苹果k+转运蛋白基因家族鉴定及表达分析

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1、园艺学报，2016，43(6)：1021–1032.ActaHorticulturaeSinicadoi：10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0944；http：//www.ahs.ac.cn1021+苹果K转运蛋白基因家族鉴定及表达分析*杨琳，董玲，李明军，马锋旺，邹养军（西北农林科技大学园艺学院，陕西杨凌712100）+摘要：利用苹果基因组筛选K转运蛋白基因，分析其系统发育关系，通过qRT-PCR检测它们在平+邑甜茶各器官组织和不同发育阶段果实的表达特征。结果表明，在苹果中存在65个K转运蛋白基因，包+括CHX家族（33个）、HA

2、K家族（24个）、HKT家族（1个）和KEA家族（7个），它们与拟南芥K转运蛋白基因高度同源，其基因结构相对保守，并且不均匀地分布在13条染色体上。定量表达分析发现，+K转运蛋白基因具有不同的表达模式，其中在根中高度表达的32个，在叶片中高度表达的12个，在茎+尖中高度表达的11个，在果实中高度表达的19个。研究结果为揭示苹果K转运蛋白基因的功能提供了基础资料。+关键词：苹果；K转运蛋白；基因家族；生物信息学；表达特性中图分类号：S661.1文献标志码：A文章编号：0513-353X（2016）06-1021-12IdentificationandExpres

3、sionAnalysisofPotassiumTransporterGeneFamilyinApple*YANGLin，DONGLing，LIMing-jun，MAFeng-wang，andZOUYang-jun（CollegeofHorticulture，NorthwestA&FUniversity，Yangling，Shaanxi712100，China）Abstract：Inthisstudy，theinformationthatcontainedphylogeneticrelationshipanddistributionof+applepotassi

4、um（K）transportergeneswasanalyzedbasedonMalusgenomedatabase，andtheir+expressioncharacteristicswereexploredbymeansofqRT-PCRsinapple.Theresultsshowedthat65Ktransportergeneswereidentified，andtheyweredividedinto4families：CHXfamily，HAKfamily，HKTfamilyandKEAfamily，including33，24，1and7membe

5、rs，respectively.Thesegenesarehighly+homologouswithArabidopsisthalianaKtransportergenes.Chromosomallocalizationexhibitedthat+theseKtransportergenesweredistributedinthethirteenofseventeenapplechromosomesunevenly.+QuantitativeexpressionanalysisshowedthatmostoftheKtransportergeneshaddif

6、ferentialexpressionpatterns.Thethirty-twogeneshadhigherexpressionabundanceinrootwhile12genesinmatureleaves，11+genesinshoottipsand19genesinfruit.TheresultslayabasisforrevealingthefunctionofKtransportergenesinapple.Keywords：Malus×domestica；potassiumtransporter；genefamily；bioinformatic

7、；expressioncharacteristic收稿日期：2016–02–24；修回日期：2016–05–19基金项目：国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目（CARS-28）；国家科技支撑计划项目（2014BAD10B02）*通信作者Authorforcorrespondence（E-mail：yangjunzou@126.com）YangLin，DongLing，LiMing-jun，MaFeng-wang，ZouYang-jun.Identificationandexpressionanalysisofpotassiumtransportergene

8、familyinapple.1022A