自噬基因irgm与结核病的关联分析及其机制探讨

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1、自噬基因/i?GM与结核病的关联分析及其机制探讨论文作者签名:jo指导教师签名:论文评阅人1张咸宁教授浙江大学评阅人2熊思东教授复旦大学评阅人3徐薇副教授复旦大学评阅人4评阅人5答辩委员会主席:刘晋闽教授浙江省中医院委员1:刘晋闽教授浙江省中医院委员2:李漦坚教授浙江红会医院委员3:何剑琴副#仵医师浙江大学委员4:委员5:答辩日期：2012年2月，日致谢浙江人学硕卜学位论文致谢在浙江大学医学院硕士生学习生活即将结束，回顾两年半的求学心中感慨万千。在论文完成之际向所有给予我关心和帮助的人们致以最诚挚的谢意。首先，我要衷心感谢我的导

2、师丁世萍副教授。本研究是在导师丁世萍副教授的精心指导下完成的，从课题的选择、实验设计、到论文撰写、修改和定稿与丁老师的细心指导是分不开的。丁老师渊博的学识，严谨求实的科学态度和一丝不苟的工作作风，永无止境的科学追求，宽人律己的博大胸襟都在我的记忆中留下了深深的烙印，给我今后的工作和学习树立了榜样和努力的方向，这些将使我终身受益。在此，谨向丁老师致以崇高的敬意和衷心的感谢！非常感谢浙一医院何剑琴副主任医师和红会医院李凫坚主任医师在我们收集样本时给予的无私帮助和指导，正是在他们的帮助下我们才得以顺利收集到符合标准的样本。感谢与我共同成长的同窗好友姜涛，秦蓓蓓在学习，实验

3、，生活中对我的关心和帮助！正是由于他们的参与和欢笑才化解了实验中的阴霾。他们的热情和友善使我在多年的学习生涯中时常有家一般的感觉，她们的鼓励和帮助使我能如期完成学业，在此表示衷心的感谢和诚挚的谢意。我会记得你们，请常和我联系。此外，要特别感谢我的父亲和母亲为我在多年求学生涯中倾注的爱，他们在我学习和工作的过程中一直是我的坚强后盾，给了我别人不能替代的包容和爱，分享我的欢乐和痛苦，给我继续前行的动力。也要感谢那些一直关心我、支持我的亲朋好友......值此论文完成之际，再一次感谢所有为我完成学业而付出辛勤劳动的老师、同学和亲友们！i浙江人学硕士学位论文中文摘要自噬基因

4、与结核病的关联分析及其机制探讨中文摘要目的：探讨自噬基因/i?GM基因与结核病易感的关系及其相关机制。方法：首先，在中国人群中进行病例对照研究。采用SnaPshotSNP分型技术和Two-stages方法相结合，在960个样本（483正常：477病例）对/i?GM基因9个单核苷酸多态性（SNP)位点（rsl3361189、rs73282255、rs4958846、rsl0051924.rs7255865、rs9637876、rs72553867、rsl0065172,rs4958847)进行检测。釆用SNPstats软件和haploview软件，计算各组等位基因频率

5、和基因型频率、Hardy-Weinberg遗传平衡检验、分析两组分布频率的差异、计算优势比（OR)及95%可信区间（CI)以及//?GM基因多态性位点连锁不平衡系数（D'值和r2值）和单倍体型频率，分析目的基因与结核病的关联程度。其次，针对筛选出的结核病相关高风险基因多态性位点，采用体外报告基因的表达，细胞转染，细胞定位及westem-blot技术探讨结核病易感位点的分子机理。结果：（1基因中rsl3361189位点的基因和基因型频率在对照组与结核病例组间存在差异（最佳遗传模型为显性效应，OR:1.52;95%CI:1.14-2.03;尸=0.0038)。单体型分

6、析结果进一步显示rsl3361189(C)/rs4958847(G)/rs72553867(C)单体型区段是结核病的易感区段（OR=12.76;95%CI=3.08-52.95;尸=5e-04)。(2)对于rs72553867(A/C)位点的进一步功能验证表明，IRGM(AA)基因型与IRGM(CC)基因型其编码蛋白均可定位于线粒体和溶酶体上，但两者在自噬方面存在着差'异，IRGM-AA的自噬泡LC3阳性点数（3.5个/细胞）高于IRGM-CC(2个/细胞)(尸=0.011),且其LC3II/GAPDH的比值大于IRGM-CC(尸=0.044),可能是潜在的功能位点

7、。II浙江人学硕上学位论文中文摘要结论：自噬基因/i?GM是结核病的易感基因之一。关键词：结核病；易感性；IRGM;SNPs;变异位点in浙江大学硕I：学位论文英文摘要TheassociationanalysisofautophagygeneIRGMwithtuberculosisanditsmechanismsAbstractObjective:ToinvestigatethegenepolymorphismsofIRGMgenesusceptibiletotuberculosisinChinesepopulation.Methods:Acase-contr