不同品系金鱼和鲫鱼的线粒体分子标记及其系统发育分析

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时间:2019-05-16

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1、摘要我国的鱼类实验动物开发利用研究工作比较滞后,标准化的鱼类实验动物至今仍是空白。以中国为原产地的金鱼(国朋船j船a姗芒船№)可以作为一种鱼类实验动物进行研究与开发。关于金鱼的解剖性状、蛋白质、同工酶和基因组DNA的随机多态扩增(RAPD)已有一些研究报道,但是,把金鱼作为实验动物,其系统进化关系和分子遗传背景尚有一些争议,很有必要进行深入的研究。线粒体DNA具有自身独特的遗传系统,是理想的物种鉴定的遗传标记物之一。作为分子标记己被广泛应用于各物种系统发生的研究。本文通过研究不同品系的金鱼和鲫鱼的线粒体DNA控制区及其一侧tRNA基因部分核苷酸序列及Cytb序列的对比,为金鱼的系统进化关

2、系和遗传背景研究提供分子生物学证据。本研究的主要研究内容如下:1、对金鱼的代表品种红龙睛、红帽子、虎头、琉金、墨龙睛、水泡眼及彭泽鲫的线粒体DNA控制区及tRNA—Thr和tRNA—Phe基因进行了测序,将所得序列同GenBank中日本白鲫、红鲫、鲤鱼的序列进行比较分析。分析结果说明tRNA—Thr、tRNA—Phe基因序列变化较小,保守性高,进化慢,不能很好地提供系统发育信息;控制区遗传变异程度较高,因而可以为金鱼和鲫鱼系统发育研究提供一个好的分子遗传标记。从线粒体控制区分析证实了金鱼起源于鲫鱼,在演化过程中其遗传物质发生了较大的变异,各个品种金鱼的遗传物质也形成了一定的分化。2、对金

3、鱼的代表品种红龙睛、红帽子、虎头、琉金、墨龙睛、水泡眼、珍珠及彭泽鲫的Cytb基因进行了测序,将所得序列同GenBank中日本白鲫、银鲫、红鲫、野鲫和鲤鱼的序列进行比较分析。从Cytb基因分析,进一步证实了金鱼起源于鲫鱼。关键词:金鱼,鲫鱼,线粒体DNA,控制区,Cytb基因AbstractTheresearchoffishasanexperimentalanimalis1aginChina,andthestandardizedanimalofexperimentalfishisstillblankness.G01dfish(('a,assj£,sa啪fus比射哆,whichorigin

4、proVenanceisChina,couldbeaexperimentanimaloffishforstudyandexploration.Theanatomyproperties,protein,isodynamicenzymeandrandomlyamplifiedp01ymorphicgenomeDNAofthe901dfishhavebeenstudiedandreported.HowerVer,asaexperimentalanimal,therelationshipofsystemevolutionandtheinheritm01ecularbackgroundaresti

5、llarguably.MtDNAisawidelyusedmolecularmarkertoinvestigatethephylogenesisofspecies.Inpresentstudy,mitochondrialtRNA—Thrgene,tRNA—Phegeneandpartialcontrolregion(D一100p)andCytbofdifferentvarietiesof901dfishes(1么nFsj£,sa“2一a}£,s训andcruciancarps(c:’arssj“sa“,a芒“曲hadbeensequenced.TherelationshipofmtDNA

6、m01eculargeneticbetweenthesefishesandotherrelatedfisheswerei1luminated.Themajorresultsinthispaperwerepresentedasf0110ws:1、MitochondrialtRNA—Thrgene,tRNA—Phegeneandpartialcontr01regionofrepresentativevarietiesof饧,ssj“sa“,a芒“sIlIyar,reddragongoldfish,redcap901dfish,tigerheadgoldfish,901dplatinggold

7、fish,blackdragon901dfish,waterVesiclego1dfishandCTa粥sj“sa“,a芒队sofPengZeweresequenced.ThemolecularphylogenetictreeoftRNA—Thrgene,tRNA—Phegeneandpartialcontrolregionsequencesamongthesegoldfish,redcruciancarp,Japanesecruc

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