abca1基因多态性与血浆载脂蛋白a1水平的关系的论文

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1、ABCA1基因多态性与血浆载脂蛋白A1水平的关系的论文作者：李亚，王玉明，王丹，贺勇【摘要】目的：探讨汉族人群腺苷三磷酸结合盒转运体a1（abca1）基因单核苷酸多态性（snp）与血浆载脂蛋白a1（apoa1）水平的关系.方法：选取abca1基因r219k,v825i,m883i和r1587k等4个编码区snps，采用pcr限制性片断长度多态性分析技术确定376名健康个体基因型；用thesias程序分析snps的连锁不平衡关系及单倍型.结果：受检人群中，4种snps各自不同基因型个体间apoa1水平差异均未见统计学意义（p＞0.05）.r219k与m883i,v825i与

2、m883i以及v825i与r1587k两两间存在连锁不平衡(p<0.01).以v825i和r1587k构建的两位点单倍型中，ik单倍型携带者apoa1水平较vr单倍型携带者显著降低(p<0.05).结论：abca1基因v825i和r1587k多态性与汉族人群血浆apoa1水平变化有关，但这种关联取决于该两个snps间形成的单倍型.【关键词】abca1基因；载脂蛋白a1；单倍体型；连锁不平衡0引言血浆高密度脂蛋白胆固醇（highdensitylipoproteincholesterol，hdlc）水平降低是冠心病的独立危险因素之一［1］.腺苷三磷酸结合盒转运体

3、a1（atpbindingcassettetransportera1，abca1）介导胆固醇、磷脂从肝外组织的流出，并通过与载脂蛋白a1（apolipoproteina1，apoa1）相互作用，在胆固醇逆向转运和高密度脂蛋白（highdensitylipoprotein，hdl）生成的起始阶段发挥着关键的作用，因此，abca1被认为是决定hdlc水平的主要因素之一［2］.群体遗传学研究表明，abca1基因的某些单核苷酸多态性（singlenucleotidepolymorphism，snp）可改变abca1蛋白活性并由此引起hdlc水平变化，从而影响个体对冠心病的易

4、感性［3-4］.然而，有关abca1基因snps对血浆apoa1水平影响的研究报道却相对缺乏.为此我们在本研究中探讨了abca1基因4种snps及其构成的单倍型与汉族人群apoa1水平变化的关系.1对象和方法1.1对象来自四川大学华西医院和成都医学院第一附属医院无血缘关系的四川地区汉族体检个体376（男194，女182）例，年龄(58.4±8.6)岁，apoa1水平（1.324±0.186）g/l，体质量指数（24.62±3.39）kg/m2，总吸烟率为27%，并经询问病史、体检、心电图等检查排除心血管疾病史.1.2方法1.2.1标本采集与处理禁食12h后抽取研究对象外周血

5、5ml，采用免疫比浊法并按试剂盒（上海荣盛生物技术公司）推荐条件测定血浆apoa1水平；另采集外周血3ml，1mlacd抗凝，盐析法提取dna，te缓冲液溶解dna并置于4℃冰箱中备用.1.2.2多态位点的基因型分型采用pcr限制性片断长度多态性分析法对4个snps进行分型.首先，参照基因组序列（genbank登录号：nm005502）设计合成相应pcr引物，对受检者abca1基因r219k，v825i，m883i和r1587k等4个snps位点所包含的dna序列进行扩增；再取扩增产物15μl，分别加入4u限制性内切酶和2μl酶切缓冲液，并加超纯水至总体积20μl，37

6、℃水浴中保温16h；最后，消化产物经30g/l琼脂糖凝胶电泳后，用凝胶成像系统分析电泳结果，判定个体基因型.pcr反应条件、限制性内切酶以及各基因型酶切情况见表1.表1abca1基因snps的基因型分型统计学处理：每个snp的hardy883i和r1587k多态各自不同基因型个体间apoa1水平差异均无统计学意义（p＞0.05,表3）.表34种多态位点不同基因型个体间apoa1水平比较2.3配对连锁不平衡分析abca1基因4个snps位点的配对连锁不平衡用统计量d′表示（d′=d/dmax）.表4可见，在全部6个配对组合中，v825i分别与m883i和r1587k间存在较

7、强的连锁不平衡（d′>0.7）.此外，在r219k和m883i间也检测到有统计学意义的连锁不平衡（d′=0.572）.值得注意的是，在r219k至r1587k位点约1.36kb范围内，我们未发现2个以上的snps位点彼此间的连锁不平衡关系.2.4abca1基因单倍型与apoa1水平的关联分析由于在分析区域内未检测到3或4个snps位点彼此间的连锁不平衡，我们仅以具有连锁不平衡关系的snps构建两位点单倍型，分析这些单倍型与apoa1水平变化的关系.表5显示，以v825i和r1587k构建的单倍型中，ik单倍型