油菜非特异性脂转运蛋白基因家族的全基因组水平鉴定和表达分析

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1、分类号：S512.1学校代码：10712UDC：633.10研究生学号：2013050113密级：公开灶衣林研枚大学2015届全日制硕士专业学位研究生学位论文油菜非特异性脂转运蛋白基因家族的全基因组水平鉴定和表达分析类頌农业推广硕士领域、方向作物研究生王洪指导教师马翎健教授胡赞民教授完成时间2015年5月中国陕西杨凌研究生学位论文的独创性声明本人声明：所呈交的全曰制硕士专业学位论文是我个人在导师指导下独立进行的研究工作及取得的研究结果；论文中的研究数据及结果的获得完全符合学校《关于规范西北农林科技大学研究生学术道德的暂行规定》，如果违反此规定，一

2、切后果与法律责任均由本人承担。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论丈中不包含其他人已经发表或撰写过的研究结果，也不包含其他人和自己本人已获得西北农林科技大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料，与我一同工作的同事对本研究所做的任何贡献均已在论文的致谢中作了明确的说明并表示了谢意8研究生签名：时间：7〇以年t月i曰导师指导研究生学位论文的承诺本人承诺：我的全日制硕士专业学位研究生所呈交的硕士学位论文是在我指导下独立开展研究工作及取得的研究结果，属于我现岗职务工作的结果，并严格按照学校《关于规范西北农林科技大学研究生学术道德的暂行规定

3、》而获得的研究结果。如果违反学校《关于规范西北农林科技大学研究生学术道德的暂行规定》，我愿接受按学校有关规定的处罚处理并承担相应导师连带责任。关于研究生学位论文使用授权的说明本学位论文的知识产权归属西北农林科技大学.本人同意西北农林科技大学保存或向国家有关部门或机构送交论文的纸质版和电子版，允许论文被查阅和借阅；同意西北农林科技大学将本学位论文的全部或部分内容授权汇编录入《中国优秀硕士学位论文全文数据库》进行出版，并享受相关权益.本人保证，在毕业离开（或者工作调离）西北农林科技大学后，发表或者使用本学位论文及其相关的工作成果时，将以西北农林科技大

4、学为第一署名单位，否则，愿意按《中华人民共和国著作权法》等有关规定接受处理并承担法律责任。任何收存和保管本论文各种版本的其他单位和个人（包括研究生本人)未经本论文作者的导师同意，不得有对本论文进行复制、修改、发行、出租、改编等侵犯著作权的行为，否则，按违背《中华人民共和国著作权法》等有关规定处理并追究法律责任。(保密的学位论文在保密期限内，不得以任何方式发表、借阅、复印、缩印或扫描复制手段保存、汇编论文）研究生签名：时间：年(月曰油菜非特异性脂转运蛋白基因家族的全基因组水平鉴定和表达分析摘要油菜是我国最重要的油料作物，其最主要的育种目标是提高油菜

5、种子油脂含量和改良脂肪酸组分。特异性脂转运蛋白(nsLTPs)是一类分子量小的碱性蛋白质。它们具有8个位置保守的半胱氨酸残基，这8个半胱氨酸残基参与形成4个二硫键。植物nsLTPs具有多种不同的功能，例如响应不同的外界环境条件，抵抗细菌和真菌病原体，影响有性生殖以及最基本的调控脂质转运等。既然nsLTPs的一个主要功能是调控脂质转运，那么它们可能影响油菜种子含油量以及脂肪酸组成。但是目前还没有在基因组水平上研究油菜nsLTPs基因家族的相关报道。所以我们的目地就是在基因组水平上研究油菜nsLTPs基因家族。通过生物信息学手段全面地分析白菜型油菜的

6、基因组，本研究一共鉴定了77个BrnsLTPs候选基因。基于它们的氨基酸序列相似性，这些BrnsLTPs一共可以划分为10个亚类(I、II、III、IV、V、VI、VII、VIII、IX和Y)。共线性分析结果证明全基因组复制事件（WGD）是BrnsLTPs家族成员扩张的主要方式。BrnsLTPs基因在不同器官或组织的转录本文件表明它们具有不同的基因表达模式。其中有一些BrnsLTPs基因只在或主要在荚中表达，这暗示它们可能与种子含油量以及脂肪酸组成相关联。此外，大部分BrnsLTPs基因能响应Pi的诱导。总之，在基因组水平鉴定BrnsLTPs成员

7、，对其进行生物信息学分析和表达分析，将会促进该基因家族的研究，并为阐明它们在种子含油量和脂肪酸组成方面的生物学功能提供新的视角。关键词：白菜型油菜；非特异性脂质转运蛋白；基因克隆；表达分析GENOME-WIDEIDENTIFICATIONANDEXPRESSIONANALYSISOFBRNSLTPSGENEFAMILYINBRASSICARAPAABSTRACTNon-specificlipidtransferproteins(nsLTPs)aresmallandbasicproteinscharacterizedbyaconservedpatt

8、ernofeightcysteines,formingfourdisulfidebridges.Therearemanydifferen