端依次为:P1、HC—Pro、P3、6Kl、CI、6K2、NIa、NIb和CP,最近又托P3中发现了Fh+2移码产生的一个小的开放阅读框,命名为pipo(PrettyInterestingPotyviridaeORF)(Chung等,2008)。码铃薯Y病毒属病毒编码的辅助成分-蛋白酶(Helpercomponent—protease,HC—Pro)礼炳f臻的侵染循环过程中起着多种重要的作用,可以将HC.Pro分为三个区域:N端区域(AA1.100)、中间区域(AA100.300)、C端区域(AA>300)(Plisson等,2003:Urcuqui.Inchima等,2000)。N端半胱氨酸富集区被认为是类似锌指结构的金属结合基序(‘zinc.finger’-likemetal—bindingmotif),能够控制病毒的蚜传、症状的严重度、基冈纫l的扩增及病毒的积累(Atreya等,1992:Atreya等,1993;Canto等,1995;Yap等,2009),中间区域在病毒的长距离移动及维持病毒的正常复制中起作用外(Cronin等,1995),还参与抑制RNA沉默和介导与其他病毒的协生过程(Varrelmann等,2007)。(:端区域是一个类木瓜蛋白酶,能够催化自身从多聚蛋白上切割下来,并且能影响病毒的细胞IW移动(Urcuqui.Inchima等,2000;Urcuqui.Inchima等,1999),同时也参与抑删I喇A沉默(Varrelmann等,2007)。此外,HC.Pro还能够结合siRNA、自我互作及与20S核糖体互作等功能(Atreya等,1995;Ballut等,2005:Lakatos等,2006:Maia等,1996;Merai等,2006:Urcuqui.Inchima等,2001)。近年来人们比较了不同株系之M的序歹0,通过片段替换或者是进行定点突变,对HC.Pro中起关键作用的区域和氨坫酸位点进行了研究。1.1lIC.Pro参与病毒的蚜传1.1.1蚜传的机理绝大多数马铃薯Y病毒属病毒都是由蚜虫以非持久性方式传播。对于HC.Pro的蚜 烟t爷|j昧带化叶炳毒羽I马铃薯^病毒HC.ProiJ;d控RNA沉默抑制、协生和致病力的机制传作用模型,目前有两种解释,一个是HC。Pro在中问连接了病毒粒子和蚜虫口针(Govie等,1974)。另一种模型是HC—Pro作用于病毒粒子,决定了其能否直接与蚜虫口针结合(Pirone等,1996)。但是越来越多的证据还是支持“桥梁”假说。例如,李向东等(1999)训;明乇米矮花叶病毒(Maizedwa∥mosaicvirus,MDMV)HC—Pro既可以与病毒粒子结f},也可以直接与麦二叉蚜口针内一种分子量约为56kDa的蛋白互作,而病毒粒子不能直接与麦二叉蚜的口针结合,只能在HC.Pro的辅助下才能结合到蚜虫口针内病毒粒子的附着位点上(李向东等,2002)。马铃薯Y病毒(PotatovirusY,PVY)、烟草蚀纹病毒(Tabaccoetchvirus,TEV)、烟草脉斑驳病毒(Tobaccoveinmottlingvirus,TVMV)剁小西葫芦黄花叶病毒(Zucciniyellowmosaicvirus,ZYMV)研究的很多结果也都表19jIIC.Pro介导了蚜传过程时是在病毒粒子和蚜虫口针结合过程中起“桥梁”作用(Atreya-j≯,1993:Blanc等,1997;Govier等,1974:Peng等,1998:Syller,2006),直接作川¨坷毒粒子和蚜虫食道上颚表皮和前肠的结合过程(Syller,2006:Syller,2012)(图1—1)。,Ijjjj一一一一一一一一一一一。1一。一一一1一’一一一一一一一一一、一一一‘一一一。≥cell-surface厂//receptorsl/:}!::r÷/U∥玉({C图I·IHC-Pro在蚜虫1『:持久性传毒过程中的作JI=}j模型(Syller,2012)ljig.I一1Modelillustratingthefunctionofhelpercomponent·proteinase(HC-Pro)innonpersistenttransmissionofvirusesby.aphidvectors.(Syller,2012)诩:多研究证据证明HC—Pro在蚜传过程中结合病毒粒子和蚜虫口针的区域是不同的(夺向东等,2000)。目前已经确定KITC中K变为E后能影响病毒的蚜传(Goytia等,2006),可能的作用机制是这个突变影响了HC与病毒粒子和蚜虫口针的分别互作或者嗡纛t●●J●●l●●1^i●1I■■■■●!n¨¨¨¨“¨H、1.@c 山.东农业人学博士学位论文址。』曲楷的共同互作过程。PVY的非蚜传株系马铃薯C病毒(PotatovirusC,PVC)lI(:.Pro的KITC为为EITC,这一变化使其丧失了与蚜虫口针的结合能力,而不影响其维介粕椎f门农壳蛋白(CP)(Blanc等,1998)。综合以前的研究结果推测HC的N端区域址和蚜虫的口针相作用的,而与病毒粒子结合的区域可能位于HC的N端以外区域(Blanc等,1998)。1.1.2KITC基序与蚜虫口针结合90年代,随着越来越多的病毒的核苷酸序列被测定,很多在蚜传过程中起关键作川f门保j】:=』I《序也被鉴定出来。比较马铃薯Y病毒属病毒的蚜传株系和非蚜传株系PVClIC.Pro的氨基酸序列发现,两个保守的基序发生了变异:一个是PVY蚜传缺陷株系t'VC(PVYC)N.端的KITC(Thombury等,1990),另一个是ZYMVC.端的PTK(Granier等,1993;Huet等,1994)。并利用cDNA克隆构建突变体,检测了这些突变体的蚜传效率明确了这些基序对蚜传的影响。比较PVC、PVY和很多其他的马铃薯Y病毒属病,髯发现两个保守基序中的变化,一个是KITC中K突变为Q,另外一个是ID基序中Ile突变为Val(Thornbury等,1990:Granier等,1993)。TVMVHC—Pro的KITC基序中赖么C敝(K)变为谷氨酸(E)、.组氨酸(H)或者谷氨酰胺(Q)之后,使TVMV得HC.Pro。比火了蚜传效率,同时也能使TVMV的病毒积累量减少(Atreya等,1993)。比较PVY的蚜传缺陷性株系PVY-ONAT和野生型PVY-O发现PVY-O中KMTC中的K在PVY-ONA'I’中突变为N,这突变不影响HC.Pro的纯化和PVY症状的表达,仅仅使其丧失了蚜f簟活。Fk(Canto等,1995)。1.1.3P,I’K基序与病毒粒子结合IIuet等(1994)证明当PTK基序T(Thr)变为A(Ala)时,使ZYMV的蚜传效率基小个部丧失(Huet等,1994)。Peng等(1998)构建了HC的保守基序PTK的不同的突变体“叫Iyl’K的突变体能够影响蚜传效率,PTK参与了与HC.Pro与病毒粒子的结合过程fl'cng掷,1998)。比较m蚜化株系TVMV.NAT株系和蚜传株系AT的CP的序列,通过序列替换和蚜化枪测发现,CP的DAG基序中G突变为E,能影响病毒的蚜传,这是首次证明CP能参。』I'VY屈痛击的蚜传(Atreya等,1990)。Gal.On等(1992)通过比较ZYMV的蚜f0株系和非蚜传株系的CP,也证明了DAG突变为DTG使其诞失蚜传活性(Gal.On等, 烟草脉带花nt‘病毒和马铃薯A病毒HC.Pro调控RNA沉默抑制、协生和致疵力的机制1992)。缺失CP包括DAG在内的15个氨基酸,李痘病毒(Plumpoxvirus,PPV)-ci乏失蚜传效率(Goytia等,2006)。Blanc等(1997)应用proteinblotting-overlay技术研究了TVMV中CP和HC的互作,首次提供了蚜传过程中CP和HC特异性互作的血接证据。并通过突变技术证明,当DAG变为NAG时不影响蚜传效率,但是当其突变为DAL/HAG/GAG/DGG/DAE时,CP丧失了和HC.Pro结合的能力,病毒也丧失了蚜f%l性(Blanc等,1997)。同时确定了和HC.Pro互作的CP的最小区域是TVMVCPN端的7个氨基酸(DTVDAGK),并通过缺失CP的C端证明其在HC.CP互作不起作用(Blanc等,1997)。N端15个氨基酸的非蚜传株系PPV-NAT的CP在植物中与HC.Pro能发,I:互作,这种互作可能与病毒的蚜传无关,而与病毒的其他生物学过程相关,比如病诲的短距离和长距离运输过程(Roudet.Tavea等,2002)。利用酵母双杂交技术可以研究HC.Pr0的体外互作(Guo等,2001),Seo等2010年通过酵母双杂交的方法确定,人i,花叶病毒(Soybeanmosaicvirus,SMV)的HC—Pro与CP的互作过程中,CP的II11lJ(133.148个氨基酸)和C末端(246.265个氨基酸)及HC.Pro的C端(424—459个氨基酸)是必须的。将ZYMV的CPN端替换为芜菁花叶病毒(Turnipmosaicyf,.淞,TuMV)CP的N端时,TuMV的HC.Pro就能协助ZYMV进行低效率的蚜传,推测可能是因为’FuMVN.端不能在ZYMV中J下确折叠,首次报道CPN端能识别不同的HC.Pro(Dombrovsky锋,2005)。基于Plisson等(2003)分析的莴苣花叶病毒(Lettucemosaicvirus,LMV)JIC.I叶。的2D结构,PTK基序可能位于铰链区(hingedomain),CP和HC.Pro的特异识别足⋯CP的N一端与HC—Pro的铰链区的结构互补性来决定的(Dombrovsky等,2005)。1.1.4其他参与蚜传的位点除了已经证明的DAG、PTK和KITC能够参与CP.HC.Pro互作和蚜传以外,还订.je它位点也能参与这两个过程。通过ZYMV蚜传基序和非蚜传基序的替代实验,i,il!lOJN立i/,:|I.保守位点148位的天冬氨酸(Asp)和FRNK同时分别变为甘氨酸(Gly)和l?lNK时f:『{三够降低蚜传效率(Huet等,1994)。比较非蚜传株系PVY-1与蚜传株系的HC.Pro序列发现两个氨基酸的差异,一个是半胱氨酸富集区域的35位的Gly(G)突变为负电的Asp(D)和355位的S变为G,推测这两个位点可能在蚜传过程中起作用(Canto等,1995)。Blanc等(1998)利用不能蚜传的TEV-HCHXaKITC侵染性克隆证明在KITC没有变化的n订堤下,HC—Pro第lO位的苯丙氨酸(F)突变为亮氨酸(L)使TEV丧失了蚜传效率,ij},lljJ这8 山东农业人学博?l:学位论文个氨』Ib睃位点在’.rEV的蚜传过程中是必需的。另夕},PVY第35位的Gly变为Asp,St/KITC‘1的fj,J.·个氨刍g酸Gly变为Glu也能使本来具有蚜传的株系变为不能蚜传。这两个位点的突变鄙足l,h不带电荷氨基酸突变为带负电的氨基酸而且都位于或者接近KITC的亮氨酸富集I遥域,因此推测这两个位点的突变可能也是通过影响HC.Pro与蚜虫口针的结合起作用(Blanc等,1998)。Flasinski等(1998)比较了花生条纹病毒(Peanutstripevirus,PStV,脱住确认为BCMV一个株系)、花生斑驳病毒(Peanutmottlevirus,PeMoV)和TVMV锋棚‘海f门IIC.Pro序列,发现除了N.端的KITC矛IC.端的PTK外,中间的FRNK$11CCC(I'eMoVI:p为Ala.Ser-Cys,ASC)也与HC.Pro蚜传活性有关(Flasinski等,1998),当IIC.Pro有ASC基序时,CP上具有DAA基序比具有DAG基序更有利于病毒蚜传。利用酵f:J.舣杂交及双分子荧光互补实验发现,SMV中除了DAG基序中的甘氨酸,CP的第256化的组氨酸及HC.Pro的第455位的精氨酸也是CP.HC.Pro互作和蚜传所必需的(Seo等,2()10a)。一KI,l’C丛序酱遍存在PVY属病毒基因组中,在ZYMV中,KITC基序是以KLSCfI勺形式仃在,在缺失了蚜传活性的ZYMV-HC(一)中,赖氨酸没有变化(Huet等,1994)。IIC.Pro第lO位的苯丙氨酸(F)突变为亮氨酸(L)能使TEV丧失蚜传效率,但是PVY的IIC.Pro在地lO位是都是L,而蚜传活性并不受影响,说明HC.Pro第十位氨基酸的川¨;l的序列对此氨基酸的作用有一定的影响。推测不同病毒间包含第10位氨基酸在内ff,JN端和半胱氨酸富集区域对HC.Pro的作用机制是不同的(Blanc等,1998)。ZYMV的IIC.Pro能够协助ZYMV和TuMV的病毒粒子通过杂食性蚜虫传播而不能通过十字花科蔬菜蚜虫传播,TuMV的HC.Pro只能协助自身蚜传而不帮助ZYMV蚜f0,iil!11)j蚜虫和病毒之问及HC.Pro与病毒粒子之间的识别具有特异性(Dombrovsky等;2005)。Seo等(2010)还证明CPN端缺失时,K143变为A能使CP不与HC.Protlifi:。石iCP全长中引入这个突变不影响其与HC.Pro的互作。推测与HC.Pro互作时,个Kf门CP及缺失了N末端的CP的作用方式不同。在缺失N末端时,CP上会产生新I,|《J’J_f:fi-化点(Sco等,2010a)。1.1.5介导其他病毒的蚜传⋯些丰lI【物病毒单独侵染时不能被昆虫传播,而与其他病毒(辅助病毒)‘复合侵染时这类痫嘶就能够被昆虫传播(Govier等,1974;Kassanis等,197la:Kassanis等,1971b)。复介仪染-It,作为轴助瘸景I存礼的Potyvirus的I-IC.Pro蛋白能够介导1tC.Pro缺陷型或9 烟草脉带花叶病毒和马铃薯A病毒HC.Pro调控RNA沉默抑制、协生和致病力的机制者不能蚜传的同种和相关及不相关病毒的传播(Froissart等,2002)。最典型的例子就是马铃薯奥古巴花叶病毒(Potatoaucubamosaicvirus,PAMV),PAMV在马铃辫棚f墨Y属病毒HC—Pro存在情况下能够蚜传,比如蚜虫提前或者同时取食了PVY后,PAMV才能够被蚜虫以非持久性方式传播,携带PAMV的蚜虫的传毒时间仅为两个小时。PAMV也是唯一能被蚜传的马铃薯X病毒属(Potexvirus)病毒(Manoussopoulos,2001)。Syller(2012)年完善了Potyvirus做为辅助病毒帮助其他病毒非持久性蚜传fl;)lJ模型(Syller,2012)(图1)。HC.Pro做为可逆的“桥梁”在病毒粒子和蚜虫食道卜钡太皮和前肠的结合过程中起作用。A,两利,不同的病毒粒子和植物汁液r{t的Potyvirus的HC.Pro蛋白被蚜虫携带;B,HC.Pro与虫体组织上的受体特异性的结合,随后附利t病毒结合到HC.Pro上形成HC—Pro—virion复合体;C,HC.Pro.virion复合体结合到蚜』£ff,J口针上。蚜虫继续取食时,就能将两种病毒传播到其他植株。1.2HC.Pro抑制P,小IA沉默1.2.1抑制RNA沉默机制RNA沉默(RNAsilencing)现象是真核生物中普遍存在的能抵抗外来核酸入侵的一种防御机制(崔晓峰等2005),例如病毒在入侵植物时,这种机制可抑制病碡的复制,限制病毒PdqAs在植物中的积累。大多数RNA沉默都是双链RNA(dsRNA)介.甘的,从病毒侵入点产生系统的沉默信号可以传导到整株植物。在长期进化过程中,植物病i≮发展出自己的策略来抵抗RNA沉默,一种策略就是产尘一种蛋白作用于细胞17I1irI:刷RNA沉默信号的传导过程,从而抑制RNA沉默,成功的侵染植物(Voinnet,200I)。TEV的HC.Pro能够抑制病毒诱导的基因沉默,和携带GFP的马铃薯X病毒(PotatovirusX,PVX)侵染性克隆表达载体共同表达时,能抑制GFP的沉默,从而确定HC—Pro灶RNA沉默抑制因子,这也是第一个被鉴定的RNA沉默抑制子(Anandalakshmi等,1998)。HC.Pro蛋白抑制RNA沉默功能被发现以后,许多实验室通过不同的实验方法来试图阐明其抑制作用的分子机制。利用农杆菌瞬时表达和转基因系统检测了TI-VlIC.Pro在RNA沉默过程中的作用,共同注射HC—Pro和GUS能使GUS已经沉默的转水lxltI一,GUS恢复表达,在这个系统中转录后基因沉默(PTGS)和转录的GUS序列3’末端的小RNA的积累及转基因中GUS的接近3’端的特定位点的胞I嘧啶甲基化有关,¨1HC.Pro在这个系统中表达时能抑制转录后基因沉默、减少小RNA的积累和影响部分Il;基化产生,因此推测HC.Pro作用于RNA沉默的维持阶段,不lCJhk沉默信号的,沁盟i界: 山东农业人学博I:学位论义系统化导过程(Llave等,2000)。Mallory等(2001)利用嫁接实验证明TEVHC.Pro介·吁的转录后基因沉默不能阻止植物产生和传递沉默信号,而是阻止植物对沉默信号做⋯反应,但是不同的是HC—Pro不能干扰GUS转基因甲基化的产生,作者推测是因为实验办法的不同导致的。因此推测HC.Pro作用于转基因甲基化和信号移动的下游,能阻tl-'l'RNA的积累(Mallory等,2001)。捕获siRNA与结合双链RNA可能是病毒抑制RNA杉C默的通用策略,Lakatos等(2006)发现,与其它RNA沉默抑制因子一样HC.Pro通过捕获siRNA来抑制RNA沉默(Lakatos等,2006),Merai等(2006)证明HC.Pro其千j.结合双链RNA的能力(Merai等,2006)。lIC.Pro能够改变很多种类的小RNAs的积累:沉默过程中dsRNA直接降解产生的siRNA、功能未知的比siRNA稍微大一些的RNA(slightly—largerRNA,25.27nt)和调挖}lIt物JI《冈表达的内源microRNA(Roth等,2004),Mallory等(2002)利用三种转基⋯J髟J=I:(sense-transgcnes,inverted—repeattransgenes,andamplicon-transgenes)来分析了lIC—Pro对siRNA和miRNA的影响,证明HC.Pro能够增加dsRNA的积累,抑制siRNA的移{累,相反的能够增加miRNA的积累,这个试验结果说明HC.Pro抑制了双链RNA被JJllSl-'-成siRNA这一过程,即Dicer切割双链RNA的功能受到抑制,另外也表明切割似标刍蜒因mRNA的R1SC复合体的功能也可能被抑制了。同时发现在inverted.repeattransgenes和amplicon—transgenes转基因有25.27nt的小RNA出现,HC.Pro能够增加这州jRNAf内j{}{岽,这些RNA的作用不详,虽然在瞬时表达系统中,这些较长RNA和相J澎mRNAf内降解没有联系,但是和系统沉默以及同源DNA甲基化有关(Hamilton等,2002;Mallow等,2002)。2000年,Urcuqui.Inchima等利用缺失得到了PVY中HC.Pro111结合核酸的两个区域,DomainA包括89.230个氨基酸,DomainB包括234.366个钒j。I酸,并且当B区域截短到234.32l时仍具有RNA结合能力,说明RNA结合的关键lx-域小:1二B区域,并且B区中其关键作用的是Y288,当其突变成D时影响其结合RNAn勺能力,作析还iil(明与HC.Pro体外互作的核酸长度大于17个核苷酸。利川酵f{j=双杂合系统发现烟草中有8个蛋白能与TEVHC.Pro互作,其中一个是与卡ll【物钙渊索相关蛋白,称为(rgs—CaM)。Rgs.CaM能在瞬时或转基因植物中过度表达州。产:,{i类似于tiC.Pro一样的抑制RNA沉默活性,表明rgs.CaM通过钙依赖的凋控途符水允当RNA沉默的内源抑制因子,而HC—Pro能够增强rgs.CaMmRNA的表达水平,拊测lIC.Pro利rgs.CaM的抑制RNA沉默的机制可能是:一是在HC.Pro水平降低时,ItJ.以越过内源的rgs-CaM干扰RISC的形成,从而抑制RNA沉默。另一种是rgs.CaMIl 烟竿:脉带花叶病毒和马铃薯AjIji毒HC.Pro调控RNA沉默抑制、协生和致病力的机制为RISC的组分,HC—Pro通过与rgs—CaM互作干扰RISC的形成。而且过度表达rgs.CaM的转基因植物能产生像HC.Pro转基因的植物一样的畸形,表明rgs.CaM可能与IIC,Pro类似干扰了miRNA介导的发育调控(Anandalakshmi等,2000)。因为结合了钙f门钙洲素往往是具有活性的蛋白,鉴定rgs.CaM的下游靶标可能能够鉴定到其他内源n勺刈‘j::fC默起抑制作用的因子(Moissiard等,2004)。尽管HC.Pro抑制RNA沉默的机制很复杂,但是现在主要有两种途径,一是干扰了抑制病毒来源siRNA引起的RNA沉默过程,另外一个是干扰了寄主细胞·l-Pre.miRNA来源的miRNA介导的沉默过程(Pallas等,2011)(图1.2)。在第一种。}.譬况中HC.Pro又至少在两个步骤中起作用(Tortes.Barcel6等,2008),(1)HC.Pro能够I峁低但是并不完全阻止dsRNA被Dicer降解,siRNA还能被检测到并没有完伞消火(Dunoyer等,2004;Mallory等,2002):(2)虽然siRNA能够检测到,但是HC.Pro能阻止mRNA降解,推测HC.Pro能够干扰RISC复合体的组装和活性(Chapman等,2007;Dunoyer等,2004)AmpImCati/《SGS3’·LRDR61》山五圆皿瓯叫山u麓警o⋯‘谴兰-∥争Pr争mI茸ⅡIII—III—IIl—itl—ttl皿lltll扁Dicingl《殛薹》I眦jng盎昏墙;RlS.C1-吣五麦》I慧、幽卜2ji;i毒相关的P,NA沉默关键步骤示意圈(Pallas等,201I:Valli等,2009)Fig.I·2Schematic他pre辩ntationofthekeystepsinvirus—relatedRNAsilencing(Pallaseta1..201l:Vallieta1..2009) 山东农业人学博:I:学位论义12.2抑制RNA沉默的功能位点’.;2003年,Plisson等分析了HC.Pro的结构,提出HC.Pro的中间区域是RNA结合、抑制PTGS和VIGS所必须的区域(Plisson等,2003)。利用五肽筛选系统(pcntapeptide-insertionscanning)确定HC—Pro的中间区域是抑制RNA沉默所必须的,⋯¨iil圳JC末端除了具有蛋白酶活性外同样也参与抑制RNA沉默过程(Varrelmann等,2007)。2008年Torres.Barcelo在HC.Pro中随机引入突变能影响HC—Pro致病性和抑制I卜义IyI’GS活性,说明除了HC—Pro的中间区域,其他的位置对于HC—Pro抑制PTGS羽lVIGS也是非常重要的(Torres.Barcel6等,2008)。将野生型PPVHC.Pro134位的亮氨酸(L)突变为组氨酸(H)能使HC.Pro的瞬lI、f衫[默抑制活性丧失,同时也使PPV和PVX的协生作用丧失,首次确定PPV中HC.Pro的’一个.雌位点的突变就能影响HC.Pro的抑制RNA沉默活性和协生作用(Gonz/flez.Jara等,2005)。ZYMV中FRNK是HC.Pro结合siI酬A和miRNA所必须的保守基序,当jC突,叟为FINK时,影n向了HC.Pro和miRNA的亲和性和ZYMV的症状表现,但是并/卜"片1圳11l—tIJIIC.Pro的抑制RNA沉默的活性,推测FRNK可能依靠影响内源miRNA的积累水介!t症状的发生(Shiboleth等,2007)。通过比较三叶草黄脉病毒(cloveryellowveinvirus,CIYVV)致命坏死株系和其自然突变的花叶株系序列比对发现,HC.Pro中有两个氨基酸的差异,分别进行定点突变,L!lJ,1271和D193Y,突变后发现两个突变位点均使HC.Pro的抑制RNA沉默活性降低(Yambao等,2008),并且这两个位点的突变使症状减轻,其中T27I能引起坏死但是1:址敛命性的,而T27IDl93I和D193Y只能引起褪绿斑驳和花叶症状,因此当D193仃存||、r能使CIYVV不引起坏死,因此推测CIYVV中HC—Pro的抑制RNA沉默活性和勘i夕匕症状的农达是成力i相关的。T27位于C端的一个类似锌指结构域,D193位于一个L绛豁定的HC.Pro核酸结合域的N端(Urcuqui.Inchima等,2000),这两个区域是HC.Pro’rR婴{征铃,其中类似锌指结构能和核酸互作,是HC.Pro自身互作所必需的(Urcuqui.Inchima等,1999),尽管D193在PVY属病毒中是不保守的,但是它具有特姝f内f移代,位于FRNK保守基序下游9个氨基酸的位置,并与保守基序L×CDNQLD的N端11l邻.W此I)193可能是通过影响这两个保守基序以及RNA结合域来起作用(I)csbicz笛,2010:Yambao等,2008)。MicroRNA在植物的生长发展过程中起作用,包括调控器官的分离,极性和特性等, 烟草脉带化叶炳毒和马铃薯A炳毒HC.Pro调挖RNAi7c默抑制、协生和致病/J的机:Ij0例如在拟南芥中miRl59,miRl60,miRl64,miRl65,和miRl68的积累水平与叶片们牛·长有关(Dugas等,2004)。HC.Pro能够干扰拟南芥miRNA的途径,使植株表现,}常(Dunoyer等,2004)。ZYMV强毒株系TW.TN3分别以单位点、双位点的方式,-jf入三一个氨基酸位点(R180I、F205L和E396N)的突变,均能使ZYMV的症状减弱,≥川IR180IE396N突变体可以用来进行交叉保护植株不受强毒株系的侵染,但是通过检测.jeCP的含量,确定这个突变位点不影响HC.Pro的PTGS活性(Lin等,2007)。Wu等(20l0)年检测了R180I、F205L和E396N的不同组合病毒致病性和症状发展有关的小RNA的途径中的作用,发现在转HC.Pro单位点和双位点突变体中miRNA的积累量与转野牛型HC.Pro的植株中miRNA的积累量一样多或者稍微少于野生型,说明HC.Pro即.位』_或者双位点突变体RNA沉默起部分抑制功能。还证明在抑制miRNA途径的过程·I-,起关键作用的是R180位点,而F205和E396两个位点对R180起促进阱同作JlJ。Trans.actingsiRNAs(ta—siRNAs)在叶片的极性、生长及相变的过程中起作用(Pcraginc等,2004),研究发现R180I、F205L或E396N这三个位点的突变在ta.siRNAs介.甘l,|勺叶片发展和通过阻止miRNA介导在ta—siRNA的生物合成来影响叶片从幼期到成熟j!;JJ的相变过程中起重要作用。作者还验证了这三个突变体在抑制VIGS和sense(s)一PTGSrlt的作用,证明虽然R180、F205和E396在HC.Pro抑制miRNA和ta.RNAs的途径lll址重要的功能位点,也同时在VIGS过程中起作用,但是不影响HC.Pro抑制s.P,I’GS过袱(Wu等,2010)。最近有报道称DCL4在病毒siRNA产生过程中起作用(Bouch6等,2006),而DCL在s.PTGS途径中起作用(Mlotshwa等,2008),推测HC.Pro突,叟体在两种途径中的作用不同导致了对抑制VIGS和s.PTGS的影响不同(Wu等,2010)。Torres.Barcelo等(2008)根据以前的报道构建了TEV的28个突变体,利川实时荧光定量PCR的方法检测GFP的表达量来确定突变体的抑制RNA沉默活性,九个突变体完全丧失抑制RNA沉默活性,其中V135A丧失了抑制RNA沉默活性,与PI)V111L134H的结果一致,三个突变体的抑制活性降低(降低1.4—7倍),五个突变体的抑制活性增加(增加1.1.2.4倍),其余的突变体与野生型HC.Pro没有明显区别。首次羚定出RNA沉默活性增强的HC—Pro突变体,推测在HC.Pro中使其抑制RNA沉默活倒i增强的突变体在自然界中可能普遍存在,只是由于测定方法的局限性而没有被鉴定⋯米。1.3HC—Pro参与病毒的协生作用\越来越多的证据表明,在植物及动物中病毒的复合侵染现象是普遍存在的(Dapalma14 山东农业人学博.I:学位论文博,2010)。植物病毒的复合侵染可以分为协生和对抗两种情况,两种或多种病毒复合一仪染』ifj--.个寄主植物,导致其中一种或者两种病毒的积累量增加,并且病毒间的相互作川能引起比其一I-任何一种病毒单独侵染更加严重的症状,这种现象被称作协生作用(Pruss等,1997;Syller,2012;Vance,1991;Wang等,2009)。关于病毒协生作用的机耻方面还没有明确的定论,目前大家普遍认为是RNA沉默抑制子介导了协生作用,但灶桐同的病毒在不同的寄主植物上可能引起或协生或不协生又或者不同的协生模式,说Ipjb’'-J-ff:用可能是由病毒基因与寄主植物基因之间,病毒与病毒之间复杂的相互作用的绌粜。1.3.1协生作用具有寄主依赖性不例病薄在不同寄主植物上的协生现象被广泛报道,复合侵染的植株中,病毒的秽{祟嫩是否增加是具有寄主依赖性的。其中最具有代表性的就是马铃薯Y病毒属(Potyvirus)病毒参与的协生作用,而其中最经典的例子就是PVY与PVX的卧生,相对‘孑.睡独侵染,这两个病毒复合侵染普通烟(Nicotianatabacum)时能引起更严重的症状,⋯时PVX的病毒积累量能够增加3.10倍(Vance,1991)。然而在本氏烟(Nicotianahenthamiana)l=11,PVX与PVY、TEV或者PPV共同侵染时,虽然能够引起植株的系统性坏死,但是PVX的病毒积累量并没有明显的增加(Gonzzilzz.Jara等,2005:Gonzfilez.Jara等,2004),同时证明协生作用所引起的严重症状表现不是由病毒RNA私{累的水平直接引起的。另外同样的现象还发生在番茄褪绿病毒(TomatochlorosisⅢitilX,’IoCV)和番茄传染性褪绿病毒(Tomatoinfectiouschlorosisvirus,TICV)的协生j』稚-|I(Wintcrmantel等,2008),相对于单独侵染,在本氏烟中TICV的病毒积累量埔川|f|j"IbCV的病毒积累量是降低的。在Physaliswrightii中两个病毒的积累量都能够增JJII。征协生过程中除了病毒积累量具有寄主依赖性外,症状的表现也具有寄主依赖性,‘6亡斯带克辣椒病毒(Pepperhuastecovirus,PHV)和辣椒金色花叶病毒(Peppergoldenmostdcvirus,PcpGMV)同时普通烟和本氏烟时能够发生协生作用,而在辣椒巾则发生埘j).I:作川(Antagonism)(M4ndez.Lozano等,2003)。另外有证据表明协生模式不仅与夼1州【物的种类有关,而且与寄主植物的品平4·有关系(Tatineni等,2010)。1.3.2参与协生作用的病毒及受益病毒 7病毒的协生作用主要是不相关的多种病毒在相同的寄主细胞中的互作产生ff'JgJi果。7但是在甘薯羽状斑驳病毒(Sweetpotatofeatherymottlev护淞,SPFMV)和甘薯褪绿矮化病毒(Sweetpotatochloroticstuntvirus,SPCSV)的协生作用中,只能侵染韧皮部的SPCSV与SPFMV并没有在非韧皮部细胞中相互作用,却能够使非韧皮部细胞rfl的SPFMV的浓度明显提高(Karyeija等,2000),作者推测可能有两个原因:一是SP('SV的特定蛋白能够从韧皮部中运输到其他组织,介导协生,加速SPFMV的复制:::址SPCSV能够阻止甘薯产生用来抵抗SPFMV侵染的系统性韧皮部依赖的信号(Karycija等,2000);同样的当韧皮部局限性的马铃薯卷叶病毒(Potatoleafrollvirus,RI。RV)与PVY共同侵染马铃薯时能够引起相对于两种病毒单独侵染更为严重的症状,但是两个病毒的积累量都没有明显的变化(Srinivasan等,2007)如上所述,多数的协生作用是发生在不相关的病毒之间,但是那些或多或少订黪火系的病毒之问也可以发_i互作,如菜豆金色TEnt‘病毒属(Begomovirus)病’嘶f门小嘲五毒(Chakraborty等,2008:M6ndez.Lozano等,2003:Renteria.Canett等,20lI:Sufrin.Ringwald等,2011),如瓦斯蒂克辣椒病毒(PHV)和辣椒金色花叶病毒(PcpGMV)(M6ndez—Lozano等,2003)、南瓜曲叶病毒(Squashleafcurlvirus,SLCV)和两瓜键绿矮化病毒(Watermelonchloroticstuntvirus,WmCSV)(Sufrin.Ringwald等,2011)。马铃薯Y病毒科(Potyviridae)中,属于Tritimovirus的小麦线条花叶病矗l(Wheatstreakmosaicvirus,WSMV)和属于新的暂定属Poacevirus的小麦花I}I.瘸啦(Triticumnlostti6·virus,TriMV)在小麦上也能发生协生作用(Tatineni等,2010)。在大多数已经报道的例子中,马铃薯病毒属病毒在与其他异源病毒发生互作时,potyvirus的积累量不受影响或者有轻微的降低,而nonpotyvirus的积累量增加。例如TVMV、PVY或者TEV与PVX的协生(Rochow等,1955:Vance,1991:Vance等,1995)、TuMV与黄瓜花叶病毒(Cucumbermosaicvirus,CMV)的协生作用(Sano等,1989)。但是相反的情况也是存在的,即在协生过程中受益的是potyvirusIfI川i址nonpotyvirus。例如PVY和烟草花叶病毒(Tobaccomosaicvirus,ⅣV)共同侵染!§铃薯野生种(Solahumbrevidens)时,PVY的病毒积累量是增加的(Valkonen,1992),甘薯羽状斑驳病毒(SPFMV)和甘薯褪绿矮化病毒(SPCSV)复合侵染甘薯时也发£Ii类似情况,属于马铃薯Y病毒属的SPFMV的病毒浓度有明显的提高(Cucllar等,2008:Karyeija等,2000;Mukasa等,2006)。此外,在小麦花叶病毒属(tritimovirus)f门小麦线条花叶病毒(WSMV)与玉米褪绿斑驳病毒属(Machlovirus)玉米褪绿斑驳瓶心16 山东农业大学博:L学位论文(Maizechloroticmottlevirus,MCMV)共同侵染玉米时,’两种病毒均是受益方(Scheets,1998;Stcnger等,2007),另外在PVY与CMV的协生作用中,只有两者共同侵染番删时两种病毒的浓度才能都提高(Mascia等,2010),在其他寄主植物不引起这种结果。1.3.3参与协生作用的病毒基因十u同的两种病毒侵染不同的寄主植物时引起的协生作用模式不同,这可能是因为病j准^《㈨与不同寄主植物基因之间相互作用,相互斗争的方式及结果不同所导致的(Syller,2012),所以了解病毒的哪些基因参与了协生作用的过程对于了解协生作用的机蔓l!是至关重要的。目前已经鉴定的参与协生过程的基因大多是一些RNA沉默抑制子。马铃薯Y病毒属病毒编码的HC.Pro能介导自身病毒参与的协生作用,而同是马铃!)!fY病毒科的其他属病毒编码的HC.Pro则不一定能够介导该病毒与其他病毒的协生(Stcngcr等,2007)。Vance等(1995)就利用转基因的方法证明在TVMV、TEV与I'VXf门阱化作用中,TVMV与TEV的全基因组的复制不是必须的,而起关键作用的片段址J^吲约【的5。.端,包括P1.HC.Pro.P3的区域(Vance等,1995)。Pruss等(1997)itliIJ)J表达TEVP1/HC.pro序列的转基因烟草与TMV和CMV也能发生协生作用,同时作杆利用嵌合载体证明Pl和P3编码的序列在协生作用中不是必需的,HC.pro的编码,^:物介导了协生作用,而不是其核酸本身(Pruss等,1997)。HC.Pro可能是通过抑制l'.1’GS来介导协生作用,如小麦花叶病毒属病毒WSMV编码的HC.Pro不具备抑制转录Jl“≮⋯})C默活性,同样也不能介导WSMV与MCMV的协生作用(Stenger等,2007)。fI!;Z--,Z【:GonzAlez—Jara等(2005)在文章讨论中提到,在potyvirus.PVX的协生作用中川‘能存住多种RNA沉默途径被干扰的状况而不仅仅是PTGS过程(Gonz舀.1ez—Jara等,2005)。Kasschau等(2003)证明TuMV的HC.Pro基因除了能抑制PTGS外,还能够:l:扰micro.RNA(miRNA)介导的mRNA的降解(Kasschau等,2003),这个过程也址RNA杉C默f内一利-形式。研究发现PVY、TuMV和C1YVV分别与CMV共同侵染本氏删州‘,PVY的IIC.Pro能更有效的增加CMV的浓度。两种病毒共同侵染或者CMVf2染转PVYlIC.Pro的烟草时都能够克服CMV的“Cyclingpattern”。但是在转基因烟III川-CMV的病毒积累量增加程度更大,而且CMV的3a蛋白表达量也是相应增加的,⋯此,作者认为CMV与PVY的协生作用是PVYHC.Pro抑制RNA沉默的结果,而且CMV3a运动蛋白可能也参与了这个过程(Fukuzawa等,2010)。除了lIC.Pro,je他病毒编码的一些蛋白也具有抑制RNA沉默的活性(Niehl等, 烟草脉带花叶病毒和马铃薯A病毒HC·Pm调控RNA沉默抑制、协生和致瘸力的机制2011;Qu等,2005;Roth等,2004)。不同病毒的RNA沉默抑制子通过不同的方式抑制PTGS,这就导致其介导的协生作用的模式可能会有所不同,比如,PVX的P25删人i通过干扰RNA介导的RNA聚合酶(RNA.directedRNApolymerase,RdRp)的1"1;JIj米阻止移动沉默信号的积累(Voinnet等,2000),同时还能通过降解Agonaute蛋白来越作用(Chiu等,2010)。WSMV与MCMV在玉米上的协生不是由WSMV的HC.Pro介导的,WSMV可能存在其他的蛋白来抑制PTGS和介导协生作用(Stenger等,2007)。1.3.4HC—Pro参与协生的区域和位点人们最早是利用转基因和PVX侵染性克隆表达表达外源基因的方法证明HC.Pro编码的基因产物介导了potyvirus与PVX的协生作用(Pruss等,1997:Vance等,1995)。随后对于HC.Pro中对其介导协生起关键作用的区域和基序进行了研究。Shi等(1997)年通过转基因烟草证明,在HC.Pro的中间区域引入突变的转基因植株丧失了与PVXfI,J互作,而在P1基因中引入突变的三个转基因植株与PVX能够正常协生并能够使PVX的病毒积累量增加,作者同时构建的缺失类似锌指结构域(Zincfinger-likedomain)f仃转基因植株也具备与PVX的协生能力,就是说HC.Pro的中问区域足协生作片J和PVX大量复制所必需的,而前66个氨基酸构成的类似锌指结构域则对两个过程没有影响(Shi等,1997)。鲁瑞芳等(2001年)将HC.Pro的序列分区段转化烟草,同样证明HC.t'ro的中心区域能够介导PVY-C株系与CMV或者PVX的协生(鲁瑞芳等,2001)。李为民等(2001)将位于HC.Pro中间区域的CCCT和PTK基序进行了突变,获得了CCCT位点的包括缺失型在内的三个突变体(Del、RGAE、CRRT)和PTK的一个突变体(P’I'A),通过转基因的方法证明这四个突变体都不能能与PVX引起协生作用,说明CCC'I’和PTK基序是PVY-CHC—Pro介导PVX/PVY协生作用所必需的(李为民等,2001)。Sacnz等(2001)通过比较不同症状的PPV分离物的序列,然后将不同的氨基酸突变引入PVX.HC嵌合载体证明107为是谷氨酸(E)更有利于PPVHC—Pro介导与PVX的I办化作用(Sfienz等,2001)。Yang等(2002)在与蚜传相关的两个基序上引入突变,c!IJPTK变为PTE,KITC变为EITC,利用PVX.HC嵌合载体证明PVX.HCPTE在本氏词_i4上只引起花叶症状,而PVX—HCEITC则能够在本氏烟上引起坏死,但是后期症状会恢复,可能与HC.Pro后期被剪切掉有关系,说明位于HC.Pro中间区域的PTK基序赴HC.Pro介导协生所必需的,而同样是蚜传相关基序EITC则不是必需的(Yang等,2002)。GonzAlez—Jara等(2005)通过比较PPV的蚜传株系和非蚜传,突变了可能参与协£卜作 山东农业人学博l:学位论义川I,I勺lIC.Pro的中间区域的两个位点,证明134位的Leu(L)突变为His(H)后使HC.Pro’艇火介导协生的能力,同时利用瞬时表达系统证明HC.ProL134H突变体同样丧失了抑制RNA沉默活性,表明HC.Pro的这两个功能具有相关性(Gonzfilez.Jara等,2005)。1.3.5协生作用带来的危害岍种病毒在协纠i过程中能够克服植物对其中一种病的的抗性,使非寄主植物变为寄l喇【物,从而扩大了病毒复合侵染时的寄主范围。例如,与ToCV协生作用能够克服jj{;;特转丛因Sw.5基因的番茄对番茄斑萎病毒(Tomatospottedwiltvirus,TSWV)抗性(Garcia.Ca_no等,2006);CMV与ZYMV的协生作用可以黄瓜抗性品种CV.Delila中CMV的IONIA及CP的积累,但是症状没有明显的变化,同时说明在抗CMV的黄瓜植株巾病毒的积累和症状发展是由不同的基因调控的(Wang等,2004)。SPFMV侵染马铃嘶.IIIl干-fIcv."lhnzania能引起系统侵染,但是只有很少的病毒积累量,与SPCSV发生协小肝,能够使SPFMV的RNA和CP增加600倍(Karyeija等,2000)。因此,田间作为瘸所i存在的病毒间发生的协生作用,会使植物丧失对病毒病原的抗性而引发更严重的绛济:}f『j失。。病繇在自然界中的协生作用中,传毒昆虫的传毒情况是值得被关注的,因为它可能会·1}I发严重的生态学和流行学后果。两利,病毒病的互作可能会引起以下的结果。一是提尚J7介体昆虫的传毒效率,昆虫的传毒效率是通过估算带毒昆虫所能引起的被侵染植株I,1.1分数禾j到的。这与昆虫之前取食的植株中的病毒浓度成J下相关,即一种或者两种病毒的浓度的增加可能能够增加昆虫的传毒几率(Froissart等,2010)。例如,毛形病毒属f门岍种病碰番茄褪绿病毒(ToCV)和番茄侵染性褪绿病毒(TICV)通过粉虱(Homoptera."AleynMidae)的传毒效率的高低与病毒在植株中的的浓度高低是一致的(Wintermantels,¨iN,2008)。Tatincni等(2010)年证明螨从WSMV和TriMV复合侵染的植株上的f之毒效牢比从单独感染WSMV或TriMV的植株上的传毒效率要高(Tatineni等,2010)。最新的训嘞;表明复合侵染的植株中介体昆虫的传毒效率更高的原因,不仅仅是病毒积累量九勺J:{}7:|J『I,还可能是因为复合侵染的植株中病毒的分布范围更广,使得昆虫在取食中更容幼接触病部(Mascia等,2010)。二是病毒的复合侵染能影响昆虫介体的偏好性和其生物。浮特。t'l-。桃蚜(Myzuspersicae)和马铃薯长管蚜(Macrosiphumeuphorbiae)(Homoptera.,Iphidi(kte)分)jlJ足能彳_J.效传播RI。RV和PVY的介体昆虫,在RLRV和PVY共同侵染fI‘J4:l‘【株·II,PVY的传捅效率比单独感染PVY的植株的传毒效率有明显的提高,而RLRV19 烟草脉带仡叶炳毒和马铃薯A炳毒HC.Pro调控RNA沉默抑制、协生和致躺力的机制的传播则不存在这种现象(Srinivasan等,2007)。作者推测,可能是因为RI。RV是维1’;束限制性的病毒,因此在复合侵染或者自身单独侵染的植株的维管束中的糖分和氨^《酸的积累量要高于PVY单独侵染的植株。另外还发现蚜虫更喜欢在复合侵染的植株.I-L-"植,这叫‘能是复合侵染的植株在外观和释放的气味上更能刺激蚜虫的视觉和嗅觉(Srinivasan等,2007)协生作用中,植物介导的病毒与传毒昆虫介体之间的互作可能在病毒的流行学力’ifIl具有重要的启示,因为很多病毒间经常以复合侵染的形式存在(Chatzivassiliou等,2008:Srinivasan等,2007)。协生作用增强了病毒的致病力、扩大了寄主范围致使病谢的易艚品种增加,最终将会给生产带来巨大损失(Kareem等,2007;Malik等,2010;Murphy等,2006;Tatineni等,2010;Zhang等,2001)。自然发生的两种或者三种病毒复介侵染产生的协生作用能导致作物上的发生毁灭性病害,能使植物永久性坏死。例如,玉米的致死性坏死病害(Camlethalnecrosisdisease,CLN)是由MCMV与马铃薯Y瘸『{j;属的玉米矮花叶病毒(Maizedwarfmosaicpotyvirus.A,MDMV-A)、WSMV或者‘”娥花叶病毒(Sugarconemosaicpotyvirus-MD—B,SCMV-MD-B)共同侵染所导致的(Goldberg等,1987;Niblett等,1978;Scheets,1998;Uyemoto等,1980)、小磐化叶病毒(cassavamosaicdisease,CMD)是由非洲木薯花叶病毒(Africancassavamosaicvirus,ACMV)和东非木薯花叶病毒(EastAfricancassavamosaicvirus,EACMV)参与的两种假重组病毒引起的(Pita等,2001)、由甘薯轻斑驳病毒(Sweetpotatomildmottlevirus,SPMMV)和SPCSV引起的甘薯病毒病害(Sweetpotatovirusdisease,SPVI))(Mukasa等,2006:Untiveros等,2007)。因此,阳间防治病毒协生产生的病害时要从以下几个方面入手:(1)要种植抗}I如·协种:(2)提前预防可能发生的病毒协生作用;(3)生产无病毒侵染的种子材料:(4)赴控制病毒的昆虫传毒介体(Kareem等,2007;Tatineni等,2010)。1.4HC—Pro参与病毒的致病力植物病毒成功入侵寄主植物,必须完成以下四步:(1)进入植物细胞:(2)确;域初侵染的细胞中复制;(3)通过胞I’日J连丝进行细胞问移动:(4)通过维证’爪系统进}J:长距离运输(Syller,2006)。总的来说,病毒能否成功侵染植物与其复制水平及能rj系统侵染密切相关。调控病毒细胞问移动的病毒编码的蛋白已经成功的被鉴定(Carrington等,1996;Deom等,1992:Lazarowitz等,1999),但是控制细胞“IJK蝴! 山东农业火学阱I:学位论文离运输的病毒编码的蛋白还不是特别清楚,包括很多病毒的CP基因以及很多其他未被拾定的旗因(Carrington等,1996:Citovsky等,2000;Seron等,1996)。马铃薯Y炳i臻属病毒编码的蛋白包括VPg、CI、P1、CP、P1、HC.Pro等基因或多或少都与病毒的移z力。:J复制有关系(Andersen等,1998:Carrington等,1998;Chiang等,2007:Cronin笛,1995;Rajamaki等,2002;Salvador等,2008)。作为一个多功能蛋白,HC.Pro的各种功能都被人们进行了深入的研究,HC.Pro的刁i『-司区段从多个方面参与了病毒的致病性和致病力,HC.Pro的N.端除了参与蚜传外,迩能影响致病力(症状发展)、基因组复制和病毒积累量(Atreya等,1992;Atreya等,1993:Kasschau等,1995),C.端影响了病毒的长距离运输和复制维护(Cronin等,1995;Kasschau等,1997:Klein等,1994),C端可能参与了病毒的细胞间移动(Rojas等,1997)。而有时候HC.Pro的改变可能会引起病毒浓度、核酸复制水平和长距离移动等农型川司时发生改变,而有些HC.Pro的突变体则只能影响一个表性,可能是因为HC.Pro的这螳功能域之间有重合,同时单个氨基酸位点可能具有“多功能”性。1.4.1参与病毒致病过程的特点1§铃薯Y病毒属病毒HC.Pro在病毒系统移动中的功能具有高度寄主特异性,PPV彳i能系统侵染普通烟(Ⅳ.tabacum),能够系统侵染转化TEV5’.端的普通烟。Sfienz等(2002)利用Nine.nucleotideinsertions法得到了Pl和HC—Pro的6个突变体转基因植株,证明HC.Pro中间区域突变后能够影响TEV5’.端对PPV不能系统移动的互补作用(S:acnz等,2002)。SMV.G7HHC.Pro的一个氨基酸点位点(P359S)的变化就能在⋯『’f挑;|f}3:Rsvl和Rsv3的大豆上引起症状变化,但是在只携带Rsv3基因的大豆上不引,迎变化(Seo等,2010b)。‘IIC.Pro的不同位点之间以及HC.Pro与其他基因间可以协同作用,在致病性和致病力I:引起比单位点突变更大的变化。例如,ZYMV的三个位点(R1801/F205L/E396N)被引入到TW.TN3中,发现这三个位点能降低ZYMV在西葫芦上的致病性,并能阻碍JC3判断为ljII性反应。2.2.10实时荧光定量分析2.2.10.1引物设计本实验选择烟草中所有品种都有的EFIa基因为内参基因‘,引物参照Qu等(2007)并有少许改动(Qu等,2007),引物序列见表2—5。目的基因引物设计原则同兰玉菲(兰玉菲,2009),即扩增片段长度为75.200bp。片段越短扩增效率越高,但如果片段小于75bp,扩增子很难与可能存在的引物二二聚体五d 山东农业人学博:L学位论文I《分。另外扩增子尽可能的避免形成二级结构。引物设计~般遵循以下原则:1)避免钳K的(>4)单碱基重复;2)引物的GC含量为50.60%;3)溶解温度在50"(2—65"(2之|1lJ,推目.两条引物的退火温度要尽可能的一样;4)避免产生二级结构:5)避免产生3个(j或C重复』{。段;6)引物末端碱基为G或C;7)检查『F向和反向引物确保3,端没订忆补配对:8)用软件来检验引物的特异性。综合以上原则,设计针对GFP、TVBMVCI'和HC.Pro基因的实时荧光PCR引物,引物序列如表2.5。表2-5用于实时荧光PCR的引物Table2-5Primersusedforreal.timePCR2.2.10.2梢株总RNA的提取采用北京全式金公司总.RNA提取试剂盒(TransZ01)提取总RNA。1)取50—100mg叶片液氮研磨至粉末,迅速转移到1.5mL离心管中,加1mLTransZol剧烈振荡,室温5min。2)加入200gL氯仿,剧烈振荡15S,室温放置3min。3)10000g离心15min。此时样品分成三层。4)转移无色水相,加入500p.L冰冷的异丙醇混匀,室温放置10min。5)10000g离心10min。6)弃上消,加lmL无RNA酶的水配制的75%乙醇洗涤沉淀,剧烈涡旋。7)7500g离心5min,室温干燥大约5min,沉淀溶于50“L的溶解液中,55.60"(2溶解10min,.80℃备川。2.2.10.3除去RNA中的基因组DNAk’参j!《{1’人KAI认公司DNaseI说明书。反应体系: 烟学脉带化叶病毒和马铃薯A}Ili毒HC.Pro调控RNA沉默抑制、协生和致铂力的机制。’1)配NsopL体系反应液:总RNA20Pg,10×DNaseIBuffer5gL,DNaseI(5U/gI。)’2gL,RNaseInhibitor(40U/p.L)O.5gL,DEPCH20定容Ns0uL。2)37℃反应20""30rain。3)加入2.5uLO.5MEDTA80I℃2min。4)用RNaseFreeddH20定容至100pL。5)加入10“L3M醋酸钠,250gL冷乙醇,冰上放置10min。6)4℃,13500r/min15min离心,弃上清。7)加入70%冷乙醇洗净,4℃,13500r/min5min离心,弃上清。8)沉淀干燥。用适量的RNaseFreeddH20溶解后,电泳确认是否除去基l天lSJLI)NA。2.2.IO.4反转录参考全式金反转录试剂盒说明书。反转录体系及程序:5XRTBuffer4.0gL,dN,l’ps(10mM)1.0gL,Oligo(dT)1.0gL,ES-RT1.0gL,Inhibitor0.5p.L,RNA100ng,DEPCH20定容到20pL。42。C50min,85。C5min。2.2.10.5反应体系的优化’确定一个SYBRGreenIqPCR反应的性能,通过下面两步来实现:确定域他的退火温度和构建标准曲线来确定反应性能1)最佳的退火温度(目的基因及内参基因同时做)。设置温度梯度,通过分析熔点曲线和凝胶电泳分析,一次实验即可以得到最佳的退火温度。熔点曲线只有一个峰,且Tm>80。C(<80"C是非特异性扩增),凝胶电泳呈现一条带。同时要选择对目的基因和内参基因同时最优的温度。2)构建标准曲线来确定反应性能。’用未知样本的系列稀释样品为模板,构建更宽地能覆盖待测样本浓度的标准IlI|线进行分析,至少做5个系列稀释样品,每个稀释倍数同时分两管扩增目的基因与内参綦因,并各设三个重复。可同时验证目的基因与内参基因NTC对照(即无模板对照,模板用RNA或者水代替)。分析标准曲线,理想的扩增效率应在90%.110%之间,标准mf线的R2>0.980,同时重复样本的CT值应相近(后期实验时,将所有样本稀释到CTfI.(在l8.30cycles的那个倍数后作为模板)。总的说来,扩增温度及扩增体系应满足以下几方面的标准方可进行后续的大挝榆测 山东农业人学博:l:学位论文实验(Bustin等,2009)。即Tm>80。C,CT=18.30循环之间,R2>O.98(越接近l越准确),Slope=(.3.58)一(·3.10),Efficiency=90%-l10%(100%最好),CT(NTC)=0或者CT(NTC)-CT(样品)>t5。2.2.10.6实时荧光PCR检测经过2.2.12.6条件的优化,确定了这四对荧光定量引物的最佳退火温度为58"(2。模板稀释浓度分别在10.100倍之间,每个样品三个重复,扩增体系如下:2.5×RealMasterMix11.25laL,正向引物200nM,反向引物200nM,反转录产物2“L,ddl120定容到25“L。按上述反应体系先将除模板外的其他各种试剂混匀,然后分装到八连管中,最后加模板。结合SYBR试剂盒说明书和仪器说明书对程序进行设计。实时荧光PCR程序如下:95.0oC/2mira95.0oC/15see,58.0oC/30sec,68.0℃/30see,45个循环;68.0oC/3min:55.00C.95.00C/30sec(溶解曲线数据收集和分析)2.2.10.7基因相对表达量的计算方法反应结束后,利用2也△CT法进行数据处理(Livak等,2001),这种方法的前提是lI标基因和参照基因扩增效率都接近100%,且相互间效率偏差在5%以内。如果目标坫凶和参照基因有相似且接近100%的扩增效率,即可利用2。△△Q法确定不同样本中目标楚因表达水平的相对差异。用Bio.RadiQ5专用软件对数据进行分析或者用Excel和DPS7.05进行数据处理。步骤如下:首先,对所有的测试样和校准样本用内参基因的Ct值归一目标基因的Ct值:△Ct(rest)2Ct(targct,test)一Ct(ref,test)△Ct(calibrator)2Ct(t盯get,calibrator)-Ct‘rcf,calibmtor)其次,用校准样本的△Ct值归一试验样本的ACt值:△△Ct=△Ct(蝌)-△Ct(calibrator)最后,计算表达水平比率:2-AACt=表达量的比值(即处理后样本是处理前样本的多少倍)得到的结果是通过参照基因表达水平校准的试验样本中目标基因相对于校准样本的增JJIl或减少的倍数,用参照基因校准目标基因表达的目的是弥补样本组织量的差异。2.2.1l’FVBMVHC.Pro瞬时表达系统GFPmRNA积累量47 烟草脉带仡叶病毒和马铃薯A病毒HC.Pro调控RNA沉默抑制、协生和致病力的机制2.2.11.1植物总RNA的提取待测植物组织总RNA的提取步骤同2.2.12.2。2.2.11.2在含有甲醛的凝胶上进行RNA电泳2.2.11.2.1溶液配制5×甲醛凝胶电泳缓冲液(DEPC处理水配制):0.1MMOPS,40mMNaAC,5mMED7I'A(PH8.O),配置好后避光保存。总RNA上样缓冲液(5×):1.6¨L饱和溴酚蓝,8¨LO.5MEDTA(PH8.O),72laL甲醛,308.4pL去离子甲酰胺,400laL5XMOPS缓冲液,200laL甘油,llaLEB。2.2.11.2.2电泳过程电泳前把电泳所用的板,电泳槽和梳子用3%的双氧水处理至少lh,然后用无水乙醇干燥,灭菌的DEPC水冲洗晾干,备用。RNA电泳时需要先取5lagRNA预跑电泳,凋褴上样量,取20一30¨g电泳,步骤如下:1)配制甲醛变性凝胶:1.5g琼脂粉,100mL1×MOPS电泳缓冲液,2mL甲醛。2)样品处理:在一用DEPC处理的1.5mL离心管内按比例于20lagRNA中加入5×上样缓冲液,65℃温浴15min,冰浴冷却后瞬离。3)凝胶预电泳5min,电压为5V/cm,随后将样品加至凝胶加样孔。4)3.4V/cm电压下电泳2h,电泳完毕后,在紫外灯下观察结果,拍照记录。2.2.“.3转膜及固定配制溶液:20×SSC-175.3gNaCl,88.2g柠檬酸钠。定容到800mL,溶解后用HCI调pH值至7.0,按l:1000比例加入DEPC,37℃过夜处理,高压灭菌后,室温保存。转膜过程:1)电泳完毕后,迅速把甲醛凝胶用DEPC处理水冲洗2次。用O.05MNaOH浸泡凝胶20min。2)用DEPC水冲洗凝胶,并用20xSSC浸泡凝胶45min。3)搭桥:剪托盘大小的三层滤纸,用20xSSC浸泡后,设置好转移装置,将滤纸平铺于平台上,用玻璃棒赶走平台与滤纸之间的气泡。4)将凝胶反扣于滤纸上,用刀切除凝胶中无样品部分,玻璃棒赶走气泡。5)用保鲜膜将凝胶的四周封闭后,在凝胶上先后放置用20xSSC浸泡的到HybondTM.盯尼龙膜和两张3mill滤纸,用玻璃棒赶除气泡后,再在其上覆盖49 山东农业火学博:k学位论文多层吸水纸,并压0.5蚝的重物。转移20-24h中间更换吸水纸4.5次。RNA在膜一12的固定:1)转移结束后,取出尼龙膜,室温下放入6xSSC溶液中,浸泡5min。2)从6×SSC溶液中取出尼龙膜,并放在双层滤纸中间,于室温下凉干。3)将膜置于滤纸上,紫外交联lmin.1min40sec。4)80℃烤膜30min,取出用保鲜膜将滤纸四边密封包好,4。C备用。22l1.4DIG标记探针制备按J!=【{岁氏公司的DIGNorthemStaggerKit说明书进行探针合成。分别设计引物扩增GI:P片段和TVBMVCP片段用于探针合成,引物序列如表2.6。PCR扩增目的片段,绛凝胶回收后,纯化备用。表2-6探针的引物设汁Table2-6PrimersforprobeGI?P.FT7.GFP—RTVBMVCP.FT7.CP—RAl’G人G1’AAAGGAGAAGAACTAATACGACTCACl’ATAGGGTrrGTAGAGCTCATCCATGCGAGGAAGTl’GTGCATCAGGTAATACGACTCACTATAGGGCACGCCATTCACACCAAGl’A沣:‘F划线部分足T7启动予.|予列取⋯只经过DEPC处理并高压灭菌的无RNase污染的1.5mL离心管中依次加入:200ngPCR回收片段,4“L5xLabelingmix,4I.tL5×Transcriptionbuffer,T7RNA聚介怫2“L。混合后,短暂离心,42"C保温反应lh。加入2p.LDNaseI,37"(2温育15min。加入2“LO.2MEDTA(pH8.0)终止反应。2.2.11.5DIG标记有效性检测2.2.11.5.1溶液配制RNA稀释缓冲液(RNAdilutionbuffer):按照以下比例配制,DEPCH20:20XSSC:Il:麟为5:3:2,需先用现配。上§米酸溶液(Maleicacidbuffer):0.1M马来酸,O.15MNacl,NaOH调pH7.5。漂沈缓冲液(Washingbuffer):马来酸溶液+O.3%(VⅣ)Tween20。榆测缓冲液(Detectionbuffer):0.1MTris.Hcl,0.1MNacl。Nfdj缓冲液(Blockingbuffer):用马来酸溶液稀释lO倍封闭液到l倍。49 烟学:脉带花叶病毒和马铃薯A病毒HC.Pro调控RNA沉默抑制、协生和敛病力的机制抗体缓冲液(Antibodysolution):第一次使用前将Anti.Dig.AP,10000r/min,5min:以后使用前只需要离心lmin,后用封闭缓冲液稀释l:10000(75mU/mL)。杂交缓冲液(DIGEasyHybworkingsolution):分两次将64mLddH20加入到I)IGEasyHybGranules,放于37度摇动溶解5min。2.2.11.5.2检测步骤1)取7支DEPC处理并高压灭菌的无RNase污染的1.5mL离心管,将待测定的标记RNA和对照RNA按照下列比例稀释成一系列浓度(表2—7)。2)点样及固定,分别从7个小管中各吸取1肛L点到尼龙膜上。120"C,烤膜30min。3)将膜置于干热灭菌培养皿,加10mL漂洗缓冲液,室温摇床平衡2min。4)在封闭缓冲液(10mL)中孵育30min。5)在稀释好的10mL抗体缓冲液中孵育30min。6)沈膜,20mL漂洗缓冲液,2次,每次15min。7)显色,在10mL检测缓冲液中平衡2.5min。8)将膜置于展丌槽上,使RNA面朝上,加入l滴CDPStar到膜j:,让底物溶}f芟均匀扩散到膜的表面,然后将膜放平,用一张润湿的滤纸轻轻排除气泡,使腆四周被液体封闭,放入暗盒中,37℃烘箱放置20min左右。9)暗室压X光片,在显影液中显影,定影液中定影。10)比较对照和探针样品的斑点强度,估测DIG标记的RNA的浓度。2.2.“.6杂交1)将膜放入杂交管中,非RNA接触面贴壁,加少量DEPC处理的水浸濉腆Jf:越尽气泡,加入5—10mL预热的杂交液,于杂交炉中56℃预杂交4h。2)取3.O此探针(要求最终浓度100ng/mL),加入100p.L杂交液,混匀,于沸水中变性5min,然后冰浴5min,加入到5mL新鲜预热的杂交液。3)56℃杂交过夜,24h左右。4)洗膜:先用2×SSC,O.1%SDS室温下(15-25"(2)沈膜2次,每次5rain:iq:JI]o.IXSSC,0.1%SDS42℃沈膜2次,每次15min。5)将膜置于一个干净的培养皿,洗膜缓冲液沈膜2min。6)倒掉沈膜缓冲液,将膜置于封闭液中,室温下轻轻摇动封闭30min。7)在封闭完成后,将膜置于抗体溶液中,室温下40min-8)倒掉抗体溶液,室温下用洗膜缓冲液沈膜2次,每次15min。蜘 山东农业大学博:I:学位论文9)倒掉沈腆缓冲液,将膜置于检测缓冲液中平衡2~5min。10)将腆簧于展丌槽上,使RNA面朝上,将膜置于一保鲜膜中,用镊子轻轻抬起一角,用一消毒的吸管从膜顶端加入O.5mL(大约4滴)化学发光底物,让底物溶液均匀扩散到膜的表面,然后将膜放平,用一张润湿的滤纸轻轻排除气泡,使膜四周被液体封闭,放入暗盒中,与37。C烘箱放置20min左右。11)存暗室压片子、显影、定影。表2.7标让探针及对照稀释系列Table2-7DilutionseriesoflabeledprobeandcontrolRNA2.2.127I'VBMVHC.Pro瞬时表达系统GFPsiRNA积累量2.2.12.1植物siRNA的提取参考Rosas.C磊rdcnas等(2011)的方法提取植物siRNA(Rosas.C舀.rdenas等,2011)。捉收少骤如下:.1)取O.5g植物组织,液氮中充分研磨,分装到4个1.5mL的离心管中,加入500¨LLiCI提取缓冲液(100mMLiCl,l00mMTris-CIpH8.0,10mMEDTApH8.0,1%SDS)和500“LTris饱和酚(pH8.0)。2)摇动或涡旋1min,将样品置于冰上直到所有样品都研磨完。3)60℃,温育5min。4)4"C,13000r/min,10min。5)转移上清到新的离心管,加入600p.L氯仿.异戊醇(24:1),震荡混匀,13000r/min,10min。6)转移上清,65℃,15min。7)1JslA.50p.1。5MNacl和63laL40%PEG8000,涡旋混匀,冰上放置30min。8)4"C,13000r/min,10rain(上fi{f含小分子量RNA,沉淀是大分子量RNA)。5I 塑皇些带花叶病毒和马铃薯A病毒HC-Pro调控RNA沉默抑制、协生和致病力的机制9)转移上清,加入500pL酚.氯仿.异戊醇(25:24:1)抽提。‘10)4"C,13000r/min,10min。l1)转移上清加入等体积异丙醇,室温放置10min。12)4℃,13000r/min,20min。13)用1mL75%的乙醇洗涤沉淀。在4"C,8000r/min离心5min,弃上清。14)稍微干燥沉淀,每管中加入100pLDEPCddH20溶解。15)合成一管,加入40p.L3MNaAC(pH5.2)和1000p.L无水乙醇,.20"C7.)t:淀过夜。‘16)4"C,13000r/min,10min。17)用lmL75%的乙醇洗涤沉淀。在4"C,8000r/min离心5min,弃上消。18)干燥沉淀,301.tLDEPCddH20溶解,测定RNA的浓度和纯度,.80。C备『『J。2.2.12.2siRNA电泳(聚丙烯酰胺凝胶电泳)配制溶液:1)50XMOPS—NaOH电泳缓冲液(pH7.0):lMMOPS用DEPC处理的水溶解J.j,NaOH调pH7.0。2)ARC·BIS(40%):DEPC水溶解38g丙烯酰胺和2g甲叉双丙烯酰胺,37"Cii:f解,DEPC水定容到100mL,过滤后4"C保存。3)10%APS(过硫酸铵):O.1g过硫酸铵,加入lmLDEPC水。4)6X上样缓冲液:0.25%的溴酚蓝溶解到30%的甘油中,.20"C可以保存数』J。电泳步骤:1.制备dPAG凝胶(2.2.5h)1)胶板用70%酒精擦拭,用3%H202浸泡过夜,DEPC水洗干净。2)配胶,1.5n'll'll胶板需要30mL,配15%浓度30mL体系:11.25mL40%丙烯酰胺(19:1),12.6g尿素,0.6mL50xMops—NaOH,180p.L10%过硫酸铵,15“LTEMED,DEPC水补齐到30mL。3)灌胶后室温凝却>2h,或者用保鲜膜包裹后过夜。.2.跑胶1)移除梳子,胶在电泳液中(20mMMops-NaOHpH7.0)预跑,取和电泳时相同的电压,300-400V,预跑至少10min。2)预跑时我们准备RNA样品,取lO一20¨g加入了去离子甲酰胺的样-口I按比例与, 山东农业人学博二I:学位论文加入6-×loadingbuffer,95"(2变性1.5min,立刻放冰上。3)上样前,用注射器或者移液器冲洗上样孔,防止孔底析出的尿素影n向电泳。4)上样RNA样品,按说明书要求制备dsRNAmarker,记号上样顺序,300.400V电压电泳,一般350V2.5h(也可60.90V跑12.16h)。在15%凝胶中,溴酚蓝前边的带约与10ntRNA一致。5)卸胶,并标记一角,记号加样顺序。3.删察}【l泳结果将胶小心的置于新鲜制备的EB溶液(20mMMops-NaOHpH7.0,EBO.5gg/mL)中染色5-10min,紫外观察,切下包含10nt.50nt的胶块,标记RNA加样顺序,DEPC水冲洗两遍,测量大小准备转膜。2.2.12.3siRNA转膜及固定l。!DC交联溶液:用前1.2h内配制,9mLDEPC处理的水中加入245gLl.甲基咪唑,川II(?l渊plI8.0,刚前儿分钟将上述溶液中加人O.753gEDC,并定容到24mL。1.转腆及幽定1)剪切三层相同大小的滤纸及不带电荷的尼龙膜,切角标记,置于DEPC水中浸泡预湿。2)电转移海绵挚用新鲜电泳液(20mMMops-NaOHpH7.0)预湿,从负极剑上}三极依次为:三层滤纸,胶,膜,再三层滤纸,盖上另外一个海绵垫。3)4"C,20m八1.5h转膜(4.5cmX7cm)。4)铂J转膜设备,标记RNA面(避免RNA面接触任何物体)。5)准备好保鲜膜置于桌面上,将饱和的滤纸放上,放上膜(没有RNA的一面接触滤纸),用保鲜膜小心包好放于培养皿上,60℃交联lh。6)紫外交联1.5min(可选),晾干后,.20℃保存,备用。2.2.12.4siRNA杂交为穹炎少骤同mRNA杂交步骤2.2.13.6,预杂交温度和杂交温度是37"C。2.2.13PVAIIC.Pro瞬时表达系统mRNA和siRNA积累量2.2.13.1植物总RNA和小RNA的提取(热酚法)1)取O.1—1g植物叶片,液氮研磨。、2)加入热酚缓冲液(1.5mLLicl提取缓冲液+1.5mL水饱和酚),80℃预热,将粉 烟草脉带花叶I;jj毒和马铃薯A病毒HC.Pm调控RNA沉默抑制、协生和致病力的机制末转移到小管内,震荡20see。’3)加750p.L氯仿,震荡20sec。4)室温12000.13000r/min离心10min。5)收集上清(约2mL),加入等体积的4MLiCI.20℃过夜。6)4"C,12000r/min,15min,上清液用于小RNA提取,沉淀用于mRNA提取。mRNA的提取:1)沉淀稍微吸干,悬浮于300gL用DEPC水处理过的TEbuffer中。2)1.5mL离,Ii,管加入1/10体积(30gL)的3MNaAc(pH5.2)和2倍体积的乙醇(600gL)。吸入TE悬浮液。3)将混合物放置.20℃至少3小时。4)在4℃,12000r/min,15min,收集沉淀。5)用lmL75%的乙醇洗涤沉淀。在4。C,12000g,离心2.3S。6)吸干残余液体,室温5min,50gLDEPC水回溶沉淀,室温5min,.80"C储存。7)稀释100×,测定浓度及纯度。提取小RNA:1)若用10mL离心管,则将上清分两管,约2mL/管,往上清液加入l/10体移5fl,J3MNaAc(pH5.2)和2倍体积的乙醇(4mL)。2)将混合物放置.20℃培养至少3h。3)4。C,12000r/min,离心15min,收集沉淀。4)用70%乙醇洗涤沉淀,8000r/min,lmin。弃上清。5)用100gL的水悬浮沉淀,合成一管,加入900gL的Trizol试剂,震荡20s,室温放置5min。6)加入200gL的氯仿,震荡20s。室温放置5min。7)4"C,12000g离心15min,转移上清。8)加入500gL的异丙醇,颠倒混合3次,室温放置10min。9)4"C,12000g离心10min,收集沉淀。10)用lmL75%的乙醇洗涤沉淀。在4℃,8000r/min离心5min,弃上消。l1)重复步骤lO,以除去剩余的异丙醇。12)开盖放置5min,待沉淀干燥,用20pL的水回溶沉淀。检测提取纯度。2.2.13.2转膜及固定 山东农业大学博士学位论文mRNA和siRNA的转膜过程分别与2.2.13.3和2.2.14.3相同。2.2.13.3同位素标记探针PCR产物凝胶回收后,参考Promega公司Prime.a.GeneTMlabelingSystem方法合成探针。首先加入5.0pLPCR回收产物,27pLH20,煮沸5.10min冰上冷却,然后加入lO“L5×buffer,2gLdATP/dGTP/dTTP,2pLBSA,1gLKlenowDNApolymeraseI,3I.tl。【a.p32]dCTP,混匀,瞬离后置于室温(25℃)lh合成探针。2.2.13.4杂交过程1.溶液配制预杂交液10mL体系包含:4.5mL去离子甲酰胺,3.5mL20%SDS,lmL3MNacl,0.2ml。I)cnhart’Sreagent(100X),0.5mLPB,10mg变性的鲑精DNA。PB10mL:4.23mL1MNaH2P04,5.77mL1MNa2HP04。100XDenhart’Ssolution(25mL):0.59Ficoll400,O.5gPVPK30,O.5gBSA。2.为鼍交过程1)杂交管用自来水洗洁净冲洗干净,确定不会漏液,DEPC水冲洗,晾干。2)将膜置于杂交管中,用6xSSC润湿,膜的RNA面朝上,非RNA面贴壁。3)将鲑鱼精DNA煮沸5.10min,冰浴5min,100gL加入到10mL预杂交液(1oog/mL)中,混匀。4)将杂交管中的SSC倒掉,加入预杂交液。杂交炉55℃或者37℃预杂交12h(mRNA55℃,小RNA37℃)。5)将合成的探针置于沸水浴10min,冰浴5min,瞬离,加入到新鲜的预杂交液16h(mRNA55℃,小RNA37℃)。6)洗膜,2xSSC,O.2%SDS30mL,20min一次,0.2xSSC,O.2%SDS20mL,42℃10min两次。7)腆干ilj微晾-.I二,将膜置于两层保鲜膜之I’日J,RNA接触面朝接触磷屏,压平沾好,室温放簧合适的(mRNA12h,siRNA4天),然后扫描磷屏。2.2.14半定量PCR检测PVXCP及TVBMVHC.Pro积累量械物病毒总RNA的提取:采用北京全式金公司总RNA提取试剂盒(TransZ01)提收总RNA,方法同2.2.12.2。\jill过Scanl)rop微砒分光光度汁对所得RNA的浓度和纯度进行测定,将各个样品的55 烟草脉带花叶病毒和马铃薯A病毒HC.Pro调控RNA沉默抑制、协生和敛7lji力的机制总RNA稀释为同一浓度后,用Oligo(dT)反转录。特异性引物检测目的基因PVXCP秉fTVBMVHC—Pro及内参基因EFla的积累量,引物如表2-6。表2_6半定量RT-PCR所用引物Table2-6PrimersusedforsemiquantitativeRT-PCRPrimcrnamePrimersequence(5'-3’)PVXCP.FPVXCP—RTVBMVHC.Pro.FTVBMVHC.Pro-REFla—FEFla.RGAGGATCCGTCAGCACCAGCl’AGCACAACCGAAGCTTTTATGGTGGTGGTAGAGTGACATGTCAGCGGCAGAGCAA下TTT兀AGCCAACTCTATAATGCTTCA-11TCAGACCACCAAGl’ACTACTGCACCCACCAATCTTGTACACATCC扩增反应体系为:2gL10xPCRBuffer,1.0gLdNTP(2.5mM),1.0gL引物F,1.0gL引物R,0.2gLrTaqDNA聚合酶,1.0laLcDNA,加ddH20至20.0gI。。PCR反应条件:预变性温度94。C,3min:然后94。C变性50sec,58℃退火(PVXCP延伸lmin,TVBMVHC.Pro延伸lmin30sec,EFla延伸30sec),72。C延伸50SCC,32个循环。最后72*(2延伸10min,PCR产物进行1.0%琼脂糖凝胶电泳检测。 山东农业人学博二L学位论文3结果与分析3.1载体的构建3.1.1载体pCaHC和pCaGFP的构建以TVBMV的侵染性克隆pTVBMV-GFP为模板,分别同时扩增TVBMVHC.Pro和35S及U‘I'R序列,凝胶电泳结果表明分别得到了1300bp和1000bp左右的片段,经收肝,分别以两个片段为模板进行融合PCR,得到多个条带,N@NNNf,J2300bpn,J”段(1纠3—1A)。经酶切连接,将融合片段克隆到载体pCAMBIA0390多克隆位点区域,酶切鉴定后,得NIgH性重组质粒pCaHC(图3—1B)。同样的方法得到pCaGFP重纰质粒(图3.1C,D)。A圈CD图3.1pCaHC和pCaGFP载体构建电泳图A.35S及UTR羽I}lC-1)rO融合PCR结果:B.重组质粒pCaHC酶切鉴定:C,35S及UTR和GFP融合PCR结果:D,重组质粒pCaGFP酶切鉴定;M:核陂markerDL2000plus,从一}::往下的条带为5000bp、3000bp、2000bp,1000bp、750bp、500bp:I和5:pCAMBIA0390:2:承纽质粒pCaHC:3.-重组质粒pCaHC用Sail和Smal双酶切:4,重组质粒pCaGFl'用丹,I和XmaI双酶切;6,重组质粒pCaGFPFig.3-1ConstructionofpCaHCandpCaGFPvectorsA.Amplificationof35S,UTRandHC-ProwithoverlapPCR;B,IdentificationofrecombinantplasmidpCaHCbycnzymedigestion;C,Amplificationofof35S。UTRandGFPwithoverlapPCR;D。IdentificationofrecombinantplasmidpCaGFPwithenzymedigestion;M:DNAMarkerDL2000plus.thebandsfromtoparc5000bp、3000bp、2000bp、1000bp、750bp、500bp;land5:pC'AMBIA0390:2:RecombinantplasmidpCaHC;3:DigestedpCaHCbySail和Sinai;4:RecombinantplasmidpCaGFP;5:DigestedpCaGFPbyPstlandXmal.3.1.2载体pCahpGFP的构建在pCaGFP载体的基础上构建pCahpGFP,用携带XmaI和Sad酶切位点的引物扩增褂剑GFt’N一端506bp的片段,酶切后,与同样酶切的pCahpGFP载体连接,重组质57 烟草脉带花叶病毒和马铃薯A病毒HC.?Pro调控RNA沉默抑制、协生和致病力的机制粒经XmaI和SacI双酶切能够切凸500bp左右的条带,为了进一步的验证,又利用Pstl和XmaI对重组质粒进行酶切,也得到了预期的2200bp左右的目标条带(35S+UT艮f-GFI,全长+GFP506bp),确定pCahpGFP构建成功(图3—2)。幽3.2pCahpGFP载体的构建l:pCAMBIA0390;2,3,4,9:重组质粒:M:DNAMarkerDL2000plus:5,6,7:重组质粒Xmal和Sacl酶切:8:重组质粒^fI和Xmal酶切Fig.3-2ConstructionofpCahpGFPvectorI:pCAMBIA0390;2,3,4and9:Recombinantplasmids;5,6,7:DigestedbyXmaIandSacI;8:Digestedby几fIandXmaI.3.I.3载体PVXHC构建分别扩增TVBMV和PVAHC.Pro基因的序列,扩增片段长度约为1300bp,分别利用ClaI和Sail及AscI和Sail双酶切后连入同样双酶切的pGRl06载体,分别得到-j,嵌合病毒PVXHC—T和PVXHC.P,重组质粒经酶切验证,确认为阳性克隆(图3.3)。图3.3PVXHC-T和PVXHC.P嵌合病毒载体的构建l:Clal和Sail双酶切重组质粒PVXHC-T;2:重组质粒PVXHC.T.3:pgRl06载体;4:重组质粒PVXHC·P:5:Ascl和鼬J『I双酶切重组质粒PVXHC·P.Fig.3·3ConstructionofPVXHC-TandPVXHC-PI:PVXHC-TdigestedbyCialandSa/l;2and4:Recombinantplasmids;5:PVXHC-PdigestedbyAsclandSail.3.2HC—Pro突变体的获得基于野生型pCaHC、PVXHC.T和pTVBMV-GFP载体,针对HC-Pro的保:):曼叭二或者氨基酸、预测的具有功能的基序及已知可能具有功能的氨基酸进行定点突变,经测序验证,分别成功得到了18个突变体(表3—1)。TVBIvlVHC.Pro第6位的苯丙氨酸(17) 山东农业火学博.】:学位论文’灶,.§铃薯Y病毒属病毒中较为保守的位点,将其缺失得到F6Del;类似锌指结构域的lIIH(和1QC,将其中第26位的精氨酸(R)突变为半胱氨酸(C)得到HEC突变体,将58位的半胱氨酸(C)突变为异亮氨酸(I)得到突变体IQI;糖基化位点的突变体AR'I’、APS和AGS,分别是将N168RT、N192PS和N243GS中天冬酰胺(N)分别突变为丙氨酸(A)得到;与症状表达和抑制RNA沉默活性相关的FRl82NK基序突变为FIt82NK;f讧J:FRNK批序下游的保守基序CDN被认为是与症状表达及病毒积累相关的保守基序,本研究中将带负电的天冬氨酸D198分别突变成带正电荷和不带电荷的氨基酸,得剑7个突变体;将与基因组复制相关的基序1250(j25lN分别进行单位点突变和双位点突变,得到S2soQN和D250E25lN:此外本研究还将与蚜传相关的两个基序Rs2ITC和PT3iK分别突变为Es21TC和PA311K。表3.1TVBMVHC.Pro突变体及其功能表现Table3-ITVBMVHC·Promutantstestedinthisreseachandtheirphenotypes“:’I'hcmutantdidnotsuccessfulinpCaTVBMV-GFPvector;j占于pAHC(含PVAHC—Pro)和PVXHC-P(含PVAHC-Pro)两个载体进行PVAl1(7.Prof内定点突变。分别在HC.Pro的13个位点,进行缺失和替换得到了18个突变体。返J|呼化正i他括一个保守位点(F6Del)、柑基化位点(NllDel和N167A)、类似锌指结59 烟草脉带花叶病毒和马铃薯A病毒HC.Pro调控RNA沉默抑制、协生和致病力的机制构域(H24Del)、蚜传相关的位点(K51A、C54DeI、C54A和K311A)、可能与基闪复制相关的位点(CCC.AAA、N251R、1249DG250E和1316KG317E)、与症状表达羽l扣J制RNA沉默活性相关的位点(R181AKl83A、D197K、D197Y、D197A、D1971:和I)19711)。这些突变体经测序确定已经突变成功。Table3-2PVAHC—Pro参与抑制RNA沉默活性、协生的氨皋限位点Table3-2PVAHC-Promutantstestedinthisresearchandtheirphcnotypes“+’’:ThesemutantshavesuppressRNAsilencingactivityandmediatedsynergism;“-”:LossactivityofsuppressRNAsilencingandmediatedsynergism.3.3TVBMVHC.Pro参与抑制RNA沉默的氨基酸位点3.3.1TVBMVHC.Pro抑制RNA沉默活性的瞬时表达体系将构建好的pCaHC、pCaGFP和pCahpGFP载体转化农杆菌GV3101,经菌落PCR鉴定后,分别诱导并按照不同的组合注射本氏烟。浸润48h开始观察荧光,以后{《隔24小时观察一次。浸润48h后,单独浸润pCaGFP的叶片能够观察到微弱的绿色荧光,之后荧光量一直减弱。96h时,单独浸润pCaGFP的叶片已经观察不到明显的荧光。m60 山东农业人学博小学位论文独注埘pCahpGFP或pCAMBIA和共同浸润pCaGFP+pCahpGFP+pCAMBIA的本氏烟叶”一直观察不到绿色荧光;用含pCaGFP+pCahpGFP+pCaHC的农杆菌共浸润的本氏则l}I.片中绿色荧光一直很强(图3—4)。Westem分析也证明GFP在三者共浸润的叶”lI表达跫较高。说明构建的pCaHC载体可以用来研究HC-Pro的抑制RNA沉默活性。ApCaGFPpCahpGFPStem506bpLoop202bpBpcaGFPpcaGFP+pcahpGFPI’CaGFP+pCahpGFP+幽3-4分析TVBMVHC.Pro突变体抑制RNA沉默活性的瞬时表达体系A:基于35S启动子的表达载体示意图:B:浸润叶片紫外灯下观察结果I?峨3·41'hctransientexpressionsystemforstudyingRNAsilencingsuppressionactivityofTVBMVHC·Promutants.^:SchematicrepresentationofgencexpressionvectorsunderCaMV35Spromoter;B:LeavesofNicotianabenthamianawerephotographedunderUVlightat6dayspostinfiltrationandanalyzedbywesternblttin&3.3.2突变体浸润本氏烟叶片荧光观察将突变质粒(pCanCmut)、野生型HC(pCaHCwt)质粒、pCaGFP、pCahpGFP和pCAMBIA分别转化农杆菌GV3101,经PCR鉴定后,诱导表达含有预期质粒的农杆懈。将含有突变体质粒pCaHCmut、野生型质粒pCaHCwt或pCAMBIA质粒的农杆菌分刖‘。jpCaGFP、pCahpGFP按1:1:1的比例混合,将混合液注射本氏烟,其中pCaHCwt+pCaGI?P+pCahpGFP和pCAMBIA+pCaGFPq-pCahpGFP的浸润区域分别作为阳性利卧队刈’照,通过荧光观察初步确定各个突变体的抑制RNA沉默活性。没涧后48h-J]:始观察荧光,突变体EITC、APS、AGS、SQN、PAK、D198Y、D198F、\1)198(3、D198R.、D198H和HEC农杆菌共浸润叶片与含野生型pCaHC的农杆菌共浸润6l 烟草脉带花叶病毒和马铃薯A病毒HC-Pro调控RNA沉默抑制、协生和致病力的机制的本氏烟叶片~样,都从48小时开始表现荧光,而且直到第8天荧光一直存在。除AGS外,其他10个突变体和野生型HC—Pro浸润叶片的荧光强度一直在增加。到浸润后筇6天,PAK、D198F、HEC和D198H浸润叶片荧光强度稍微高于浸润阳性对照的叶片,其他7个突变体浸润的叶片荧光强度与野生型HCwt阳性对照共浸润的叶片荧光强度没有明显区别。而AGS浸润的本氏烟叶片的荧光强度从第四天开始减弱,到第6天时‘j野生型HCwt浸润的叶片荧光强度相比有明显的减弱(图3.5)。浸润D198A的叶片从浸润后48小时表现微弱的荧光,之后到第6天没有明显变化(图3—5)。突变体F6Del、IQI、FINK、D198K、ART和DEN与pCaGFP、pCahpGFP浸润的叶片同阴性对照pCAMBIA与pCaGFP、pCahpGFP农杆菌共浸润的叫‘片一样‘直没有观察到明显的绿色荧光(图3.5)。GFP+hpGFP+广)1c·8Fr)1q矗Hn10只AFRrjoHFc-;囵囹囵图口国口国■国雹k:一_k翟k鲞k凋L翟口口囝曰国■卜.一,一缨图l,.j瑚『’.。‘浔r.霜I:一’1’强r.。■■翟k盈ka■叠豳k一图3-5TVBMVHC.Pro突变体浸润本氏烟叶片紫外灯下观察结果Fig.3-5LeavesofN.benthamianawerephotographedunderUVlightat6dayspostinfiltradonwithAgobacteriumcontainingplasmidsofpCaGFP,pCahpGFPandTVBMVHC·Pr0wildtype.orHC—P巾withmutationsorpCAMBIA.3.3.3Westernblotting检测GFP表达量采集注射后第6天的叶片注射区域,按照O.1g加入100gL蛋白提取液的比例提取62 山东农业大学博:I:学位论文机物总蛋白,取相同体积的上清进行上样,Westemblotting检测GFP蛋白的表达量。t绌粜农明,在有荧光表现的叶片区域中均能检测到28kDaGFP明显的表达。突变体PAK剁I)1981:浸润叶片中GFP的表达量明显高于野生型HCwt浸润的叶片,EITC、APS、1)198II、l_IEC、D198Y、D198G和D198R中GFP的积累量与野生型HC的叶片中GFP农达齄基本一致,SQN和AGS稍微低于野生型HCwt浸润叶片中的GFP表达量。D198K利【)198A浸润的叶片中也能够检测到微弱的GFP条带,说明D198A和D198K突变体儿仃微弱的抑制RNA沉默活性。突变体F6Del、DEN、FINK、ART和IQI则和阴性对照pCAMBlA一样没有检测到GFP的表达(图3.6)。莳移◇夕≯夕∥∥。34kDa26kDa34kDa26kDa警j穸萝99穸芦萝图3-6W‰blotting检测GFP的积累置Fig.3-6WesternblottinganalysisofGFPaccumulationintheagroinfiltrat饿!a他船3.3.4实时荧光定量PCR检测GFP及HC,Pro相对表达量分别设计’GFP和HC.Pro的荧光定量检测引物,经过条件摸索,确定了最佳的退火泓度,并n通过构建标准曲线,确定可以用2也△Q法测定不同样本中GFP和HC.Prot荆I对表达量。比较突变体相对野生型浸润叶片中的GFPmRNA相对表达量。农杆菌共浸润后第6天采集叶片注射区域,提取植物总RNA,利用SYBR染料法进行实时定量PCR检测GFPmRNA的相对表达量(图3.7)。数据经DPS7.05单因素办蘑分析Dunkan方法计算,HCwt浸润的叶片组织中GFP的相对表达量接近1,而阴63 烟筚脉带花11r|.病毒和马铃薯A病毒HC-Pro调控RNA沉默抑制、协生和致病力的机制性对照的GFP的相对表达量接近0,与野生型HCwt和阴性对照比较,将突变体的41{埘’抑制RNA沉默分为四类(表3—2和3—3):第一类突变体的抑制RNA沉默活性足增『f玎的,它们的GFP相对表达量大于2.0,包括PAK、HEC、D198H、D198Y和D198F。其中PAK突变体的抑制RNA沉默活性最高,GFP相对表达量是野生型HC.Pro的4俯左右;HEC、D198H、D198Y和D198F四个突变体的抑制RNA活性是野生型IICwt的2—3倍;第二类突变体的抑制RNA沉默活性与野生型没有明显的区别,包括SQN、APS、EITC、D198G和D198R突变体,它们浸润浸润区域GFP的相对表达量约为1.0.笫{类突变体浸润区域的GFP表达量与阴性对照及野生型对照差异显著,认为他们‘‘l,J抑制RNA沉默活是降低的,包括AGS和D198A,它们浸润叶片的GFP的相对表迭撮分别为在0.6和0.5左右。此外还有第四类包括D198K、IQI、FINK、DEN、ART和l6I)cl突变体,他们浸润区域的GFP的相对表达量与阴性对照浸润的叶片组织中的GI1.7f门农达量没有明显的差别。同时检测了野生型HC.Pro及其突变体在浸润区域的表达,结果表明,潋涧区域野生型HC—Pro的表达量接近l,而阴性对照中没有检测到HC—Pro,浸润后第‘,、i天浸涧l×.域HC.Pro的表达量与GFP的表达量成正相关。即GFP表达量高的突变体中HC.Pro的积累量也相对较高,反之亦然。同时检测了浸润后第3天浸润区域的HC.PⅥ的表达址,各突变体中HC.Pro的表达量均少于野生型HC.Pro,但是各个突变体之间没有f!fJjiI!的夕l别(图3.8),这一结果与Gonzfilez等的结果一致(Gonzfilez.Jara等,2005),t,'lJ红第.i天时突变体HC—Pro的表达量轻微低于野生型HC.Pro。推测氨基酸的变化影响了HC.Pro的表达量或者延迟了HC.Pro大量的表达时间,而到第6天检测时,H:∑.Pro的表达量差别较大,并且与GFP的相对表达量成正相关,说明在HC.Pro表达过程中受自身的抑制RNA沉默活性的影响,抑制RNA沉默活性高的突变体在抑制GFP沉默的同时也能够抑制自身的沉默。 山东农业火学懈.Ij学位论文AB4.543.532.5Z1.5l■口0‘i,】一]一口一]由-臼.]o,】一]一口一].]刖副oL厶Ul:3盘矗叠昌勺畏2U^h耵酮IQIDENCK—FINKARTD198KAGSAPSHCwtSONEITCPAK_]耵●『I{一1●_CK—F6DelD198AHCwtD198GD198RHECD198HD198YD198F幽3.7TVBMVHC.Pro突变体相对抑制RNA沉驮活性及HC.Pro相对积累置A:10个TVBMVHC.Pro分析结果;B:8个TVBMVHC.Pro分析结果l;.3—7Relativesupp,‘essionactivityandaccumulationlevelsot’wildtypeandmutantsTVBMVHC·Pro^:Resultsol’IOTVBMVHC.Prornutans;B:ResuItsof8TVBMVHC.Promutans65o.I山.UI{lu矗;昌pIIBu【I^lpI;,-lo皇。一_l;lnl_篁=。。《≈c托xll>Ilu《.Ic蚺计o.1【I【111∽u>=嚣一u一一1O它II、乒。o葺。一_霸一昌_皇=uu《q盘矗占一>一-u《ko∽∞o.I^一【ITl∽o>一-爵一。岛 烟单脉带仡叶病毒和马铃薯A病毒HC.Pro调控RNA沉默抑制、协生和致病力的机制‘——————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————-————一t1.5O.50■HC72h—l~。,l童童.矗I童一萱盍委皋萎禹薹蚕歪要圣轰羹霎薹至呈李盆罱汪驾侣委蚤夏量霎蚕§图3.8农杆菌共浸润区域野生型和突变体TVBMVHC.Pro相对积累置Fig.3-8Relativeaccumulationofwild·typeandmutantHC-Pmintheagroinfiltratedareas表3-2TVBMVHC.Pro10个突变体相对抑制RNA沉默活性Table3-2RelativeRNAsilencingsuppressactivityofTVBMVHC.Prol0mutants沌:尸≤0.05表3·3TVBMVHC.Pro8个突变体相对抑制RNA沉默活性Table3-3RelativeRNAsilencingsuppressactivityofTVBMVHC-Pm8mutants注:尸≤0.05『上恩露銎曩曩曩醴圈匿■口o:日一rI昌=。u《。^I瓮Ia鬣o.1山.UII ⋯东农业人学博:Ij学位论义3.3.5Northern杂交检测GFPm砌蛆积累量为了更灵敏地分析各个突变体的抑制RNA沉默活性,分别选取突变体、野生型lIC—Pro和阴性对照浸润的叶片区域进行Northem杂交分析。与Westernblotting和实时。火II.光定量PCR一样,剪取农杆菌共浸润第6天的叶片的浸润区域,提取植物总RNA,川I)IG标记的GFP基因的全长片段作为探针进行Northern杂交分析。突变体数量较多,样.忆分两次进行分析,每张膜上都设阴性对照和野生型(HCwt)的阳性对照。如l图3-9,在RNA上样量基本一致的情况下,阴性对照浸润的组织中均没有检测到GFPmRNA的存在,PAK、D198F和D198G浸润区域中GFPmRNA的积累量均高Ji韭J。::l-型ItCwt:SQN、APS、D198H、D198Y和D198R浸润区域中GFPmRNA的积纵艟野qi型FICwl没有明显区别:EITC和IQI中有少量GFPmRNA的积累:ART、FINK、1)198K、I)EN、D198A和F6Del的泳道中均没有清晰的条带出现,压片时间增长时,I)198A--I,有可见的模糊条带。此结果与Western分析结果一致。、.、●’..-。.一●,、◆F÷‘、一ri,+。、。。一,、==『可身幽3-9Northernblotting分析TVBMVHC—Pro突变体瞬时表达系统GFPmRNA的积累盘Fig.3-9NorthernblotanalysisoftotalRNAextractedfromagminfiltrateApatchesat6daysaRerinfiltrationwith+TVBMVHCwtandHCmut.3.3.6Northem杂交检测GFPsiRNA积累量挺取农杆菌浸涧后第6天的小RNA,用DIG标记的GFP探针检测大小在20nt.30nt的siRNA。HCwt和HCmut中均能检测到siRNA,HCwt浸润区域的siRNA的积累螗眇j显少于阴性对照中siRNA的积累量。按照实时荧光定量分析的结果。属于抑制RNA杉C默活性增强类型的突变体PAK、HEC、D198H和D198F浸润区域的siRNA的积累量均低‘.]-野生型HCwt,D198Y的siI州A的积累量则与野生型Hewt中siRNA的积累量船:『jlJ卅、:人。而与野生型HCwt抑制RNA沉默活性相一致的SQN、APS和EITC的siRNA、l,|勺移{岽擞不同,其中突变体APS和EITC浸润区域的siRNA的积累量与野生型一致,67 烟草脉带花叶病毒和马铃薯A病毒HC—Pm调控RNA沉默抑制、协生和致病力的机制而其中SQN突变体的siRNA的积累量高于野生型HCvvt。抑制RNA沉默活性降低f内突变体AGS和D198K也有较高siRNA积累量,D198K的siRNA积累量高于野生型,AGS与野生型相同,而同属于抑制RNA沉默活性降低的D198A中的siRNA的积岽^t则远远低于野生型HCwt。荧光定量PCR检测中接近阴性对照的抑制RNA沉默活性的突变体IQI、FINK、DEN、ART、F6Del中siRNA的积累量都与阴性对照中的相同,或者稍微低于阴性对照。此外,IQI突变体浸润组织中很明显只有21.22ntsiRNA积累,较大的siRNA没有积累,其余突变体没有这种现象(图3.10)。L、、心.、\、心r、心_、0_、s。心.(。√七÷。i÷7◇§拿搴≯挚≯夕芦夕夕歹√一?图3.10Northernblotting分析TVBMVHC-Pro突变体的GFPsiRNA的积累量Fig.3-10NorthernblotanalysisofsmallRNAextractedfromagroinfiltratedpatchesat6daysafterinfiltrationwithTVBMVHCwtandHCmut.3.4TVBMVHC.Pro参与协生作用的关键氨基酸位点3.4.1症状观察将嵌合载体PVX—HCwt及PVX.HCmut转化农杆菌后,经AS和MES诱导过夜,用含AS和MES的O.1mol/L的MgCl2溶液稀释至OD600约为0.5.0.6左右,室温静簧3个小时后注射本氏烟的第3、4片叶,每个突变体各注射5棵本氏烟,同时注射pGRl06空载体作为阴性对照。于注射后第6天开始观察症状并检测PVX的积累量。结果表明:第6天,接种PVX的本氏烟上部叶片出现轻微的褪绿花叶症状,第9天PVX症状加重,出现较严重褪绿花叶,并伴随着脉明和叶片卷曲的症状,之后花l}|-和脉明症状持续向下部叶片发展,而卷曲症状则一直在新叶上表现。携带HC.Pro的PVX嵌合载体PVXI-ICwt.T和突变体PVXHCmut—T均在第7天出现症状,初期症状与PVX 山东农业大学博士学位论文川似。随着症状的发展,一接种后第9天嵌合载体突变体EITC、PAK、SQN、APS、AGS、lIli(:、D198Y、D198H、D198G、D198R、D198F和D198A侵染的植株新叶丌始出现广:,lt褥川1,叶柄两侧边缘叶脉Yl:始坏死,坏死症状发展迅速,到第15天新叶及植株上、I"-翔;IlI+J午及茎干完全坏死,一卜.部叶片变黄萎蔫,整株死亡(图3—11)。嵌合载体突变体IQI、ARq’、DEN、FINK、D198K和F6Del继第7天出现症状后,症状发展与PVX单独接种植株相似,即新叶卷曲,花叶症状持续向下部叶片发展,但是褪绿症状表现不如PVX单独接种植株的严重,对植株的生长无显著影响(如图3。11)。矧矜懈斗睽l@刚,蔑陲圈3-llPVX.HCmut接种在本氏烟上的症状表现Fig.3·lISymptomsofN.bcnthamianainfectedwithPVX·HCmut 烟掣脉带花叶病毒和马铃薯A病毒HC—Pro调控RNA沉默抑制、协生帚I毁埘力的机制3.4.2PVXCP和TVBMVHC—Pro积累量分析TVBMVHC.Pro的9个突变体接种后第五天从上部第二片叶开始采集样品,随后隔天采集,引起植株坏死的PVX.HC突变体和野生型PVX.HC采样3次,PVX及其余突变体均采样5次。提取植物总蛋白,稀释.5倍包被酶联板,利用PVXCP血清进行川接ELISA检测。结果表明:第5天没有检测到PVX的积累,之后PVX的移j祟.虢均!≯现上升趋势,并且症状出现初期,相对于PVXHC嵌合载体,单独注射PVX的机株一iI病毒积累量增加比较迅速,到第9天PVX的积累量趋于稳定。截止到接种后第9灭,PVXHCwt和PVXHCmut侵染的植株中病毒积累量与接种PVX的植株病毒累积量柚似,EITC稍微高于PVX和PVXHCwt,第13天时突变体DEN侵染的植株中病毒的浓度高于PVX接种植株。与野生型PVX.HC相比,截止到接种后第9天,各个突变体-lI病毒积累情况可以分为三种类型:第一种是EITC突变体的病毒积累量一直高于野7I-州PVX.HC;第二种是APS和AGS侵染的植株中,第7天检测时低于野生型PVX.IIC仪染的植株,而到第9天检测时比野生型野生型HCwt侵染的植株中的病毒积累量要低,说明这些突变体不影响病毒的移动,而降低了病毒的积累量;第三种是剩余的突变体即FINK、ART、PAK、SQN、IQI和DEN这5个突变体侵染的植株中病毒积累量低于野生型PVX.HC接种植株中的病毒积累量,并且在这其中FINK、IQI和ARl’的病i妊移5累量一直处于较低的水平,而PAK虽然能够引起植株的坏死,但是其炳雄{i}!岽:}i;:lp¨占低于不引起坏死的突变体(图3.12)。13dpi+空白—_.}一SON—_‘卜FINK一健康CK十ART_卜PAKd∈DEN—_c卜IQI叫一AGS—·卜EITC—_c卜一APS—叫卜一TVBMV—HC—_P—pGR106图3.12ELISA检测PVXHCwt和PVXHCmut浸润植株系统nl‘中CP的秘累置Fig.3-12ELISAanalysisoftheCPaccumulationinPVXHCwtandPVXHCmutinfectedplants5352515O32lOou盎露盂-o∞二《譬t'Qo 山东农业大学博士学位论文采集另外9个突变体浸润后第9天的系统叶片检测其CP和HC.Pro的表达,其中榆测CP时,样品稀释5倍包被酶联板,检测HC.Pro时直接研磨叶片包被酶联板。结柴农明,本氏烟叶片中PVX积累情况可以分为四类,第一类是突变体D198A,它接种的l!ll【株中PVXCP的积累量远远高于PVX中CP的积累量;第二类是HEC、D198G、PVX、D198I-1和D198K接种的植株,其PVXCP的积累量与PVX单独接种时相一致;筇_t类足与HCwt的积累量相似的突变体,它们是D198R和F6Del,另外第四类突变体·I,I'VXCP的移{累量低于野生型PVXHC接种的植株,分别是D198F和D198Y。同时我lfJ检测了HC.Pro在接种植株中的表达,发现F6Del同PVX一样没有检测到HC.Prof门农达,而其他突变体同PVXHCwt接种的植株中都能检测到HC.Pro的大量表达(图3-13),说明这个HC-Pro突变体的抑制RNA沉默活性可能也影响了自身的表达和积累。oU口嗣五Lo讷口《-^导o0d●’叵亟习鼍‘-i●●』壬‘}同.图.目.目.国.目.尉.圉.图.::,。愚.一。图.《;:30蹦≯≯≯≯≯≯≯≯≯≯≯州3-131"3。ISA检测PVXHCwt,T-aPVXHCmut浸润植株系统叶中PVXCP和TVBMVHC.Pro的积累盘I?ig.3-13E1.ISAanalysisofthePVXCPandTVBMVHC-ProaccumulationinPVXHCwtandPVXHCmutinfectedplants砒9dpi选取其r|*I10个突变体接种后第9天的叶片,通过Westernblotting检测PVXCP的太j厶I玳I‘。PVXCP的检测结果与ELISA结果基本一致:即接种后第9天,感染突变体3525l502lOouc肖口.Io∞o《S0t.Qo EITC的植株与感染野生型HCwt及PVX的植株中二的CP表达量基本一致,DEN、AGS、D198K、SQN、ART中CP的表达量基本一致,比野生型PVXHCwt感染的植株【扣cI)的表达量少,而IQI和FRNK及APS中的CP表达量明显低于野生型HCwt。即可以褂到得到CP的表达量从大Nd,依次为:EITC=HC训:=PVX>DEN>AGS=ART=SCIN>PAK>IQI=FIⅢK=APS。而与此相对应的第9天ELISA检测病毒的积累量为即EITC=HCwt=PVX>APS=DEN=S(料=AGS>ART=PAK寻IQI>FRNK。≯§拿爹≯≯F警芦≯fp爹26kDa一~u一一‘~脚⋯0嚣盖~:图3·14Westernblotting检测PVXHCwt和PVXHCmut漫润植株中PVXCP的积累量Fig.3-14WesternblottinganalysisofPVXCPaccumulationinPVXHC州andPVXHCmutinfectedplantsat9dpi3.4.3半定量RT—PCR检测PVXCP和TvBMVHC.Pro的表达提取了侵染植物系统叶片的总RNA,经DNase处理后,,进行半定量PCR检测,川EFla基因作为内参。结果发现,即使cDNA的稀释倍数到104,CP基因的目标条带搠j很难观察出差异,只有F6Del明显的少于其他突变体浸润的植株。而检测HC.Pro时发现,PVX接种植株中检测不到HC.Pro的目标条带,PVXHC野生型和突变体接利-的械株中都能检测到HC—Pro的表达。其中F6Del接种的组织ELISA方法未检测到HC.Pro表达,半定量PCR中也只能检测到较微弱的条带。其余突变体接种的叶片中均能枪测到HC.Pro的目标条带。芦≯≯≯梦≯蝌◇母∥,’‘,‘≯。,≯口◇≯≯。,毋HCCPEFHCCPEFF枣p≯。图3.15半定量RT-PCR检测PVXHC埘和PVXHCmut浸润植株Fig.3-15Semi-quantitativeRT-PCRanalysisofPVXHCwtandPVXHCmutinfectedplants72 山东农业入学博二I:学位论义3.5’I'VBMVHC.Pro参与致病力的氨基酸位点3.5.1突变体症状及荧光观察以携带GFP基因的TVBMV侵染性克隆(pCaTVBMV-GFP)为模板,得到了17个突变体,其中HEC突变体经多次突变,均未成功。将获得的突变体转化农杆菌,诱!JII泌润接种,接种后第8天,突变体EITC、AGS和SQN表现脉明及叶片卷曲的症状,oj晰化型TVBMV症状一致,说明突变未明显降低病毒致病力。突变体APS、D198Y、1)1981:、PAK和D198G在第8天症状较轻表现出脉明症状,叶片卷曲不明显,但在接利-后第15天表现出了与野生型病毒相似的症状,说明这些位点的突变延迟了症状的产生。突变体D198H和D198K在接种初期表现明脉,接种后15天上部叶片出现绿岛现缘,叶片变小畸形。突变体D198R、FINK、F6Del、D198A、DEN、IQI、ART症状明!Il!:减轻,发病后期仅表现轻微脉明症状(图3.16)。在紫外灯下,接种后第8天,突变体EITC、AGS、SQN、D198G和D198R接种植株观察剑较强的荧光,与野生型病毒的荧光强度相当。虽然突变体D198R在接种后第8天表现较明显的荧光,但是第15天出现绿色荧光有消失现象,并且症状一直较轻。j.!;利-后第8天,突变体D198H、D198F、PAK和D198A在上部叶片中荧光强度较野生型病彳{衍肖弱,突变体APS、DEN、D198K和D198Y接种的植株仅上部叶片则表现出微刺ffcJ荧光(图3.17)。之后突变体APS、D198F、PAK和D198Y中的荧光不断增强,到筇l5大时表现出与野生型病毒相当的荧光强度。突变体D198K、D198H第10天上部⋯‘片表现较强的绿色荧光,但是接种后第15天,D198H叶片的隆起区域不表现绿色荧光,与D198H不同的是D198K侵染植株的其他叶片大部分区域都不表现荧光,并且荧光慢皮明显低于D198H。突变体D198A在接种后第lO天上部叶片绿色荧光开始消失,到接种后15天,D198A的上部叶片除了主叶脉和二到三级叶脉,叶片其他区域均不表脱绿f‘I荧光(图3.18)。突变体FINK、F6Del、IQI和ART仅观察到微弱的荧光,接种肝2l天基本上观察不到荧光,说明该位点的突变明显降低了病毒的致病力并且病毒的彩{岽玳也有明显的降低。73 烟草脉带花叶病毒和马铃薯A病毒HC—Pro调控RNA沉默抑制、协生和致病力的机制图3—16pTVBMV如FP突变体接种本氏烟8天后的症状表现Fig.3-16SymptomsofN.benthamianainfectedwithpCaTVBMV-GFPmutantsat8dayspost—inoculation74 山东农业火学博二I:学位论文圈3·17pTVBMV-GFP接种植株上部系统侵染叶片绿色荧光的观察g.3-17GreenfluorescenceobservedunderUVlightintheⅣbenthamianaleavessystemicallyinfectedwithpCaTVBMV-GFPmutantsat8dayspost-inoculation. 烟草脉带花叶病毒和马铃薯A病毒HC.Pro调控RNA沉默抑制、协生和致病力的机制D198AD198AD198RD198KD198H10dpi15dpi图3.18pTVBMV-GFP突变体接种植株系统叶片GFP表达及症状表现Fig.3-18GreenfluorcsccnccproteinexpressionintheⅣ'benthamianaIcavcssystemicallyinfectedwithpCaTVBMV-GFPmumntsat10andI5dayspost·inoculation. 山东农业大学博士学位论文3.5.27rVBMV病毒浓度及CPmRNA相对积累量为了检测TVBMV突变体在本氏烟中病毒的积累量,我们在接种后第11天采集样I‘lft进行ELISA检测(图3.19)。突变体EITC、AGS和SQN接种植株的病毒浓度接近野生型病毒积累量,说明这三个单位点的突变均没有引起的症状与接种植株中病毒的积岽挝的变化。突变体PAK、D198Y、D198G、D198H和D198F中的病毒积累量低于野,I-)‰巧谁的病毒积累量,同时症状观察发现这些位点能够延迟病毒发病。突变体D198A、I)198R和APS病毒积累量较低,突变体IQI、DEN、ART、F6Del、D198K和FINK病繇积累量接近阴性,说明这些位点的突变影响了病毒的致病力,同时影响了病毒积累量(1纠3.19)。利用实时荧光定量PCR的方法检测了接种后11天TVBMVCPmRNA的积累量(图3—20),结果表明突变体AGS、EITC和D198G中CPmRNA相对积累量接近1.0,与野7I-JI|;I!’敛,突变体PAK、D198H、D198F、D198A和D198Y接种植株中CPmRNA积乐HI⋯氐I-'-野生型病毒接种植株的病毒积累量,F6Del、ART、DEN、FINK、IQI、APS、1)198R.和D198K的CPmRNA相对积累量很少。这些结果与ELISA结果基本一致。与¨。ISA结果不同的是,突变体SQN接种植株的RNA积累量高于野生型病毒接种植株lIlIr|勺病毒积累量。结果表明,F6Del、ART、DEN、FINK、IQI、APS、D198R和D198K返j|.鬯突变是病毒不表现明显症状,同时病毒积累量及CPmRNA积累量也较低。三乏∞兰<白。囝.由。口.目。曰铟一目。曰。口。目.同。翌蚤葵犬吞童nod∞》Z呈≥磊穴匆o∞o吲g竣o~磊z<詈吾一∽幽3-19ELISA检测pTVBMV-GFP突变体接种植株中TVBMVCP的积累盈譬.3·19l:l。ISAanalysisTVBMVCPaccumulationintheⅣbenthamianaleavessystemicallyinfectedwithpCaTVBMV-GH’mutantsatIIdayspost-inoculation.77口oEN口一。一口>刃叫白孓。ol(3525150210ouc∞口.10∽D、,c01.Qo 烟草脉带花叶病毒和马铃薯A病毒HC.Pro调控RNA沉默抑制、协生和致病力的机制.爹≮爹衬≮蹴附一霉霉图3—20pTVBMV-GFP及其突变体接种后lI灭辅毒相对积累量Fig.3-20RelativevirusaccumulationintheⅣbenthamianaleavessystemicallyint'ectcdwithp.I’VBMV·GFI’IllUttllltSatldays"post-inoculation.3.6PVAHC—Pro参与抑制Pd",TA沉默的氨基酸位点3.6.I荧光观察浸润48h后,单独浸润含pAGFP农杆菌本氏烟叶片能够观察到微弱绿色荧光。之后荧光强度减弱,浸润后96h时,单独浸润pAGFP的叶片观察不到明显的荧光;川含pAGFP和pAhpGFP,以及用含pAGFP、pAhpGFP和pAGUS的农杆菌共浸润的本氏删叶片中一直没有出现绿色荧光:用含pAGFP、pAhpGFP和pAHC的农杆菌共浸润的本氏烟叶片有明显的绿色荧光。其中F6Del、N11Del和1249DG250E与野生型HC(pAHC)相比,N11Del抑制RNA沉默的活性降低,F6Del的抑制活性进一步降低(图3—21)。共浸润后第6天,pAtIC抑制RNA沉默的活性基本不变,而F6Del和N11Del抑制RNA沉默的活性丌始减弱(1刽3—21)。这说明HC—Pro的F6和N¨对于抑制RNA沉默不是必需的,但这两个氨五g酸的缺失可以降低其抑制活性。用含1249DG250E农杆菌共浸润的叶片与阴性对照叶片柑似,一直没有观察到荧光,说明IGN位点的突变使HC.Pro抑制RNA沉默的活性完全丧失。8642●8642Ol1l0O蜀。墨BI暑昌=uuq∞nJ一>∞AI苌Ia筐 山东农业大学博二l:学位论文幽3-2I含PVAHC—Pro三个突变体抑制RNA沉默活性Fig.3-2lActivitiesofPVAHC—ProandthreemutantsonRNAsilencingsuppression≥e他15个突变体与野生型HC(pAHC)相比可以分为三个类型:I、II、III。I型突变体丧失抑制RNA沉默活性,截至到注射后第10天未出现荧光,这类突变体有:l124Del、C54Del、C54A、N167A、R181AKl83A、CCC.AAA、D197K和D197A,前文-lJ1249DG250E突变体也是属于此类;II型突变体浸润的叶片与野生型pAHC浸润的叶片的荧光强度一致,包括K51A、N251R和K311A,即这些位点的突变没有影响HC.Prol,!至器舌吞里吕竺=奚9刃>釜萎^善=嘞一一耋:口o∞》勺图3.24PVAHC.Pro突变体相对抑制RNA沉默活性Fig.3-24RelativesuppressionactivityofthePVAHC-Promutants3.6.4共浸润区域Northem杂交分析F6Del、N11Del和1249DG250E三个突变体注射后第6d取注射叶片区域提取总RNA和siRNA,利用(a)2p)dCTP.标记GFP探针Northernblotting检测GFPmRNA和siRNA的积累量。结果显示:用pAHCwt共浸润的本氏烟叶片中检测到了大量的GFI'mRNA;在用F6Del或N11Del共浸润的本氏烟叶片中能检测到少量的GFPmRNA;刖pAGUS和1249DG250E共浸润的本氏烟叶片和阴性对照均没有检测到GFPmRNA(图3.25)。在共浸润的本氏烟叶片中均能检测到GFPsiRNA的积累,但是积累量有所彳i同,用pAHCwt共浸润的本氏烟叶片中GFPsiRNA积累量最少,用含N11Del和F6Dcl农杆菌共浸润的本氏烟叶片中GFPsiRNA积累量相对较多,而用含pAGUS和1249DG250E农杆菌浸润的本氏烟叶片中GFPsiRNA量最多(图3-25)。mRNAsiRNA’:o叁:-/矿穸舀芦。式尹矿鼬≯霉羹鼍▲【=3=]f=Z=:==:=]k工J量工..J图3-25Northernblotting分析PVAHC—Pro3个突变体浸润本氏烟中GFPmRNA和siRNA的积累鞋Fig.3-25AccumulationofGFPmRNAandsiRNAinⅣ.benthamianaleaves6daysafteragroinfiltrationwithth嗽PVAHC.Promutants.:一誊罄口一口q王一一§%gD1田J7吒一『口一∞q本T±。一;舞q#《Ⅲ『生叠■■■—■叠墨矗.Nl昏q≯一r扩nu‘4De一+pnuA》目量K5一>壬玉鹫;H2A口。一一¨.oC∽工■甜mo珊谴埘Mmq酣;H{_;,r!■^鞋瞎譬■—■■■—■量■—l置IA墨u《Jo∞墼岛(I蛊∞。麒;Ia篮 山东农业大学媲士学位论文从其它15个突变体中选取9个突变体浸润的本氏烟进行Northemblotting杂交分析,分析注射后第5天和第7天的浸润叶片中的GFPmRNA和注射后第5天的siRNAft;J杉{祟量。结果表I:!J],其中N167A、C54A、H24Del和Rl81A183A共浸润的本氏烟叶”与pAGUS共浸润的叶片中没有检测到GFPmRNA的表达,N25lR和K311A共浸涧的本氏烟叶片在浸润后第5天检测到GFP的mRNA的积累量高于野生型HCwt浸润的叶J扎而到第7天时,GFPmRNA的积累量的降低幅度都比较大,低于野生型HCwt没润的叶片中GFPmRNA的积累量;突变体1316KG317E和D197F浸润后第5天和第7入GFPmRNA的积累量都低于野生型HCwt浸润的叶片中GFPmRNA的积累量,这螳结果都与荧光定量PCR的结果一致。但是D198A共浸润的叶片在浸润后第3天能够GFPmRNA的存在,而第7天检测时则没有明显的条带存在(图3.26),说明D197A’·q-能其有微弱的抑制RNA沉默活性,但是接种后期D197A这种活性不明显。5dpi7dpi萝歹≯,芦萝梦妒歹◇穸梦芦歹哪囊1鬻I-.--_·-▲。....。..●L。...一-.....▲一·●--......▲.一。Jl-.....—√●‘-—.—..—.Jl-.....-.J●L.._..-..●L-........|--....,..▲....--_|5dpi7dpi穸穸$芦爹∥梦∥f梦Fig.3-26AccumulationofoFPmRNAinⅣ.benthamianaleavea5and7daysafteragroinfiltrationwithnine突变体浸润的本氏烟叶片中均能检测到GFPsiRNA的存在,结果表明:用pAHCwtj弋浸润的本氏烟叶片中GFPsiRNA积累量最少,.N167A、C54A、R181AKl83A、1316KG317E和D197A浸润的叶片中GFPsiRNA的积累量都较高,与pAGUS浸润的⋯‘片·IIf内GFPsiRNA的积累量相同或者稍多;H24Del、N251R和K311A浸润的叶片中(】17psilhNA的积累量都低于野生型pAHCwt浸润的叶片;D197F浸润的叶片中GFPsiRNA的积累量多于pAHCwt而少于pAGUS浸润的叶片中GFPsiRNA积累量(闺83 烟草脉带花叶病毒和马铃薯A病毒HC.Pro涮控RNA沉默抑制、协生和致辅力的机制5dO穸矿f萨妒芦萨矿穸≯}∥f誉区蒌=整】[互J区:j琵翟盔嚣盈譬翟譬黝图3—27Northernblotting分析PVAHC—Pt’o9个突变体浸润本氏烟中GFPsiRNA积累量Fig.3-27AccumulationofGFPsiRNAinN.benthamianaleaves3and5daysafteragroinfiltrationwithninePVAHC-Promutants.3.7PVAHC.Pro参与协生作用的氨基酸位点将PVAHC—Pro克隆到PVX载体中,转化农杆菌后浸润本氏烟,从浸润后第2天开始观察症状,同携带TVBMVHC.Pro的嵌合载体PVXHC.T一样,嵌合载体都是从第7天开始表现症状,且初期症状同单独接种PVX的症状相似,接种后第9天,K51A、D197Y、D197H、D197F、K31lA、N251R和1316KG317E突变体侵染的之中刀:始出现坏死症状,新叶水浸状坏死,第15天植株坏死。剩余嵌合载体F6Del、N11Del、H24Dcl、R181AKl83A、1249DG250E、C54A、C54Del、N167A、D197A、D197K和CCC.AAA侵染的植株症状发展与PVX症状相似,不影响植株的正常生长(图略)。PVX及PVXHC—P浸润后第5、7、9、11和13天采集植株上部叶片,用PVXCP的多克隆抗体进行ELISA检测。出现坏死的植株样品只采集到第9天,并且在这些午lI[株中PVXCP的积累量一直是增加的,第9天达到最高值,并且ELISA第9天检测结果也说明。突变体D198K浸润的植株PVXCP的浓度一直增加,浸润后第15天PVXCP的浓度达到最高值。而其他不引起坏死的9个突变体接种后PVXCP的积累量会一赢增加,在接种后第9、11或者13天达到最高浓度,之后浓度下降。其中F6Del、H24Dcl、N167A、R181AKl83A、1249DG250E、C54A和D197A嵌合载体同单独接种PVX⋯样,PVXCP在接种后第11天达到最高值,CCC-AAA在接种后第9天PVXCP达到蜮高值,N11Del突变体则在接种后第13天达到浓度最高值。(图3.28A)。比较浸润后第9天PVXCP的积累量,结果表明,嵌合载体PVXHC和PVX中病毒积累量没有明显的区别,引起坏死的突变体K51A、D197Y、D197H、D197F、K311A、N251R和1316KG317F侵染的植株中的病毒积累量与野生型HCwt浸润的植株中病毒积累量相似,而其他突变体浸润植株中的PVXCP积累量明显较少(图3—28B)。 山东农业人学博士学位论文AR43.532.521.5l0.5O5dpi7dpi9dpi1dpi13dpi+CK+R18lAKl83A-+一D197K-x—D197Y一口一N6Del—PVX+1249DG250E十D197H-X—D197F-{强一NlIDeI+H24Del----6--C54A+HCwt争K3llA—电一1316KG317E+K5lA斗D197A十CCC.AAA十N167A9dpi±士I壬0■÷.。r‘:L●●●壬I王:‘‘:、、.隅::7.、.限.门.同.目.自.目.j}。艮;。f。‘J●●●,忑A晕欠L^》翌竺英磊譬N厶∞o¨L^o喇三一早U一口天oU一、J喇圈3.28ELISA榆测PVXHC.P及je突变体浸润的本氏烟中的PVXCP的积累盈Fig.3-28ELISAanalysisoftheCPaccumulationinⅣ.benthamianaleavesinfectedwithPVX.PVXHCwt-PandPVXHCmut-Pvector.uo薯矗口.Io∽o《錾t-oo45352515O32lO。o芒芒。口《!;o,00F6H)e—Z16q》吞一_≯o一心q叼口一心q《CCC-≯>≯}{n§o一峪q}{o一心ql(o一崞.7≯n认厶》 烟草脉带花叶病毒和马铃薯AjIji毒HC.Pro调控RNA沉默抑制、协生和致病力的机制4讨论’本研究通过定点突变分析明确了PVA和TVBMVHC.Pro调控RNA沉默抑制、协生和致病力的氨基酸,证明了HC.Pro抑制RNA沉默的能力与其调控协生和致病力的活性直接相关;同一个位点突变为不同的氨基酸会有不同的影响,相同突变征不|iiJn勺械毒中突变引起的影响也可能不同。Plisson等(2003)认为HC—Pro含有3个结构域:两端为富含Q一螺旋的结构域l和2,中间是主要由13一折叠片组成的铰合部。蛋白酶活性对应于C.末端155个氨玉g酸的结构域2;铰合部在功能上与基因组扩增、病毒移动、RNA沉默抑制、蚜虫传毒等棚关。本研究中的突变位点主要分布在结构域1和铰合部及N端富含半胱氨酸区域(图4.1)。蚕瞻墨b-鞠辫9SAID吲198受霎薹11)I}11鼍TWTTTTPlZnRNAbindingProteaseP3图4·ITVBMV(在上方标记)和PVAHC-Pro(在下方标记)氨拱阪替换或缺失的位霹Fig.4-IAminoacidsubstitutionsordeletionswithintheHC·ProsequenceofTVBMV(above)andPVA(under)4.1类似锌指结构对HC.Pro功能的影响马铃薯Y病毒属病毒HC—ProN端有几个保守的半胱氨酸和一个组氨酸,被认为.1lJ。能形成类似锌指结构域,参与核酸互作。Atreya和Pirone(1993)确定马铃薯Y病毒Jfj;病毒HC.ProN.端的保守区域HXCX27CX2C是类似锌指结构域的基序(图4.2),分别用丝氨酸(S)替代了半胱氨酸(C),其中组氨酸和前两个半胱氨酸的突变均影响了症状表达,对病毒来说是致死的,而最后一个C没有突变成功(Atreya等,1993)。Yambao等(2008)证明CIYVVHC.Pro位于类似锌指结构域中第一个半胱氨酸下游的T突变为I后使病毒的症状变轻。TVBMVHC—Pro序列中类似锌指结构域序列的第一个C为R,将R突变为C得到HEC突变体,其抑制RNA沉默活性增加,与PVX能够协生;TVBMVHC.Pro类似锌指结构域中最后一个C突变为I(突变体IQI)丧失了抑制RNA沉默而‘性,不能和PVX发生协生作用,突变体接种本氏烟后症状变轻,病毒积累量降低。蜕明类似锌指结构在调控RNA沉默抑制、协生和致病力的过程中起作用。PVAI,IC—Pro 山东农业人学博二L学位论文类锌指结构域特征序列中的组氨酸H缺失后(H24Del)丧失了抑制RNA沉默和协生作J『J,而该位点参与HC.Pro.互作二聚体的形成(Urcuqui-Inchima等,1999),推测二聚仆n勺形成对于抑制RNA沉默和协生也是必需的。.30q05060.PSBMVHDCVGGIT—PEECGILAAQILRVFYPCVRITCTKCP}IVHTCKPTYS—VSNCGEVAAIIAQALFPCH}CLTCGECPPVHcII:TSDLD—VKECGWAALVCQAIIPCGKITCLocSlⅣHECTIDFT—NEC.CGELAAAISQSIFPVK}:LSCEQc.rEVH£CTPGVS—VEpCGEVAAILTQALSPC6KITCKRCTVll、,‘HTCTSDLP-VEACGHVAALMCQSLFPCGKITCKRCZYlIVHVCIⅣDYN-NEECGEL^^TFCQ^LFPWKLSCOTCTul{VHTCYSGLD-VTECGEV^^LMCL^HFPCGKITCPDCI矾/Y0HTCV^GLp—VEDCGRV且^LM^HSILPCYKITCPTCPVYNHTCVAGLP-VEDCGRV^AIIITH3ZLPCYKITCPTCC1WVHTCTSDLN-VIC'CG3VM^LHTLALf.PCGRITCKECPVAtⅣCSS【I『3-VEECGSIAALII:0SLLPC6#ITCRACIV'BINHERF了4NVLDVV。cGEVAGIICQSLHPCCPITCIOC●幽4.2马铃薯Y病毒属病毒N端类似锌指结构域的比对“★”代表类似锌指结构域的特征序列;“▲”TVBMv和PVAHC.Pro的突变位点Fig.4-2Alignmentofthededucedaminoacidsequencesofthezincfinger-likemotif”★’’:Characteristicaminoacidsitesofzincfinger-likemotif;“▲”:MutantsitesinTVBMVandPVAHC.Pro4.2FRNK(X)12CDN基序对HC—Pro功能的影响比较马铃薯Y病毒属病毒可以发现HC—Pro中间区域的FRNK基序和位于其下游l2个氨基酸的CDN基序是高度保守的,因此认为FRNK(X)12CDN是HC.Pro中一个大的保守区域(图4.3)(Desbiez等,2010)。(1)FRNK基序对HC.Pro功能的影响TVBMVHC.Pro的FRNK突变为FINK,PVAHC.ProFRNK的R和K分别突变为人(R181AKl83A),都使HC.Pro世失了抑制RNA沉默及与PVX协生的活性,同时R到I19j盟降低了TVBMV的致病力和病毒积累水平。而ZYMVHC—Pro的FRNK突变为FINK或FRNA时,引起症状减轻,但不影响病毒积累量和HC.Pro的抑制RNA沉默的活性(Shiboleth等,2007)。TEV和TuMVHC.Pro的FRNK突变为FINK后丧失了抑制RNA沉默活性,同时也使病毒丧失了侵染寄主的能力(Shiboleth等,2007)。因此,d十下f门突变(如FRNK突变为FINK)对不同病毒的功能可能有不同的影响。(2)CI)N基序对HC.Pro功能的影响’I'VBMVCDN基序中D分别突变为K(正电,脂肪族)、R(正电,脂肪族)、H(小fn,杂环)、A(疏水,脂肪族)、F(疏水,芳香族)、Y(亲水,芳香族)和G(束水,J11i9tfi族)等7个氨基酸,其中D198突变为K影响了HC.Pro的RNA沉默抑87 烟草脉带花叶病毒和马铃薯A病毒HC.Pro调控RNA沉默抑制、协生和敏炳力的机制制及协生活性,降低了病毒的致病力:D198A抑制RNA沉默的活性下降,致病力降低,但不影响与PVX的协生;而其他几个突变的抑制RNA活性不降低,不影响协生作川,除D198R外致病力与野生型病毒基本一致。将PVAHC.ProCDN中D分别突变为K、Y、A、F和H共5个氨基酸,其中D197A和D197K同时丧失了抑制RNA沉默活fl-年H介导协生作用。ZYMVHC.ProCDN中D突变为Y后不引起明显的症状,病毒积累量降低40%.60%(Desbiez等,2010)。TVBMVD198突变为Y后侵染植株第8天症状不明显,到筇10天时表现与野生型相似的症状,说明TVBMVHC.Pro中D突变为Y延迟病害发生,但是不影响症状的轻重和病毒积累量。ZYMVHC—Pro的CDN突变为CGN不影响病琳症状,但系统侵染的速度加快;但相同突变降低了PVY的致病力,使能引起坏死的PVY株系不表现坏死症状(Choi等,2002:Hu等,2009)。TVBMVHC.ProCDN变为CGN后症状表现与野生型相同,也没有影响抑制RNA沉默活性和协生作用。D198Y和I)1981:的RNA沉默抑制活性增强,致病力与野生型病毒一致。这与Torres.Barcel6等的结果一致(Torres.Barcel6等,2010)。发现强抑制子的抑制RNA沉默活性与其结合siRNA的能力没有明显的关联,推测可能通过干扰siRNA3’.甲基化、者改变植物内源杉C默抑制子或干扰micro.RNA(miRNA)介导的mRNA的降解来起作用(’l'orrcs—Barccl6锋,2010;Kasschau等,2003)。本研究还发现,D突变为都带正电或者都不带电荷的不同氨基酸时,对HC.Pro功能的影响不同。推测TVBMVCDN基序可能位于HC—Pro的表面,氨基酸电荷或者结构的变化不影响HC.Pro结构的变化。CDN基序不是通过改变HC.Pro的结构起作用,而是由氨基酸之间的亲和性引起的。D突变为K或者A后降低了HC.Pro与其他因。f-I,Fj识别或者与RNA的结合,从而改变了HC.Pro的功能。Atreya等(1993)将KI,I’C。lIK分别突变同样是带J下电荷的H和R对HC—Pro的功能影响也不同,突变为H丧失'r蚜传,严重影响了症状表现和病毒的积累量,而突变为R与野生型病毒表现型一致。TEVCDN基序中的N突变为S时抑制RNA沉默活性升高,而不影响病毒的症状(Torres.Barcel6等,2008)。ClYVVHC—Pro第193位的D突变为Y降低了HC.Pro抑制RNA沉默的活性和病毒积累量。尽管D193在PVY属病毒中是不保守的,但是它j£有特殊的位置,位于FRNK保守基序下游9个氨基酸的位置,并与保守牲序I。×CDNQ[,I)的N端相邻,同时D193还在RNA结合域的N端,因此D193可能足通过影11刁返:心个保守基序以及RNA结合域来起作用(Desbiez等,2010;Yambao等,2008)。』i从插入 到I'RNK和CDN之间时不影响HC.Pro的抑制RNA沉默活性,说明虽然这两个基序在所仃fI,JlI铃辫Y瘸诲属病毒中都I'自J隔12个氨基酸,但是这种间隔位置具有弹性,也可能址因为FIuNK和CDN两个基序独立起作用(Varrelmann等,2007)。很多理论模型都将病原的致病力归结为病原在寄主体内复制和积累引起的(Brown等,2006;Chao等,1990;Levin,1996),病毒粒子的大量积累能够引起更严重的症状,但是本研究中没有发现病毒致病力与病毒积累量之间存在必然的关联,例如D198Y、I)1981:、D198G在第10天时症状与野生型相似,病毒积累量低于野生型病毒,高于症状减弱f内突变体。这与Carrasco等(2007)年的研究结果是一致的,他发现TEV中病礴的适应性与病毒的致病力之间没有关联(Carrasco等,2007)。Gal—On(2000)等证I!JJFINK突变为FRNK能使其在西葫芦上的症状减轻而病毒浓度没有明显变化。PPV中K107E或者S231G突变体都能使PPV的症状表现加重,而不影响病毒的积累量(Sfienz等,2001)。在其他研究中也有类似的结果,例如大麦条纹花叶病毒在经过系列的水平牟‘接后,致病力增加而病毒积累量并没有增加(Stewart等,2005),CMV的坏死株系剐”坏死株系引起症状尸矿重度不同,但是其病毒积累量没有明显区别(Escriu等,2000)。⋯此。·叮见病毒所致症状的轻重和其在植物体内浓度的高低并不呈J下相关。⋯.I⋯.I⋯.1⋯.1⋯.I⋯.I⋯.I180190200210PSB唧l(RTESI鸠∞IPlⅣNpTDNIEKGDLPPVNpTENIPSCSVSMVNHH^LT【IED丘LTEVNpTEt,IHPI·;HL。IⅥIVWPTENIPt小;SLNHHHLTGEE^L}-HFpN}:PNpTENIEKGgLll=三;FRNIⅣNRTDNIKKGc.ISFFRNF:LNpTDNIKKGDISF!FRNKLNRT【.sIOpNDLSHFRNKINRTC·NIKKGSLAUFPNEINRTDNIKKGsL^1FRNIⅣS^K^0IN,^LS^P^·=!YNLYLSSM^HVNMt=}LSSI(^LLNpSLSSK^HVNN^LSSK^HSNL^L图4.3马铃薯Y病毒属病毒FRNK(X)12CDN基序“▲”TVBMV和PVAHC.Pm的突变位点Fig.4-3ThelargemotifFRNK(X)12CDNinpotyvirus(inbox)“▲“:MutantsitesinTVBMVandPVAHC·Pro4.3糖基化作用对HC.Pro功能的影响栅撼化作用在动物病毒中研究比较多,被认为在病毒致病力及逃避免疫反应过程中越}R婴作川(yigerust等,2007)。蛋白修饰时在保守基序Asn—X—se以hr中的Asn上发小N.1inkcd糖苯化。在TVBMVHC.Pro中发现了三个可能的基序,即NRT、NPS和曲曲曲¨曲∞曲曲曲曲∞¨曲LSTYDASPLTp圳Ⅲ讲州ⅢⅢⅢHNH阿H^^且盖T^^ 烟草脉带花叶病毒和马铃薯A病毒IqC.Pro调控RNA沉默抑制、协生和致病力的机制NGS,分别将N突变为A,证明只有ART丧失了抑制RNA沉默活性和参与PVXf门队生作用。该突变还使病毒症状减轻,病毒积累量明显的降低,说明这个位点在并病谁的侵染和致病过程中起作用。根据LMVHC.Pro的2D结构分析,NRT位于AAl70.176区域,这个区域是暴露在外边,对胰蛋白酶敏感(Plisson等,2003)。同时这个位点也处于RNA结合域A中,其结构富含c【.螺旋(Urcuqui.Inchima等,2000),可能是NR'I’的特殊位置决定其具有关键的功能。PVAHC.Pro中相同位置的突变N167A也具有梢Ⅲ的功能,同时位于N端的可能糖基化位点突变体NIlDel抑制RNA沉默活‘H:降低,匙失了与PVX的协生作用,说明在PVAHC.Pro中可能是这两个糖基化位点协同作j玎。4.4基因组复制和移动相关位点对HC.Pro其他功能的影响IGN是马铃薯Y病毒属病毒HC—Pro的保守基序,很多病毒的HC—Pro中都存在两个,一个位于中间区域,一个位于HC—Pro的C端。HC.Pro中间区域的IGN被认为赴与病毒的复制以及长距离运输有关(Cronin等,1995)。本研究发现PVAI—IC.Pro·I,问区域的IGN突变后能影响抑制RNA沉默活性和协生作用,而C端的IGN突变为KI':N对HC.Pro的功能没有明显的影响,说明处于不同位置的IGN基序可能起的作用不M。将TVBMV中间区域的IGN分别突变为DEN和SQN。DEN突变体丧失了抑制I州A沉默活性和协生作用,影响了病毒症状表达和病毒的积累量。而突变为SQN则没有l刃上I!:变化。说明IGN基序中I和G氨基酸共同起作用,也不排除这种差异是氨基酸的电荷不同引起的。CCC与病毒基因组复制和移动相关的保守基序(Cronin等,1995)。李为民等(2001)等将CCC突变后,病毒丧失了与PVX的协生作用。本研究将PVAHC.Pro的CCC二I序突变为AAA,发现其同时丧失了病毒抑制RNA沉默活性和介导协生作用。4.5蚜传相关基序对HC—Pro其他功能的影响PTK和K(/R)ITC与病毒蚜传相关的基序,K(/R)ITC基序与蚜虫1:3针结合,PTK批序与病毒粒子结合有关(Atreya等,1993;Huet等,1994:Blanc等,1998:Goytia等,2006)。Yang等(2002)等证明位于PPVHC.Pro中间区域的PTK基序是HC.Pro介持协生所必需的,而KITC突变为EITC不影响协生作用。本研究中将TVBMVIIC—Pro与蚜传相关的RITC突变为EITC后抑制RNA沉默活性有轻微增加,不影响病毒与PVX的协生及病毒的致病力,PVAHC.Pro中KITC突变为AITC,HC—Pro的协生功能没有受到影响。而将PVAHC.Pro中KITC中C缺失或者突变为A使HC.Pro丧失抑制RNA90 山东农业火学博二I:学位论文‘沉默和协生作用,可能是由于突变导致HC.Pro自身互作的效率降低引起的(Urcuqui.Inchima等,1999)。TVBMVHC.ProPTK突变为PAK后抑制RNA沉默活·E|二增强,接种后15天症状与野生型一致,同时具有协生功能。PVAHC—Pro中中PTK·l,K突变为A后抑制RNA沉默活性降低,不影响其介导协生作用。这与以前的研究结粜4i同,可能是因为PTK在不同的病毒中功能不同导致的。4.6第6位氨基酸F缺失对HC.Pro功能的影响’I'VBMVHC.Pro中第6位保守氨基酸F缺失同时丧失了抑制RNA沉默和协生作用,突变病毒在本氏烟上的致病力显著下降:相同突变导致PVAHC.Pro抑制RNA沉默活悱是降低,丧失了协生作用。以前未见关于这个位点功能的报道。研究病毒基因功能主要有4种方法。(1)构建嵌合体病毒。利用合适的酶切位点将两种病毒(或分离物)的部分序列互换,构建成重组杂合体病毒,通过分析杂合体病·:t的农现型研究病毒基因的功能(Atreya等,1990)。此方法的不足之处是可用的酶切化点少,而且利用这个方法不能明确是哪个氨基酸在起作用(Seo等,2010a)。(2)插入扫{ilfi突变。在病毒基因组内插入几个不影响阅读框架的核苷酸(in.frameinsertion)肝脱察突变体的表现型,或者是用转座子插入的方式研究病毒基因组或蛋白的功能(Varrelman等,2007)。该方法中多肽的插入具有随机性,而且不能证明具有弹性的两个功能域的作用。(3)丙氨酸扫描。在带电残基上引入丙氨酸,观察这些改变对蛋白功能的影l咖(Kasschau等,1997)。这是应用较多的一种方法。但同一个位点突变为不同f门氨』^睃引起的变化可能不同。本研究中TVBMVHC.ProCDN中D突变为K影响了IIC.Pro介导协生的能力,而突变为A不影响HC.Pro介导协生作用。(4)定点突变。山支常川的方法是将突变位点设计在引物上,通过PCR将突变引入到基因序列(Sfienz等,200l;Gonzalez.Jara等,2005;Shiboleth等,2007)。很难对整个基因序列都进行jtti突变。本研究选择了病毒的致病因子HC.Pro,通过序列比对找到马铃薯Y病毒屈躺一射I一·都保。、)。的氨丛酸位点,然后通过定点突变分析,明确了这些位点在调控RNA沉默抑制、协生和致病力等过程中的作用,为进一步获得含有多个位点突变、与其他病毒4i能队_i的弱毒突变体奠定了基础。9l 烟草脉带花叶病毒和马铃薯A病毒HC.Pro调控RNA沉默抑制、协生和敛病力的JOI:U05结论本研究利用定点突变的方法,明确了TVBMV和PVAHC.Pro参与抑制RNA沉默、介导协生作用和致病力的氨基酸位点,比较了HC.Pro这三种功能之faJ的关系。欹褂f门主要结论如下:(1)构建了基于pCAMBIA载体的RNA沉默分析体系。(2)分析了TVBMVHC—Pro18个突变体的抑制RIgA沉默活性,首次证明TVl3MV中N端保守氨基酸F6、类似锌指结构域、蛋白糖基化及FRNK(X),2CDN基序的突变都能影响HC.Pro的抑制RNA活性。(3)分析了HC—Pro抑制RNA沉默活性与介导协生作用问的关系,发现具有较姒抑制RNA沉默活性的突变体都能介导协生作用,而丧失抑制RNA沉默活性的突变都同时丧失了协生作用。(4)利用TVBMV侵染性克隆,分析了HC.Pro17个突变对TVBMV致病力的影响。发现抑制RNA沉默活性丧失的HC.Pro突变体都能导致病毒致病力的下降,说I!jJHC.Pro抑制RNA沉默与致病力之间存在相关性。(5)分析了PVAHC.Pro18个突变体抑制RNA沉默和调控协生的能力,发现9个突变体同时丧失了抑制RNA沉默活性和协生作用。92 山东农业火学博二匕学位论文参考文献’”‘彬晓峰,周雪平.RNA沉默的病毒抑制子.生物化学与生物物理进展,2005,32(3):210—216.}=|《健,周雪平.ICTV第八次报告的最新植物病毒分类系统.植物病理学报,2005,35(6)(ZK):1-9.兰砥菲,刘金亮,高瑞,王红艳,朱天生,竺晓平,李向东.烟草脉带花叶病毒CP基因的原核表达及抗血清制备.植物病理学报,2007,37:461.466.兰:li菲.两种抗病毒策略介导的转基因研究和烟草脉带花叶病毒蛋白的表达.山东农业大学博士学位论文,2009.李为民,鲁瑞芳,郭明,陈毓荃,彭学贤.马铃薯Y病毒蚜传辅助因子促进马铃薯X病毒长距离运输(英文).植物学报,2001,43(9):935-940.乍⋯东,范在丰,李怀方,裘维蕃.麦二叉蚜传播玉米矮花叶病毒的机制.植物保护学报,2002,29(1):62—66.夺阳东,李怀方,范在丰,裘维蕃.玉米矮花叶病毒HC.Pro在蚜虫传毒过程中的作用机制.植物病理学报,2000,30(3):217.221.令向东,于晓庆,古勤生,刘金亮,竺晓平,郭兴启.马铃薯Y病毒属病毒基因功能研究进展.山东科学,2006,19(3):1.6.刘氽亮.‘四种马铃薯Y病毒属病毒的分子变异及HC.Pro结构对抑制RNA沉默的影响.IIl东农业大学博士毕业论文,2007.仰瑞芳,李为民,王海云,郭明,彭学贤.马铃薯Y病毒HC.Pro中心区域在病毒协生作用中的主导地位.生物工程学报,2001,17(3):264—268.于晓庆.马铃薯X病毒和烟草脉带花叶病毒的分子变异及协生作用.山东农业大学博士学位论文,2008.张仲凯,李毅.云南植物病毒.北京:科学出版社,2001.米贤-阴,王彦亭.中国烟草病害.中国农业出版社,2001.AnandalakshmiR.,MaratheR.,GeX.,HerrJ.M.,Jr.,MauC.,MalloryA.,PrussG.,BowmanI。VanceV.B.Acalmodulin—relatedproteinthatsuppressesposttranscriptionalgenesilencinginplants.Science,2000,290(5489):142—144.AnandalakshmiR.,PrussG.J.,GeX.,MaratheR.,MalloryA.C.,SmithT.H.,VanceV.B.Aviralsuppressorofgenesilencinginplants.ProcNatlAcadSciUSA,1998,95(22):13079一l3084.Andct‘senK.。JohansenI.E.Asingleconservedaminoacidinthecoatproteingeneofpeaseed—bornemosaicpotyvirusmodulatestheabilityofthevirustomovesystemicallyinChenopodiumquinoa.Virology,1998,241(2):304—311.AndrcjcvaJ.,PuurandU.,MeritsA.,RabensteinF.,JarvekulgL.,ValkonenJ.P.Potyvirushclpercomponent-proteinaseandcoatprotein(CP)havecoordinatedfunctionsin93 烟草脉带仡叶病毒和马铃薯A病毒HC.Pm调控RNA沉默抑制、协生和数炳力的机制virus-hostinteractionsandthesanleCPmotifaffectsvirustransmissionandaccumulation.JGenVirol,1999,80(Pt5):1133-1139.AtreyaC.D.,AtreyaP.L.,ThomburyD.W.,PironeT.P.Site.directedmutationsinthepotyvirusHC-Progeneaffecthelpercomponentactivity,virusaccumulation,andsymptomexpressionininfectedtobaccoplants.Virology,1992,191(1):106-111.AtreyaC.D.,PironeT.P.Mutationalanalysisofthehelpercomponent-protcinascgeneol’apotyvirus:effectsofaminoacidsubstitutions,deletions,andgenereplacementonvirulenceandaphidtransmissibility.ProcNatlAcadSciUSA,1993。90(24):11919-11923.AtreyaC.D.,RaccahB.,PironeT.P.Apointmutationinthecoatproteinabolishesaphidtransmissibilityofapotyvirus.Virology,1990,178(I):161—165.AtreyaP.L.,Lopez-MoyaJ.J.,ChuM.,AtreyaC.D.,PironeT.P.MutationalanalysisofthecoatproteinN-terminalaminoacidsinvolvedinpotyvirustransmissionbyaphids.。}GenVirol,1995,76(Pt2):265—270.BallutL.,DruckerM.,PugniereM.,CambonF.,BlancS.,RoquetF.,CandresseT.,SchmidH.P.,NicolasP.,GallO.L.,BadaouiS.HcPro,amultifunctionalproteinencodedbyaplantRNAvirus,targetsthe20Sproteasomeandaffectsitsenzymicactivities.JGenVirol,2005,86(Pt9):2595-2603.BlancS.,AmmarE.D.,Garcia.LampasonaS.,DoraV.V.,LlaveC.,BakerJ..Pironc’rI’.Mutationsinthepotyvirushelpercomponentprotein:effectsoninteractionswithvirionsandaphidstylets.JGenVirol,1998,79(Pt12):3119.3122.BlancS.,Lopez—MoyaJ.J.,WangR.,Garcia—LampasonaS.,ThornburyD.W.,Pirone,I’.P.Aspecificinteractionbetweencoatproteinandhelpercomponentcorrelateswithaphidtransmissionofapotyvirus.Virology,1997,231(1):141—147.Bouch6N.,LauresserguesD.,GasciolliV.,VaucheretH.AnantagonisticfunctionforArabidopsisDCL2indevelopmentandanewfunctionforDCL4ingeneratingviralsiRNAs.EMBOZ2006,25(14):3347-3356.BrownN.F.,WickhamM.E.,CoombesB.K.,FinlayB.B.Crossingtheline:scicctionandevolutionofvirulencetraits.PLoSPathog,2006,2(5):0346—0353.BustinS.A.,BenesV.,GarsonJ.A.,HellemansJ.,HuggerJ.,KubistaM.,MuellerR.,NolanT.,PfaffiM.W.,ShipleyG.L.,VandesompeleJ.,WittwerC.T.TheMIQEguidelines:minimuminformationforpublicationofquantitativereal—timePCRexperiments.ClinChem,2009,55(4):6l1—622.‘CantoY.,L6pez—MoyaJ.J.,Serra-YoldiM.T.,Diaz—RuizJ.R.,L6pez—AbellaD.DiffcrcnthelpercomponentmutationassociatedwithlackofaphidtransmissibilityintwoisolatesofPatatovirusY.Phytopathology。1995,85:1519—1524.CarrascoP.,DarbsJ.A.,Agudelo—RomeroP.,ElenaS.F.Areal.timeRT.PCRassayforquantifyingthefitnessoftobaccoetchvirusincompetitionexperiments.JVirolMethods,2007,139(2):18卜188.‘ CarringtonJ.C.,JensenP.E.,SchaadM.C.GeneticevidenceforanessentialroleforpotyvirusCIproteinincell—to—cellmovement.PlantJ,1998,14(4):393—400.(:arringtonJ.C.,KasschauK.D.,MahajanS.K.,SchaadM.C.Cell—to—Cellandlong-distancetransportot’viruscsinplants.PlantCell,1996,8(10):1669-1681.ChakrabortyS.,VanitharaniR.,ChattopadhyayB.,FauquetC.M.SupervirulentpseudorecombinationandasymmetricsynergismbetweengenomiccomponentsoftwodistinctspeciesofbegomovirusassociatedwithseveretomatoleafcurldiseaseinIndia.JGenVirol,2008,89(Pt3):818—828.ChaoL.FitnessofRNAvirusdecreasedbyMuller’Sratchet.Nature,1990,348(6300):454-455.ChapnaanE.J.,CarringtonJ.C.SpecializationandevolutionofendogenoussmallRNApathways.NatRevGenet,2007,8(11):884—896.ChapmanE.J.,ProkhnevskyA.I.,GopinathK.,DoljaV.V.,CarringtonJ.C.ViralRNAsilencingsuppressorsinhibitthemicroRNApathwayatanintermediatestep.GenesDev,2004,18(10):1179—1186.二.ChatzivassiliouE。K.,MoschosE.,GaziS.,KoutretsisP.,TsoukakiM.InfectionofpotatocropsandseedswithPotatovirusYandPotatoleafrollvirusinGreece.dPlantPathol,2008,90(2):253—261.ClaiangC.一II.,I.eeC.Y.,WangC.一H.,JanF.J.,analysisofanattenuatedPapayaringspotPlantPatho,2007,118(4):333-348.LinS.S.,ChenT.C.,RajaJ.,YehS.D.Geneticvirusstrainappliedforcross—protection.EurdChiuM.H.,ChenI.H.,BaulcombeD.C.,TsaiC.H.ThesilencingsuppressorP25ofPotatovirusXinteractswithArgonautelandmediatesitsdegradationthroughtheproteasomepathway.MolPlantPathol,2010,11(5):641—649.ChoiS.K.,YoonJ.Y.,RyuK.H.,ChoiJ.K.FirstreportofZucchiniyellowmosaicvirusonhollyhock∽lthaearosea).PlantPathol以2002,18:121-125.(?hung13.Y.,MillerW.A.,AtkinsJ.F.,FirthA.E.AnoverlappingessentialgeneinthePotyviridae.ProcNatlAcadSciUSA,2008,105(15):5897—5902.CitovskyV.,ZambryskiP.SystemictransportofRNAinplants.TrendsPlantSci,2000,5(2):52-54.CroninS.,VerchotJ.,Haldeman—CahillR.,SchaadM.C.,CarringtonJ.C.Long-distancemovementfactor:atransportfunctionofthepotyvirushelpercomponentproteinase.PlantCell,1995,7(5):549-559.CucllarW.J.,TairoF.,KreuzeJ.F.,ValkonenJ.P.AnalysisofgenecontentinsweetpotatochloroticstuntvirusR.NA1revealsthepresenceofthep22RNAsilencingsuppressorinonlyafewisolates:implicationsforviralevolutionandsynergism.dGenVirol,2008,89(1)t2):573-582.1)apalmaT.,DoonanB.P.,TragerN.M.,KasmanL.M.Asystematicapproachtovirus-virus95 interactions.VirusRes,2010,149(1):1—9.DelerisA.,Gallego-BartolomeJ.,BaoJ.,KasschauK.D.,CarringtonJ.C.,VoinnetO.HierarchicalactionandinhibitionofplantDicer-likeproteinsinantiviraldefense.Science,2006,313(5783):68—71.DeomC.M.,LapidotM.,BeachyR.N.Plantvirusmovementproteins.Cell,1992,69(2):221-224.DesbiezC.,GirardM.,LecoqH.AnovelnaturalmutationinHC.ProresponsiblelbrmildsymptomatologyofZucchiniyellowmosaicvirus(ZYMV,Potyvirus)incucurbits.At·chVirol,2010,155(3):397—401.DielenA.S.,SassakiF.T.,WalterJ.,MichonT.,MenardG.,PagnyG.,Krause.SakateR.,MaiaIdeG.,BadaouiS.,LeGallO.,CandresseT.,German.RetanaS.The20Sproteasomealpha5subunitofArabidopsisthalianacarriesanRNaseactivityandinteractsinplantawiththelettucemosaicpotyvirusHcProprotein.MolPlantPathol,2011,12(2):137—150.DoUaV.V.,HerndonK.L.,PironeT.P.,CarringtonJ.C.Spontaneousmutagcncsisol’aplantpotyvirusgenomeafterinsertionofaforeigngene.JVirol,1993,67(10):5968.5975.DombrovskyA.,HuetH.,ChejanovskyN.,RaccahB.AphidtransmissionofapotyvirusdependsonsuitabilityofthehelpercomponentandtheNterminusofthecoatprotein.ArchlOrol,2005,150(2):287—298.DugasD.V.,BartelB.MicroRNAregulationofgeneexpressioninplants.Curr@inPlantBiol,2004,7(5):512-520.DunoyerP.,LecellierC.H.,ParizottoE.A.,HimberC.,VoinnetO.ProbingthemicroRNAandsmallinterferingRNApathwayswithvirus-encodedsuppressorsofRNAsilencing.PlantCell,2004,16(5):1235-1250.’EbhardtH.A.,ThiE.P.,WangM.B.,UnrauP.J.Extensive3’modificationofplantsmallRNAsismodulatedbyhelpercomponent-proteinaseexpression.ProcNatlAcadSciUSA,2005,102(38):13398—13403.EggenbergerA.L.,HajimoradM.R.,HillJ.H.GainofvirulenceonRsvI.genotypesoybcanbyanavirulentSoybeanmosaicvirusrequiresconcurrentmutationsinbothP3andHC·Pro.MolPlant—MicrobeInteract,2008,21(7):931.936.EscfiuF.,FraileA.,Garcia—ArenalF.Evolutionofvirulenceinnaturalpopulationsol’thcsatelliteRNAofCucumbermosaicvirus.Phytopathology,2000,90(5):480·485.FiasinskiS.,CassidyB.G.Potyvirusaphidtransmissionrequireshelpercomponentandhomologouscoatproteinformaximalefficiency.ArchVirol,1998,143(11):2159.2172.FroissartR.,DoumayrouJ.,VuillaumeF.,AlizonS.,MichalakisY.Thcvirulence·transmissiontrade-offinvector-borneplantviruses:areviewof(non一)existingstudies.PhilosTransRSocLondBBiolSci,2010,365(1548):1907—1918.FroissartR.,MichalakisY.,BlancS.Helpercomponent.transcomplementationinthevector 山东农业人学博?I:学位论文.transmissionofplantviruse.Phytopathology,2002,576·579.FukuzawaN.,ItchodaN.,IshiharaT.,GotoK.,MasutaC.,MatsumuraT.HC-Pro,apotyvirusRNAsilencingsuppressor,cancelscyclingofCucumbermosaicvirusinNicotianabenthamianaplants.VirusGenes,2010,40(3):440—446.Gal—On人.ApointmutationintheFRNKmotifofthepotyvimshlpercomponent-proteasegenealterssymptomexpressionincucurbitsandelicitsprotectionagainsttheseverehomologousvirus.Phytopathology,2000,90(5):467-473.Gal.OnA.,AntignusY.,RosnerA.,RaccahB.Azucchiniyellowmosaicviruscoatproteingenemutationrestoresaphidtransmissibilitybuthasnoeffectonmultiplication.JGenVirol,1992,73(Pt9):2183—2187.Garcia.CanoE.,ResendeR.0.,Femhndez—MufiozR.,MorionesE.SynergisticinteractionbetweenlbmatochlorosisvirusandTomatospottedwiltvirusresultsinbreakdownofresistanceintomato.尸hytopathology,2006,96(I1):1263-1269.German.RetanaS.,CandresseT.,AliasE.,DelbosR.P.,LeGallO.Effectsofgreenflvorescentproteinorbeta-glucuronidasetaggingontheaccumulationandpathogenicityot’aresistance—breakingLettucemosaicvirusisolateinsusceptibleandresistantlettucecultivars.MolPlant—MicrobeInteracl,2000,13(3):316—324..GoldbergK.B.,BrakkeM.K.Concentrationofmaizechloroticmottlevirusincreasedin⋯-mixedinfectionswithMaizeawarfmosaicvirusstrainB.Phytopathology,1987,77:162.167.Gonz£ilez.JaraP.,AtencioF.A.,Martinez—GarciaB.,BarajasD.,TenlladoF.,Diaz-RuizJ.R.人SingleaminoacidmutationinthePlumpoxvirushelpercomponent。proteinasegeneabolishesbothsynergisticandRNAsilencingsuppressionactivities.Phytopathology,2005,95(8):894-901.(ionzSlcz.JaraP.,TcnlladoF.,Martinez.GarciaB.,AtencioF.A.,BarajasD.,VargasM.,1)iaz—RuizJ.,Diaz.RuizJ.R.Host.dependentdifferencesduringsynergisticinfectionbyPotyviruseswithpotatovirusX.MolPlantPathol,2004,5(1):29·35.GovicrD.A..KassanisB.EvidencethatacomponentotherthanthevirusparticleiSneededforaphidtransmissionofpotatovirusY.Virology,1974,57(1):285—286.GoytiaE..Fernandez.CalvinoL.,Martinez.GarciaB.,Lopez.AbellaD.,Lopez—MoyaJ.J.1)roductionofplumpoxvirusHC.Profunctionallyactiveforaphidtransmissioninatransient.expressionsystem.JGenVirol,2006,87(Pt11):34l3·3423.GranierF..Durand—TardifM.,Casse—DelbartF.,LecoqH.,RobagliaC.MutationsinzucchiniyellowmosaicvirushelpercomponentproteinassociatedwithlOSSofaphidtransmissibility.JGenVirol,1993,74(Ptl2):2737—2742.(]ttoI).,RajamakiM.L.,SaarmaM.,ValkonenJ.P.Towardsaproteininteractionmapofpotyviruses:proteininteractionmatrixesoftwopotyvirusesbasedontheyeasttwo.hybridsystem.JGenVirol,2001,82(Pt4):935-939.97 .HamiltonA.,VoinnetO.,ChappellL.,BaulcombeD.TwoclassesofshortinterferingRNAinRNAsilencing.EMBOZ2002,2I(I7):4671—4679.HeckmanK.L.,PeaseL.R.GenesplicingNatProtoc,2007,2(4):924-932.andmutagenesisbyPCR—drivenoverlapextension.HuX.,MeachamT.,EwingL.,GrayS.M.,KarasevA.V.AnovelrecombinantstrainofPotatovirtlSYsuggestsanewviralgeneticdeterminantofveinnecrosisintobacco.VirusRes,2009,143(I):68—76.HuetH.,Gal—OnA.,MeirE.,LecoqH.,RaccahB.Mutationsinthehelpercomponentproteasegeneofzucchiniyellowmosaicvirusaffectitsabilitytomediateaphidtransmissibility.JGenVirol,1994,75(Pt6):1407—1414.KareemK.T.,TaiwoM.A.Interactionsofparameters.VirolZ2007,4:15.virusesinCowpea:effectsongrowthandyicldKaryeijaR.F.,KreuzeJ.F.,GibsonR.W.,ValkonenJ.P.Synergisticinteractionsofapotyvirusandaphloem—limitedcrinivirusinsweetpotatoplants.Virology,2000,269(I):26-36.KassanisB.,GovierD.A.NewevidenceonthemechanismofaphidtransmissionofpotatoCandpotatoaucubamosaicviruses.dGenVirol,1971a,10(I):99一101.KassanisB.,GovierD.A.TheroleofthehelpervirusinaphidtransmissionofPotatoAucubamosaicvirusandPotatovirusC.JGenVirol,1971b,13(2):221·228.KasschauK.D.,CarringtonJ.C.RequirementforHC-ProprocessingduringgcnomcamplificationofTobaccoEtchpotyvirus.Virology,1995,209(1):268·273.KasschauK.D.,CroninS.,CarringtonJ.C.Genomeamplificationandlong‘distancemovementfunctionsassociatedwiththecentraldomainoftobaccoetchpotyvirushcipcrcomponent-proteinase.Virology,1997,228(2):25l·262.KasschauK.D.,XieZ.,AllenE.,LlaveC.,ChapmanE.J.,KrizanK.A.,CarringtonJ.C.P1/HC.Pro,aviralsuppressorofRNAsilencing,interfereswithArabidopsisdevelopmentandmiRNAfunction.DevCell,2003,4(2):205·217.KleinP.G.,KleinR.R.,Rodriguez.CerezoE.,HuntA.G.,ShawJ.G.Mutationalanalysisol’thetobaccoveinmottlingvirusgenome.Virology,1994,204(2):759—769.LakatosL.,CsorbaT.,PantaleoV.,ChapmanE⋯JCarringtonJ.C.,LiuY.-P.,DoljaV.V.,CalvinoL.F.,Lopez—MoyaJ.J.,BurgyanJ.SmallRNAbindingisacommonstrategytosuppressRNAsilencingbyseveralviralsuppressors.EMBOJ,.2006,25(12):2768-2780.LazarowitzS.G.,BeachyR.N.Viralmovementproteins嬲probesforintracellularandintercellulartraffickinginplants.PlantCell,1999,11(4):535·548.LecoqH.ControlofplantvirusdiseasesbyKoganezawaH(eds),Plantvirusdisease33.40.crossprotection.In:HadidiA,KhctarpalRK.conr01.APSPress,St.Paul.MN,USA,1998.98 I-cVinIj.R·Theevolutionandmairitenanceofvirulenceinmicroparasites.EmerginglnfectDis,1996,2(2):93—102..I—inS.S.,WuH.W.,JanF.J.,HouR.F.,YehS.D.Modificationsofthehelpercomponent。proteaseofZucchiniyellowmosaicvirusforgenerationofattenuatedmutantsforcrossprotectionagainstsevereinfection.Phytopathology,2007,97(3):287.296.I—iuH.,NaismithJ.H.Anefficientone-stepmultiple—siteplasmidmutagenesisprotoc01.site_directeddeletion,insertion,singleandBMCBiotechnol,2008,8:91.I-ivakK.J.,SchmittgenT.D。Analysisofrelativegeneexpressiondatausingreal.timequantitativePCRandthe2-[Delta][Delta]CTmethod.Methods,2001,25(4):402.408.I-laveC·,KasschauK.D.,CarringtonJ.C.Virus—encodedsuppressorofposttranscriptionalgenesilencingtargetsamaintenancestepinthesilencingpathway.ProcNatlAcadSciUSA,2000,97(24):13401—13406.MaiaI.v.,GHaenniA.,BernardiF.PotyviralHC—Pro:amultifunctionalprotein.JGenVirol,1996,77(Pt7):1335—1341.Malik人.H.,MansoorS.,IramS.,BriddonR.W.,ZafarY.SeverediseaseofmeloninnonhwestfrontierprovinceisassociatedwithsimultaneousinfectionoftwoRNAviruses.P口k.Ibot,2010,42(1):361.367.MalloryA.C.,ElyL.,SmithT.H.,MaratheR.,AnandalakshmiR.,FagardM.,VaucheretH.,PrussG·,BowmanL.,VanceV.B.HC—ProsuppressionoftransgenesilencingeliminatesthesmallRNAsbutnottransgenemethylationorthemobilesignal.PlantCell,2001,13(3):571—583.●‘MalloryA.C.,MlotshwaS.,BowmanL.H.,sendasystemicRNAsilencingsignallocus.Plant以2003,35(1):82.92.VanceV.B.ThecapacityoftransgenictobaccotodependsonthenatureoftheinducingtransgeneMalloryA.C.,ReinhartB.J.,BartelD.,VanceV.B.,BowmanL.H.AviralsuppressorofRNAsilencingdifferentiallyregulatestheaccumulationofshortinterferingRNAsandmicro-IuNAsintobacco.ProcNatlAcadSciUSA,2002,99(23):15228.15233.ManoussopoulosI.N.AcquisitionandretentionofPotatovirusYhelpercomponentintransmissionofPotatoaucubamosaicvirusbyaphids.JPhytopathol,2001,(2):103—106.the149Mascia1’.'CilloF.,FanelliV.,Finetti.SialerM.M.,DeStradisA.,PalukaitisP..GallitelliD.CharacterizationoftheInteractionsbetweenCucumbermosaicvirusandPotato’,护淞yinmixedinfectionsintomato.MolPlant—MicrobeInteract,2010,23(11):1514.I524.Mdndcz-LozanoJ.,Torres—PachecoI.,FauquetC.M.,Rivera.BustamanteR.F.Interactionsbctweengemlnlvlrusesinanaturallyoccurringmixture:PepperhuastecovirusandPeppergoldenmosaicvirus。Phylopathology.2003。93(3):270.277.McraiZ.,KcrcnyiZ.,KerteszS..MagnabindingmaybeageneralplantRNAM.,LakatosL.,SilhavyD.Double.strandedRNAviralstrategytosuppressRNAsilencing.JViral, 2006,80(12):5747—5756.MlotshwaS.,PrussG.J.,PeragineA.,EndresM.W.,LiJ.,ChenX.,PoethigR.S.,BowmanL.H.,VanceV.DICER-LIKE2playsaprimaryroleintransitivesilencingoftransgcncsinArabidopsis.PLoSOne,2008,3(3):1755.MoissiardG.,VoinnetO.ViralsuppressionofRNAsilencinginplants.MolPlantPathol,2004,5(1):7l-82.。MorenoP,eta1.Citrustristezavirus:apathogenthatchangedthecourseofthecitrusindustry.MolPlantPathol,2008,9:251-268MukasaS.B.,RubaihayoP.R.,ValkonenJ.P.T.Interactionsbetweenacrinivirus,allipomovirusandapotyvirusincoinfectedsweetpotatoplants.PlantPathol,2006,55(3):458—467.MurphyJ.F.,BowenK.L.SynergisticdiseaseinpeppercausedbythemixedinfectionoI’CucumbermosaicvirusandPeppermottlevirus.Phytopathology,2006,96(3):240.247.Nakazono—NagaokaE.,SatoC.,KosakaY.,NatsuakiT.Evaluationofcross—ptotectionwithallattenuatedisolateofBeanyellowmosaicvirusbydifferentialdetectionofvirusisolatesusingRT-PCR.JGenPlantPthol,2004,70:359—362.一Nakazono—NagaokaE.,TakahashiT.,ShimizuT.,KosakaY.,NatsuakiT.,Omura~1..SasayaT.Cross-protectionagainstBeanyellowmosaicvf,.。岱(BYMV)andCloveryelhm,veinvirusbyaRenuatedBYMVisolateM11.尸hytopathology,2009,99(3):251-257.NiblettC.L.,ClaflinL.E.CornlethalnecrosisanewvirusdiseaseofcominKansas.PI“门,DisRep,1978,62:15.19.NiehlA.,HeinleinM.CellularpathwaysProtoplasma,2011,248(1):75—99.forviraltransportthroughplasmodesmata.OworB.,LeggJ.P.,Okao—OkujaG.,ObonyoR.,KyamanywaS..Ogenga.LatigoM.W.FieldsstudiesofcrossprotectionwithcassavamosaicgeminivirusesinUganda.。|‘Phytopathol,2004,152:243—249PallasV.,GarciaJ.A.Howdoplantvirusesinducedisease?Interactionsandinterferencewithhostcomponents.JGenVirol,2011,92(Pt12):2691—2705.PengY.H.,KadouryD.,Gal-OnA.,HuetH.,WangY.,RaccahB.MutationsintheHC.Progeneofzucchiniyellowmosaicpotyvirus:effectsonaphidtransmissionandbindingtopurifiedvirions.JGenVirol,1998,79(Pt4):897—904.PeragineA.,YoshikawaM.,WuG.,AlbrechtH.L.,PoethigR.S.SGS3andSGS2/SDEI/RDR6arerequiredforjuveniledevelopmentandtheproductionot。trans‘actingsiRNAsinArabidopsis.GenesDev,2004,18(19):2368—2379.PironeT.P.,BlancS.Helper—dependentPhytopathol,1996,34:227·247.vectortransmissionofplantviruses.AnnuRevPitaJ.S.,FondongV.N.,SangareA.,Otim-NapeG.W.,OgwalS.,FauquetC.M.1∞ Recombination,pseudorecombinationandsynergismofgeminivirusesaredeterminantkeystOtheepidemicofseverecassavamosaicdiseaseinUganda.JGenVirol,2001,82(Pt3):655—665.1)lissonC.,DruckerM.,BlancS.,German·RetanaS.,LeGallO.,ThomasD.,BronP.StructuralcharacterizationofHC.Pro,aplantvirusmultifunctionalprotein.JBiolChem,2003,278(26):23753—23761.PI'USSG.,GcX.,ShiX.M.,CarringtonJ.C.,BowmanVanceV.Plantviralsynergism:thepotyviralgenomeencodesabroad-rangepathogenicityenhancerthattransactivatesreplicationofheterologousviruses.PlantCell,1997,9(6):859—868·QuF.,MorrisT.J.SuppressorsofRNAsilencingencodedbyplantvirusesandtheirroleinviralinfections.FEBSLett,2005,579(26):5958-5964.QuJ.,YeJ.,FangR.ArtificialmicroRNA—mediatedvirusresistanceinplants.JVirol,2007,81(12):6690-6699.Rajam;ikiM.L..ValkonenJ.P.Viralgenome—linkedprotein(VPg)controlsaccumulationandphloem.10adingofapotyvirusininoculatedpotatoleaves.MolPlant·MicrobeInteract,2002,15(2):138·149.Rcntcria.Canett1..Xoconostle—CazaresB.,Ruiz.MedranoR.,Rivera—BustamanteR.F.Geminivirusmixedinfectiononpepperplants:synergisticinteractionbetweenPHYVVandPepGMV.VirolZ2011,8:104.R(,choWW⋯FRossA.F.VirusmultiplicationinplantsdoublyinfectedbypotatovirusesXandY.Virology,1955,1(1):10—27.R()iasM.R.,ZerbiniF.M.,AllisonR.F.,GilbertsonR.L.,LucasW.J.Capsidproteinandhelpercomponent.proteinasefunctionaspotyviruscell—to-cellmovementproteins·Virology,1997,237(2):283—295.Rosas.CardenasF.,F.,Durfin.FigueroaN.,Vielle—CalzadaJ.P.,Cruz。Hem£indezA·,Marsch—MartinezN.,deFolterS.AsimpleandefficientmethodforisolatingsmallRNAsfromdifferentplantspecies.PlantMethods,2011,7:4.Roth13.M.,PrussG.J.,VanceV.B.PlantviralsuppressorsofRNAsilencing.VirusRes,2004,102(1):97·108.RoLIdct.~1avertG.,German.RetanaS.,DelaunayT.,DelecolleB.,CandresseT.,LeGallO.Interactionbetweenpotyvirushelpercomponent—proteinaseandcapsidproteinininfectedplants.JGenVirol,2002,83(Pt7):1765—1770.SzienzP.,QuiotL.,QuiotJ.B.,CandresseT.,GarciaJ.A.PathogenicitydeterminantsinthecomplexviruspopulationofaPlumpoxvirusisolate.MolPlant-MicrobeInteract,2001,14(3):278-287.S矗cnzp.,SalvadorB.,Sim6n—MateoC.,KasschauK.D.,CarringtonJ.C.,GarciaJ.A.Ilost.specificinvolvementoftheHCproteininthelong—distancemovementofpotyviruses.JVirol,2002,76(4):1922-1931.10l 烟革脉带花叶病毒和马铃薯A病毒HC—Pro调控RNA沉默抑制、协生和致病力的机制SalvadorB.,DelgadilloM.O.,SaenzP.,GarciaJ.A.,Simon-MateoC.IdentificationofPlumpoxviruspathogenicitydeterminantsinherbaceousandwoodyhosts.MolPlant·MicrobeInteract,2008,21(1):20—29.SanoY.,KojimaM.IncreaseincucumbermosaicvirusconcentrationinJapaneseradishplantsCO-infectedwithturnipmosaicvirus.AnnPhytopatholSocJapan,1989,55(3):296—302.SavenkovE.I.,ValkonenJ.P.Potyviralhelper—componentproteinaseexpressedintransgenicplantsenhancestitersofPotatoleafrollvirusbutdoesnotalleviateitsphloemlimitation.Virology,2001,283(2):285—293.ScheetsK.Maizechloroticmottlemachlomovirusandwheatstreakmosaicrymovirusconcentrationsincreaseinthesynergisticdiseasecornlethalnecrosis.Firology,l998,242(1):28—38.SeoJ.-K.,KangS.H.,SeoB.Y.,JungJ.K.,KimK.一H.Mutationalanalysisofinteractionbetweencoatproteinandhelpercomponent—proteinaseofSoybeanmosaicvirusinvolvedinaphidtransmission.MolPlantPathol,2010a,11(2):265—276.SeoJ.K。,SohnS.H.,KimK.H.AsingleaminoacidchangeinHC—ProofsoybeanmosaicvirusalterssymptomexpressioninasoybeancultivarcarryingRsvlandRsv3.ArchFirol,2010b,156(1):135—141.SeronK.,HaenniA.L.Vascularmovementofplantviruses.MolPlant—MicrobeInteract,l996,9:436·442.ShiX.M.,MillerH.,VerchotJ.,CarringtonJ.C.,VanceV.B.Mutationsin!hcregionencodingthecentraldomainofhelpercomponent—proteinase(HC—Pro)eliminatepotatovirusX/potyviralsynergism.Virology,1997,231(1):35·42.ShibolethY.M.,HaronskyE.,LeibmanD.,AraziT。,WasseneggerM.,WhithamS.A.,GabaV.,Gal—OnA.TheconservedFRNKboxinHC-Pro,aplantviralsuppressorofgenesilencing,isrequiredforsmallRNAbindingandmediatessymptomdevelopment.JFit。ol,2007,81(23):13135—13148.SrinivasanR.,AlvarezJ.M.Effectofmixedviralinfections(potatovirusY—potatoleafrollvirus)onbiologyandpreferenceofvectorsMyzuspersicaeandMacrosiphumeuphorbiae(Hemiptera:Aphididae).JEconEntomol,2007,100(3):646-655.StengerD⋯CFrenchR..GildowF.E.CompletedeletionofWheatstreakmosaicvirusHC.Pro:anullmutantisviableforsystemicinfection.JVirol,2005,79(18):12077·12080.StengerD.C.,YoungB.A.,QuF.,MorrisT.J.,FreachR.Wheatstreakmosaicviruslackinghelpercomponent—proteinaseiscompetenttoproducediseasesynergismindoubleinfectionswithMaizechloroticmottlevirus.Phytopathology,2007,97(1O):1213—1221.StewartA.D.,LogsdonJ.M.,KelleyS.E.Anempiricalstudyoftheevolutionofvirulenceunderbothhorizontalandverticaltansmission.Evolution,2005,59(4):730—739.102 Sufrin.RingwaldT.,LapidotM.Characterizationofasynergisticinteractionbetweentwocucurbit.infectingbegomoviruses:SquashleafcurIvirusandWatermelonchloroticstuntvirus.Phytopathology,2011,10l(2):281·289.SyllerJ.Facilitativeandantagonisticinteractionsbetweenplantvirusesinmixedinfections·MolPlantPathol,2012,13(2):204—216.SyllcrJ.Therolesandmechanismsofhelpercomponentproteinsencodedbypotyvirusesandcaulimoviruses.PhysiolMolPlantPathol,2006,67:119-130.,I’akakiF.,SanoT.,YamashitaK.Thecompletenucleotidesequenceofattenuatedonionyellowdwarfvirus:anaturalpotyvirusdeletionmutantlackingtheN-terminal92aminoacidsofHC—Pro.ArchVirol,2006,151(7):1439-1445.’L'atincniS..GrayboschR.A.,HeinG.L.,WeguloS.N.,FrenchR.Wheatcultivar’specificdiscascsynergismandalterationofvirusaccumulationduringCO—infectionwithWheatJlreak研osaicvirusandTriticummos.aicvirus.Phytopathology,2010,100(3):230-238.7l'homburyD.W..PattersonC.A.,DessensJ.T.,PironeT.P.Comparativesequenceofthehelpercomponent(HC)regionofpotatovirusYandaHC—defectivestrain,potatovirusC·Virology,1990,178(2):573-578.。’l'orrcs.Barcel6C.,DarbsJ.A.,ElenaS.F.HC-Prohypo—andhypersuppressormutants:dil’fcrencesinviralsiRNAaccumulationinvivoandsiRNAbindingactivityinvitro.ArchVirol,2010,155(2):251—254.’I’o盯cs.Barcel6C.,MartinS.,Dar6sJ.A.,ElenaS.F.Fromhypo—tohypersuppression:effectofaminoacidsubstitutionsontheRNA.silencingsuppressoractivityoftheTobaccoetchpotyvirusHC.Pro.Genetics,2008,180(2):1039-1049.‘、TribodetM.,GlaisL.,KerlanC.,JacquotE.CharacterizationofPotatovirusY(PVY)molcculardeterminantsinvolvedintheveinnecrosissymptominducedbyPVY‘、isolatesininfectedNicotianatabacumCV.Xanthi.JGenVirol,2005,86(Pt7):2101—2105.【jnlivcrosM.,FucntesS.,SalazarL.F.SynergisticinteractionofSweetpotatochloroticstuntvirus(Crinivirus)withCarla一,Cucumo一,Ipomo一,andPotyvirusesinfectingsweetpotato·PlantDis,2007,91(6):669-676.Urcuqui.InchimaS.,HaermiA.L.,BemardiF.Potyvirusproteins:awealthoffunctions·VirusRes,2001,74(1—2):157-175.Urcuqui.InchimaS.,MaiaI.G.,ArrudaP.,HaenniA.L.,BemardiF.Deletionmappingofthepotyviralhelpercomponent—proteinaserevealstworegionsinvolvedinRNAbinding·Virology,2000,268(1):104-111.Urcuqui.1nchimaS.,WalterJ.,DrugeonG...,1German—RetanaS.,HaenniA.-L.,CandresseT·,ljcrnardiF.,LeGallO.Potyvirushelpercomponent—proteinaseself-interactionintheyeasttwo.hybridsystemanddelineationoftheinteractiondomaininvolved.Virology,i999,258(1):95—99.UyemotoJ.K.,FergusonM.W.Wheatstreakmosaicvirus:increasedyieldsofpurifiedvirus103 fromcorn.PlantDis,1980,64(5):460—462.ValkonenJ.P.T.AccumulationofpotatovirusYisenhancedinSolatiumbrevidensaIsoinfectedwithtobaccomosaicvirusorpotatospindletuberviroid.AnnApplBiol,】992,121(2):321-327.ValliA·,L6pez-Moya].】.,GarciaJ.A.RNAsilencinganditssuppressorsintheplant.virusinterplay.eLS:JohnWiley&Sons,Ltd,2009.ValIiA.,Martin—HernandezA.M.,Lopez-MoyabyasecondcopyoftheP1serineproteasememberofthefamilyPotyviridaethatlacks80(20):10055—10063.VanceV.B.ReplicationofpotatovirusXRNAVirology,1991,182(2):486-494.J.J..GarciaJ.A.RNAsilencingsuppressionofCucumberveinyellowingipomovirus,athecysteineproteaseHCPro./l,qrol,2006,isalteredincoinfectionswithpotatovirusY.VanceV.B.,BergerP.H.,CarringtonJ.C.,HuntA.G.,ShiX.M.5‘proximalpotyviralsequencesmediatepotatovirusX/potyviralsynergisticdiseaseintransgenictobacco.Virology,1995,206(1):583—590.VarrelmannM.,MaissE.,PilotR.,PalkovicsL.Useofpentapeptide—insertionscanningmutagenesisforfunctionalmappingofthePlumpoxvirushelpercomponentproteinascsuppressorofgenesilencing.JGenVirol,2007,88(Pt3):1005.1015.VigerustD.3.,ShepherdV~LVirusglycosylation:roleinvirulenceandimmuneinteractions.TrendsMicrobiol,2007,15(5):21l一218.VoinnetO.RNAsilencingasaplantimmunesystemagainstviruses.1≯endsGenet,200I,17(8):449·459.VoinnetO.,LedererC.,BaulcombeD.C.AviralmovementproteinpreventsspreadofthegenesilencingsignalinNicotianabenthamiana.Cell,2000,103(1):157.167.Voinnet0.,RivasS.,MestreP.,BaulcombeD.Anenhancedtransientexpressionsysteminplantsbasedonsuppressionofgenesilencingbythep19proteinoftomatobushystuntvirus.PlantZ2003,33(5):949—956.WangH.Y.,ZhuT.S.,CuiT.T.,HouS.S.,YinX.,LiX.-D.,LeiL.P.,ZhuX.P.CompletegenomesequenceofatobaccoisolateofthetobaccoveinbandingmosaicvirusstrainprevailinginChina.ArchVirol,2010,155(2):293—295.WangJ.,TufinaM.,MedinaV.,FalkB.W.SynergisticinteractionbetweenthePotyvirus.TurnipmosaicvirusandtheCrinivirus,Lettuceinfectiousyellowsvirusinplantsandprotoplasts.F/rusRes,2009,144(1-2):163—170.WangW.一Q.,NatsuakiT.,KosakaY.,OkudaS.ComparisonofthenucleotideandaminoacidsequencesofparentalandauenuatedisolatesofZucchiniyellowmosaicvirus.。JGenPlantPathol,2006,72:52—56.tWangY.,LeeK.C.,GabaV.,WongS.M.,PalukaitisP.,Gal.OnA.BreakageofresistancetoCucumbermosaicvirusbyCO—infectionwithZucchiniyellowmosaicvirus:enhancement104 ;.山东农业火学博-l二学位论文ofCMV·accumulationindependentofsymptomexpression.ArchVirol,2004,149(2):379—396.WintermantelW.M.,CortezA.A.,AnchietaA.G.,Gulati-SakhujaA.,HladkyL.L.Co.infectionbytwocrinivirusesaltersaccumulationofeachvirusinahost-specificmannerandinfluencesefficiencyofvirustransmission.尸hytopathology,2008,98(12):1340—1345.WuH.W.,LinS.S.,ChenK.C.,YehS.D.,ChuaN.H.DiscriminatingmutationsofHC-ProofZucchiniyellowmosaicviruswithdifferentialeffectsonsmallRNApathwaysinvolvedinviralpathogenicityandsymptomdevelopment.MolPlant—MicrobeInteract,2010,23(1):17—28.YambaoM.L.,YagihashiH.,SekiguchiT.,SasakiT.,SatoM.,AtsumiG.,TacahashiY.,NakaharaK.S.,UyedaI.PointmutationsinhelpercomponentproteaseofCloveryellowveinvirusareassociatedwiththeattenuationofRNA-silencingsuppressionactivityandsymptomexpressioninbroadbean.ArchVirol,2008,153(1):105—115.YangS.,RavelonandroM.MolecularstudiesofthesynergisticinteractionsbetweenplumpoxvirusI—IC—ProproteinandpotatovirusX.ArchVirol,2002,147(12):2301—2312.YapY.K.,DuangjitJ.,PanyimS.N-terminalofPapayaringspotvirustype-W(PRSV·W)helpercomponentproteinase(HC—Pro)isessentialforPRSVsystemicinfectioninzucchini.VirusGenes,2009,38(3):46l一467.Yulj.,ChapmanE.J.,YangZ.,CarringtonJ.C.,ChenX.TransgenicallyexpressedviralRNAsilencingsuppressorsinterferewithmicroRNAmethylationinArabidopsis.FEBSLett,2006,580(13):3117-3120.YuX.Q.,LanY.F.,WangH.Y.,LiuJ.L.,ZhuX.P.,ValkonenJ.,LiX.·D.Thecompletegcnomicsequenceoflbbaccoveinbandingmosaicvirusanditssimilaritieswithotherpotyviruses.VirusGenes,2007,35(3):801-806.ZhangC.L.,GaoR.,WangJ.,ZhangG.M.,LiX.D.,LiuH.T.Molecularvariabilityof7bbaccoveinbandingmosaicviruspopulations.VirusRes,2011,158:188—198.ZhangX.S.,HoltJ.,ColvinJ.Synergismbetweenplantviruses:amathematicalanalysisofthcepidemiologicalimplications.PlantPathol,2001,50(6):732—746.105 烟草脉带花nl‘病毒和马铃薯A病毒HC—Pro调控RNA沉默抑制、协生和致病力的扫啡0致谢本论文是在导师李向东教授的悉心指导下完成的,从论文的选题、实验设计、土£体操作和研究结果的分析整理,无不凝聚着李老师的心血和智慧。李老师渊博的学识、严谨的治学态度、精益求精的工作作风和忘我的工作精神,深深的感染和激励着我,是我战胜困难的巨大动力。师母翟荣惠老师在生活中也给予了很多关怀与帮助。从本科到现在11年来我的点滴进步都与李老师和翟老师的关怀、鼓励和帮助是分不丌的,在此,谨向李老师和翟老师致以最诚挚的谢意!李老师在学业上的支持和鼓励、生活J-ffj火·阿:和照顾,我将永远铭记于心。.衷心感谫}我的硕士导师竺晓平老师和田国忠老师在我考博期间给予的支持和鼓励。感谢瑞典农业大学的Valkonen教授提供了本课题所需要的PVAHC.Pro瞬时表达绒体;感谢储昭辉教授提供的农杆菌菌株,感谢时呈奎老师和吴悦明老师在实验仪器使川方面的帮助。感谢生科院刘红梅老师和景秀丽博士在同位素杂交方实验中给予的7iIj助。本课题的顺利完成离不开病毒室全体成员的共同努力。特别感谢刘志强师弟、杨炳辉师弟、王晓强师弟、崔小雯师妹、许斐斐师妹和阴筱师妹在同位素杂交试验和其他实验中给予的帮助;感谢已经毕业的刘金亮师兄、于晓庆师姐、兰玉菲师姐、张成玲klj:l-和贾金磊师弟在实验材料、试验技术和照片拍摄方面给予的指导和帮助;同时感谢实验室其他成员在实验和生活中的鼓励和支持。感谢所有帮助和关心我的老师和同学们。最后,我要深深感谢一直支持、关心和鼓励我的家人和朋友们,是他们的爱与llIIJ护是我不断前进的动力。特别感谢我的外婆、父亲、母亲、弟弟和妹妹在我二十多年的。-”y^.:-1-:4-涯中给予的无私的支持和鼓励;衷心感谢高瑞对我的理解、关爱和包容,在遇剑|木I难和挫折时给我的鼓励和支持。感谢参加本论文评阅、答辩和对本论文提出宝贵建议的所有专家和同行12012年6月于泰安 山东农业人学博I?学位论义j._一d——————————————ill111l攻读学位期间发表论文情况WangJ,ZhuX..P'GaoR,LinC.-L,LiYXuQ.一C,PiaoC.一GLiX.-D,LiH.-F'TianG-Z.GeneticandserologicalanalysesofelongationfactorEF-Tuofpaulowniawitches'-broomphytoplasma(16SrI-D).PlantPathology,2010,59(5):972-981.Wang.1,ZhuX.一P'LiX.一D,LinC.-L,’GaoR,LiYXuQ.一C,PiaoC.一G,LiH.一FandTian(、.一Z.CloningandexpressionofPaulowniawitches’一broomphytoplasma(EF-Tu)tufgeneinEscherichiacoliandantiserumpreparation.Proceedingsof9thInternationalCongressofPlantPathology.2008,S2,465.ZhangCL,GaoR,WangJ,ZhangG-M,LiX.-D,LiuH.·T.MolecularvariabilityofTobaccoveinbandingmosaicviruspopulations.VirusResearch,2011,158(1-2):188—98.(共同第一作彬‘)GaoR.,TianYP.,WangJ.,LiX.D.,JariP.T.Valkonen..Constructionofaninfectiousc1)NAcloneandgeneexpressionvectorofTobaccoveinbandingmosaicvirus(genusPotyvirus).VirusResearch.Accepted(共同第一作者)GaoR,WangJ,ShaoY-H,LiX.一D,YangB.一H,ChangW.一C,ZhaoW.一J,ZhuS.-EMolecularidentificationofaphytoplasmaassociatedwithElmwitches'-broominChina.Forestl'athology,2011,41:355—360.(共同第一作者)正沽,开{国忠,徐启聪,刘永光,高瑞,李向东,竺晓平.泡桐丛枝病病树周围几种午Il[物上植原体的分子检测.中国农业科学,2010,43(2):304—312.正沽,刘金亮,阴筱,高瑞,刘红梅,李向东,刘焕庭.HC.Pro三个参与抑制RNA沉默氨.JlI酸位点的鉴定.植物病理学报,2012,42(3):267.273.刘水光,FH旧忠,王洁,李向东,竺晓平,束怀瑞.山东蚕区桑黄化型萎缩病病原物的分’J乞耠定.蚕业科学,2009,35(3):463.471.107

当前文档最多预览五页,下载文档查看全文

此文档下载收益归作者所有

当前文档最多预览五页,下载文档查看全文
温馨提示:
1. 部分包含数学公式或PPT动画的文件,查看预览时可能会显示错乱或异常,文件下载后无此问题,请放心下载。
2. 本文档由用户上传,版权归属用户,天天文库负责整理代发布。如果您对本文档版权有争议请及时联系客服。
3. 下载前请仔细阅读文档内容,确认文档内容符合您的需求后进行下载,若出现内容与标题不符可向本站投诉处理。
4. 下载文档时可能由于网络波动等原因无法下载或下载错误,付费完成后未能成功下载的用户请联系客服处理。
关闭