技术方法名称 rt-pcr

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1、技术方法名称RT-PCR（定性、半定量）基本原理逆转录PCR（reversetranscriptase-PCR，RT-PCR）是一种从RNA扩增cDNA拷贝的方法。目前有关RT-PCR的多种变异类型的报道文献已经很多，并且它们有自己的字母缩写形式。尽管其技术细节从不同来源文章略有差异，但是基本的概念是稳定与相对简易的：首要步骤为酶促催化使RNA（总RNA或poly(A)+RNA，但当应用RT-PCR检测基因的表达强度时，最好以总RNA作为模板，目的是尽量保持样品的真实性）逆转录为cDNA第一链。一条寡聚脱氧核苷酸引物（随机引物、oligo(dT)或基因特异性的

2、引物（GSP））先与RNA杂交，然后由RNA依赖的DNA聚合酶催化合成互补的cDNA拷贝，后者能进一步用于PCR扩增。RT-PCR可以一步法或两步法的形式进行。在两步法RT-PCR中，每一步都在最佳条件下进行。cDNA的合成首先在逆转录缓冲液中进行，然后取出1/10的反应产物进行PCR。在一步法RT-PCR中，逆转录和PCR在同时为逆转录和PCR优化的条件下，在一只管中顺次进行。两步法RT-PCR比较常见，在使用一个样品检测多个mRNA时比较有用。然而一步法RT-PCR具有其他优点。一步法RT-PCR在处理大量样品时易于操作，有助于减少残余污染，因为在cDNA

3、合成和扩增之间不需要打开管盖。一步法可以得到更高的灵敏度，最低可以达到0.1pg总RNA，这是因为整个cDNA样品都被扩增。对于成功的一步法RT-PCR，一般使用反义的基因特异性引物起始cDNA合成。两步法步骤一步法步骤起始第一链cDNA合成使用：起始第一链合成使用Oligo(dT)GSP引物随机六聚体 GSP引物 优点优点•灵活•方便 引物选择 扩增酶同逆转录酶预先混合 扩增酶的选择 转管步骤少，减少污染可能性•困难RT-PCR的优化能力•高灵敏度 同Platinum®酶结合提高特异性•适用于大量样品分析 同PlatinumPfxTaqDNA聚合酶结合提高忠

4、实性•适用于定量PCR•适用于在单个样品中检测几个mRNA 关于扩增酶和产物大小应注意：•对于小于4kb的产物使用TaqDNA聚合酶或PlatinumTaqDNA聚合酶•对于小于12kb的产物使用PlatinumPfxTaqDNA聚合酶或PlatinumTaqDNAPolymeraseHighFidelity•对于大于12kb的产物使用ELONGAE®EnzymeMix•对于一步法RT-PCR，如果产物小于3.5kb，使用TaqDNA聚合酶或PlatinumTaqDNA聚合酶；如果产物小于9kb，使用PlatinumTaqDNAPolymeraseHighFi

5、delity。用途及受限因素1.RT-PCR将以RNA为模板的cDNA合成同PCR结合在一起，提供了一种分析基因表达的快速灵敏的方法。RT-PCR用于对表达信息进行检测或定量。另外，这项技术还可以用来检测基因表达差异或不必构建cDNA文库克隆cDNA。RT-PCR比其他包括Northern印迹、RNase保护分析、原位杂交及S1核酸酶分析在内的RNA分析技术，更灵敏，更易于操作。从RNA水平对基因的表达进行检测或定量。2.此外，RT-PCR对于获得与克隆mRNA的5’、3’末端序列和从非常少量的mRNA样品构建大容量的cDNA文库方面都是极其灵敏与通用的方法。

6、此外，RT-PCR还易于鉴定已转录序列是否发生突变及呈现多态性。3.RT-PCR是以RNA为模板，前提是基因有转录。然而，许多基因的转录表达具有组织特异性。而且，许多基因的丰度很低，不易检测。所以这些都使得RT-PCR的应用受到一定的限制。实验材料1.耗材离心管（规格：0.5ml）、Tip（规格：0.2ml）。要求无RNase和DNase污染。处理方法一般来说，未开封的进口离心管或Tip均无RNase和DNase污染。但为了慎重起见，需要重新处理。处理程序如下：洗涤饭盒、烧杯和量筒，使之干净干烤，250℃4h，或180℃8h以上。干烤时，量筒和烧杯口均需要用铝

7、箔纸量筒量取无菌去离子水（最好是新鲜制备的水），在烧杯中配制含0.1%DEPC的水溶液，配制时要求混匀，因为DEPC难溶于水DEPC水溶液加到干烤过的饭盒中，一般需要1.2L，投入适量的离心管和Tip，并尽量使它们均浸泡在水溶液中37℃过夜尽可能地倒去浸泡液，注意不要开盖，以避免RNase的污染高压蒸气灭菌，15lbf/in2,（1.034×105Pa），20min烘干，100℃2h置于干净的环境，备用2.试剂逆转录酶Taq酶及其缓冲液基因特异性引物Oligo(dT)12-18，或随机引物，或基因特异性引物（GSP）10mMdNTPMix逆转录缓冲液0.1MD

8、TTRNase抑制剂无菌去离子水所有与