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时间:2018-10-15
《ntsys制作聚类图(实例讲解)》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、用NTSYSpc2.10e制作聚类图(实例讲解)1.在EXCEL表中先建立一个0,1构成的矩阵:按如下规则输入数据,A1=1表示有带记为1,B1=38表示AFLP/SSR/RFLP有38个条带,C1=60表示样本数,D1=0表示无带记为0。如图(每个列为一个样本的条带情况):2.将EXCEL数据复制粘贴到文本格式,命名保存sz2.txt。3.打开ntsys软件的,将文本文件导入软件中:点Similarity,选中Qualitativedata,inputfile栏导入保存的sz2.txt。在Outputfile栏输入sz3,点Compute,会出现一个报告:4.点
2、Clustering,选SAHN,inputfile栏导入sz3.NTS,Outputtreefile栏输入sz4,点Compute,又会出现一个报告:5.点Graphics,选Treeplot,inputfile栏导入sz4.NTS,点Compute,就出现一个报告和聚类图:因为默认设置显示样本数是30,需改变设置为60,点聚类图的Options,选plotoptions,在Phenogram中的OTUs/page栏改30为60:点OK,全部样本的聚类图就出来了:点File进行图片保存即可。注:Font栏还可设置字体及大小,Lines栏可设置线的粗细等。
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