通过数据发现育种中存在的问题

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1、通过数据发现育种中存在的问题全国种猪遗传评估中心主要内容•利用数据分析育种工作存在的问题•如何解决数据上传过程中错误记录核心群数量统计一个自然年度纯繁分娩母猪数量。国家生猪核心育种场核心群数量要求长白或大白600头或杜洛克300头。年产仔1.8窝左右。2014年核心场督导检查核心群数量打分如何获得遗传进展?选择反应遗传变异选择强度选择准确性世代间隔评价纯种选育效率的指标是遗传进展深入理解影响遗传进展四个因素,制定最优育种方案选择差留种个体表型值平均数与所有经过性能测定个体的表型值平均数之差,被选留个体具有的表型优势选择反应的基本公式选择反应:通过人工选择,在一定时间内,使得性状

2、向着育种方向改进的程度,选择反应代表了被选留个体所具有的遗传优势,公式:R=h²某场近4年留种母猪选择差100KG日龄、100KG背膘100KG日龄100KG背膘结测测定总数留种数量留种/测定年度测定留种留种-测定测定留种留种-测定201117345650.33178.49191.5113.029.789.29‐0.49201225355080.20181.31192.1610.858.357.87‐0.48201327214620.17174.24183.569.329.269.600.35201444623540.08178.07191.3313.269.879.49‐0.38选择反

3、应遗传力选择差选择准确性估计育种值与真实育种值间的相关系数,衡量育种值估计准确度或选择准确度最合适指标,与选择反应成正比估计的越准确就越可能选择真正的“优秀”个体做为下一代的父母数据规模越大,育种值估计的精确度越高,对遗传力低的性状尤为重要留种猪是否有测定成绩、遗传评估成绩?某场2013,2014本场出生分娩母猪测定比例出生年度品种总数测定数测定比例LL1020.22013YY127530.42DD51330.65LL104610.592014YY3122500.8LL1020.22013、2014年有效测定量分别是2980,2009留种公猪、留种母猪测定比例评分2014年督导检查表选

4、择强度以表型标准差为单位的选择差=标准化的选择差,大小取决于留种率,留种率越低,选择强度越大。正态分布下留种率对应的选择强度?留种率与选择强度函数关系成立条件生产性状必须是正态分布选择按照严格选择界限选择在足够大测定群中进行随机选择关系不成立,完全随机无论留种率多少选择强度都是0留种率0.10.30.5选择基数N=2‐‐‐‐0.58N=101.541.070.74N=501.701.140.8N=∞1.751.160.8核心场测定母猪留种率分布结测年度2013某场2013年度共测定母猪1884,留种964,留种率51%某场测定猪个体留种个体成绩对比100KG日龄随机选择关系不

5、成立,完全随机无论留种率多少选择强度都是0生长性能测定量评分2014年督导检查表世代间隔留种个体出生时父母平均年龄,与遗传进展成方比,猪世代间隔1.5~2年在育种数据直观分析中表现为种猪使用年限。世代间隔(单位:天)分娩母猪某场分娩母猪最大胎次比例(2014年)杜洛克长白大白胎次数量比例数量比例数量比例1胎200.15170.1200.002胎260.19450.31460.063胎110.0860.04530.074胎120.09180.12750.105胎380.28480.331790.256胎200.1580.052160.306胎~70.0550.031520.21合计13

6、41.001471.007211.00分娩母猪使用年限过长某场配种公猪年龄比例(2014年)杜洛克长白大白年龄数量比例数量比例数量比例0.5~100.00210.3900.001~1.5110.3950.0900.001.5~230.11100.1900.002~2.540.1460.11240.412.5~3100.36120.22340.593~合计281.00541.00581.00配种公猪使用年限过长种猪使用年限评分2014年督导检查表数据分析工具Office办公软件—Excel、Asscess数据库SQL语言MYSQL数据库SQLServer数据库Oracle数据库…

7、…..数据管理员需要掌握一种数据分析工具如何分析解决数据上传过程中错误记录上传数据内容•种猪登记信息•生长性能测定•繁殖性能测定–配种信息–产仔信息–断奶信息国内种猪登记ID号DDHBPF199000101耳号:(本年度出生的第1窝中的第1头猪)出生年度:1999年出生场代码:湖北桑梓湖种猪场一分场(总场HBPF,分场1)品种杜洛克国外引种的国家代码USAUnitedStates(美国)FRAFrance(法国)CANCanada(

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