我国北方金龟科甲虫分子标记和系统发育研究

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1、万方数据贾晨曦沈阳大学分类号:——密级:公开单位代码:—竺溶穆火警硕士学位论文论文题目:我国北方金龟科甲虫分子标记和系统发育研究学作学科号:者:名称:贾晨曦动物学2014年6月24日我国北方金龟科甲虫分子标记和系统发育研究万方数据沈阳大学硕士学位论文J0121642Jll//lllllllllllJ㈣㈣删删论文题目:华固j仁方拿粤群甲粤分亍带粤寸季筝咎亨够窖作者:贾晨曦指导教师:协助指导教师:竺竺竺鍪堡尊啦:鲨单位:论文提交日期:2014年6月24日学位授予单位:沈阳大学单位:万方数据我国北方金龟科甲虫分子标记和系统发育研究StudiesontheMolecula

2、rMarkersandPhylogenyoftheScarabaeidaeBeetlesfromNorthernChina研究生姓名:贾晨曦指导教师姓名:郭晓华沈阳大学沈阳,110044,中国Candidate:JiaChenxiSupervisor:GuoXiaohuaShenyangUniversity21SouthWanghuaStreet,DadongDistrictShenyang,110044,P.R.CHINA万方数据独创性说明本人郑重声明:所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,

3、论文中不包含其他人已经发表或撰写的研究成果,也不包含为获得沈阳大学或其他教育机构的学位或证书所使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中做了明确的说明并表示了谢意。签名:重是盘日期:塑!望!五x垒关于论文使用授权的说明本人完全了解沈阳大学有关保留、使用学位论文的规定,即:学校有权保留送交论文的复印件,允许论文被查阅和借阅;学校可以公布论文的全部或部分内容,可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文。(保密的论文在解密后应遵循此规定)签名:曼黑鸯导师签名:日期:矽,t多.汕万方数据沈阳大学硕士学位论文摘要金龟科Scarabaeidae隶属鞘翅目

4、Coleoptera多食亚目Polyphaga金龟总科Scarabaeoidea。包括13亚科约1600属27000种。植食性金龟是重要的农林害虫,粪食性金龟对维持生态平衡、保护环境则具有重要意义。国内外关于金龟科的分类研究主要是基于形态学特征,分子水平的研究还十分有限。关于金龟科种类的分类地位和系统关系始终存在较大争议,应用分子标记对该类群开展研究有重要意义。本文在研究标本最佳保存方法和最佳提取DNA方法的基础上,基于线粒体16SrRNA以及核28SrRNA基因分子标记,运用生物信息学分析方法,结合形态学特征,探讨了中国北方金龟科不同亚科间、族的分类地位和系统发

5、育关系。(1)以白星金龟甲虫作试材,通过电泳检测和PCR扩增28SrRNA核基因序列,比较了无水乙醇、75%乙醇、针插干制3种保存标本的方式和SDS.蛋白酶K法、CTAB法、饱和NaCl法3种提取DNA方法。结果显示,金龟科甲虫最佳保存方法为无水乙醇保存法,最佳提取方法为SDS一蛋白酶K法。(2)通过PCR扩增和软件分析,获得金龟科种类16SrRNA、28SrRNA基因序列,片段长度分别为415bp、53lbp。序列组成分析结果显示:16SrRNA基因序列中T、C、A、G的平均含量分别为39.9%、7.6%、36.7%和15.8%,A+T含量为76.6%,表现出线

6、粒体A+T碱基偏好性。28SrRNA基因序列中T、C、A、G的平均含量分别为20.3%、24.4%、24.5%和30.7%,G+C含量为55.1%,表现出G+c碱基偏好性。(3)变异位点分析结果显示:16SrRNA基因序列中,核苷酸变异位点166个,简约信息位点为156个;28SrRNA基因序列中,核苷酸变异位点79个,简约信息位点为66个。两个基因的数据集均具有足够核苷酸变异位点和简约信息位点。(4)R值(转换/颠换)分析结果表明:16SrRNA基因序列中,转换发生17次,颠换发生37次。转换的发生主要在T与A之问,颠换主要发生在A与G之问,转换与颠换的比值为0

7、.53;28SrRNA基因序列中,碱基替代转换(10次)多于颠换(9次),转换主要发生在T和C之间,颠换发生在A和T之间。碱基替换饱和度分析结果显示,两个基因的碱基替代均没有呈现饱和态势。(5)遗传距离分析结果显示:16SrRNA序列7个亚科间遗传距离在万方数据沈阳大学硕士学位论文11.8%~19.6%之间。族问遗传距离6.5%~22.4%,族内遗传距离在0~13.2%之间,平均为11.5%。28SrRNA序列7个亚科间遗传距离范围为1.8%~5.6%。族间遗传距离O.4%~7.2%,族内种问遗传距离0~3.5%。显示族问遗传距离大于族内种间的遗传距离的趋势。(6

8、)系统进化

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