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《黄瓜扩张素蛋白基因csexpb1的克隆及表达分析》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、园艺学报,2015,42(4):679–688.ActaHorticulturaeSinicadoi:10.16420/j.issn.0513-353x.2014-0958;http://www.ahs.ac.cn679黄瓜扩张素蛋白基因CsEXPb1的克隆及表达分析**孟永娇,李季,徐建,张开京,娄群峰,陈劲枫(作物遗传与种质创新国家重点实验室,南京农业大学园艺学院,南京210095)摘要:基于黄瓜果实转录组学研究,筛选并克隆了一个扩张素蛋白(β-expansin)基因CsEXPb1。蛋白序列同源比对发现CsEXPb1蛋白是一类钙调素类似蛋白(C
2、almodulin-likeProtein,CML),与甜瓜、草莓及番茄扩张素蛋白基因具有较高的相似性;ExPasy分析发现CsEXPb1为亲水性蛋白,亚细胞定位分析证明该蛋白广泛分布在细胞质以及细胞核结构中;qRT-PCR分析发现CsEXPb1无论是在授粉坐果还是单性结实坐果过程中皆上调表达,而在不授粉败育的果实中下调表达;qRT-PCR也表明CsEXPb1的表达受到生长素、细胞分裂素和赤霉素等单性结实诱导激素的正向调控,推测CsEXPb1与黄瓜坐果有关,可能参与了激素诱导的单性结实过程。关键词:黄瓜;扩张素蛋白;CsEXPb1基因;表达分析;坐
3、果;单性结实中图分类号:S642.2文献标志码:A文章编号:0513-353X(2015)04-0679-10CloningandExpressionAnalysisoftheExpansinGeneCsEXPb1inCucumber**MENGYong-jiao,LIJi,XUJian,ZHANGKai-jing,LOUQun-feng,andCHENJin-feng(StateKeyLaboratoryofCropGeneticsandGermplasmEnhancement,CollegeofHorticulture,NanjingAgric
4、ulturalUniversity,Nanjing210095,China)Abstract:Basedontranscriptomestudyofcucumberfruitset,aβ-expansingene:CsEXPb1wasclonedandinvestigatedinpresentstudy.HomologBLASTshowedthatCsEXPb1isbelongedtoCalmodulin-likeProteinfamily,andhashighsimilaritieswiththeexpansingenesofCucumismel
5、o,Fragariavescasubsp.vescaandSolanumlycopersicum.TheExPasyanalysisshowedthatCsEXPb1isahydrophilicprotein;ThesubcellularlocalizationanalysisindicatedthatCsEXPb1localizedinplasmamembrane,cytoplasmandnucleus;qRT-PCRanalysisfoundthatCsEXPb1wasup-regulateexpressedduringpollinationa
6、ndparthenocarpyfruitsetincucumber,whiledown-regulatedduringfruitabortion;qRT-PCRalsoshowedthatthetranscriptionofCsEXPb1couldbecis-regulatedbyfruit-setinducinghormonesi.e.auxin,cytokininandgibberellin.Therefore,itwasspeculatedthatCsEXPb1maybecloserelatedtohormoneinducedpartheno
7、carpicfruitsetofcucumber.Keywords:cucumber;expansin;CsEXPb1gene;expressionanalysis;fruitset;parthenocarpy收稿日期:2014–12–15;修回日期:2015–03–19基金项目:国家自然科学基金重点项目(31430075);国家重点基础研究发展计划(‘973’)项目(2012CB113904);国家‘863’项目(2012AA100202);农业部行业专项(201403032);国家自然基金青年基金项目(31301781);江苏省青年基金项目(B
8、K20130674)*通信作者Authorforcorrespondence(E-mail:liji1981@njau.e
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