基于bin map高密度连锁图谱定位玉米容重及相关性状的qtl

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1、万方数据SichuanAgriculturalUniversityMasterDissertationQTLAnalysisformaizetestweightrelatedtraitsusingthehighdensitylinkagemapBinmapByHuangZhitaoAdvisor：Prof．ZhangZhimingAssociateRes．LiLujiangMajor：CropGeneticsandBreedingDirection：MaizeGeneticsandBreedingMay2014万方数据独创性声明IIIIII

2、IIIIllIIIIIIIlllMMItlIIIIJO120526本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得四川农业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名：裹自香7一一一-I时间：擀丐只芍El关于论文使用授权的声明本人完全了解I四Jll农业大学有关保留、使用学位论文的规定，即：四川农业大学有权保留送交论文的复印

3、件和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意四川农业大学可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。髀论文不保密。口本论文保密，在一年解密后适用本授权。(请在以上口内划“√")论文作者签名．黄芝绣、J时间：矽f弋年L一，。I、(月25El⋯名：獬痈计扮帆p／，年f月K泪万方数据摘要玉米是我国重要的食品、饲料和化工等产品的原材料。我国玉米产业目前基本能满足现代玉米工业及饲料加工业的需要，但是其发展存在两个瓶颈，一是单产提升缓慢，二是商品品质较差，严重影响了国际市场的竞争力。玉米容

4、重是一个重要的产量性状，也是玉米商品及加工品质的重要指标，同时也是作物超高产育种的重要目标性状。多年以来，关于玉米品质的研究多集中在营养和加工品质上，而对商品品质尤其是容重的研究较少；对容重这个复杂性状的遗传基础研究不够深入，导致我国玉米容重改良进展缓慢，严重影响了国际市场的竞争力。因此，以玉米容重为研究对象，根据基于下一代测序技术的高密度连锁图谱Binmap，鉴定出决定玉米容重及其相关性状的主效QTL，并对其遗传机理和生物学功能进行研究，从而解析容重这个复杂性状的遗传基础，对加快玉米容重的遗传改良、改进我国玉米品质和提高国际市场的竞争力等

5、具有十分重要的意义，为提升产量和品质的分子辅助育种提供一定的理论基础。在本研究中，使用爱荷华州立大学提供的IBMSynl0DH群体作为实验材料(亲本为M017和B73)，并于2013年在四川绵阳及黑龙江哈尔滨分别进行2个重复的表型鉴定，同时结合本课题组前期获得的IBMSynl0DH群体基因型数据构建Binmap遗传连锁图谱，采用QTLeartographer软件的复合区间作图法(CIM)对玉米容重及其相关性状(百粒重、籽粒水分含量、粒长、粒宽、粒厚)进行QTL定位，发掘控制玉米容重及其相关性状的主效QTL，试图阐明玉米容重的构成因子和遗传机

6、制，旨在为玉米容重分子标记辅助选择及相关基因图位克隆打下坚实的基础，结果如下：1．对125份IBMSynl0DH群体材料两点4重复的容重、百粒重、籽粒水分含量、粒长、粒宽和粒厚等6个性状的表型数据进行统计分析。正态分布检验结果表明：各性状在2点联合分析下均呈正态分布；相关分析结果表明：容重和百粒重在两个地点和两点联合分析中达到极显著正相关，证明容重的产量性状属性，其他性状之间的相关关系受环境影响显著。2．在课题组前期构建的280份材料的IBMSynl0DH群体binmap遗传图谱的基础上，重新构建经过筛选的125份该群体的binmap遗传连

7、锁图谱，该图谱包含6277个binmarker，总覆盖玉米基因组为4558．4cM，染色体长度范围为277．37cM．722．64cM，相邻binmarker标记间最大距离14．90cM，最小间距为0．01cM，平均遗传距万方数据离为0．73eM的遗传连锁图谱。利用R软件包‘wgaim’绘制遗传图谱。3．利用QTLCartographerUnixversion1．17f软件，采用复合区间作图法对容重及其相关性状进行QTL定位，共检测到159个玉米容重及其相关性状的QTL，分布在玉米第1到第10染色体上。其中，与玉米容重性状相关的QTL有40

8、个，可解释表型变异的贡献率范围为4．37％．16．8％；籽粒水分含量性状的QTL42个，可解释表型变异的贡献率范围为3．79％．16．44％；籽粒百粒重性状的QTL39个，可解释