紫背天葵高通量转录组测序分析

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1、园艺学报，2016，43(5)：935–946.ActaHorticulturaeSinicadoi：10.16420/j.issn.0513-353x.2016-0140；http：//www.ahs.ac.cn935紫背天葵高通量转录组测序分析1,211,*1,2111张少平，洪建基，邱珊莲，郑云云，张帅，吴松海，何炎森，1,21郑开斌，郑加协12（福建省农业科学院亚热带农业研究所，福建漳州363005；福建省农业科学院作物研究所，福州350013）摘要：为探讨紫背天葵（Gynurabicolor）花青素等

2、物质合成的遗传基础，采用高通量测序技术（IlluminaHiSeq2500）对其嫩叶进行转录组测序，共获得21387624个序列读取片段（reads），将测序数据进行序列组装后，获得33314个单基因簇（Unigene），其中超过1kb的7792个Unigene中共检测到2387个SSR位点。对所得Unigene进行不同数据库注释，22048和14417个Unigene分别在Nr和SwissProt数据库有同源比对信息，并发现有29个Unigene与花青素合成相关；Pfam功能注释到13909个Unigene分

3、为5198类相关蛋白功能区域，有12个Unigene涉及到花青素合成；GO注释到11613个Unigene分为细胞组分、分子功能及生物学过程等3大类51个功能组，有24个Unigene与花青素合成有关；COG注释到的6589个Unigene功能系统分为24类，而KOG注释到的13498个Unigene功能系统分为25类；以KEGG数据库为参考，将4466个Unigene定位到108个代谢途径分支，其中有47个Unigene与类黄酮生物合成相关。关键词：紫背天葵；转录组；测序；基因分析；功能注释中图分类号：S56

4、7文献标志码：A文章编号：0513-353X（2016）05-0935-12SequencingandAnalysisoftheTranscriptomeofGynurabicolor1,211,*1,21ZHANGShao-ping，HONGJian-ji，QIUShan-lian，ZHENGYun-yun，ZHANGShuai，111,21WUSong-hai，HEYan-sen，ZHENGKai-bin，andZHENGJia-xie1（SubtropicalAgricultureResearchInst

5、itute，FujianAcademyofAgriculturalSciences，Zhangzhou，Fujian363005，2China；CropSciencesInstitute，FujianAcademyofAgriculturalSciences，Fuzhou350013，China）Abstract：Gynurabicolorisrichinanthocyanidinandotherfunctionalcomponents.Inordertoexploregeneticbasisforthesyn

6、thesisoftheseactivesubstances，thetranscriptomeofGynurabicolorwassequencedbyIlluminaHiSeq2500platform，atotalof21387624readingfragmentsweregeneratedwhichformed33314unigenesbysequencesplicing.2387SSRwerefoundin7792unigenesover1kb.Allunigeneswereannotatedbydiffe

7、rentdatabases.22048and14417unigeneswereannotatedagainstNrandSwissProtdatabaserespectively，and29unigeneswererelatedtoanthocyanidinbiosynthesis；byPfamdatabasethe13909unigeneswereincludedin5198familiesofproteinfunctionalregionsand12unigeneswererelatedtoanthocya

8、nidinbiosynthesis；byGOdatabasethe11613unigenesweredividedinto3categoriescontaining51functiongroupsand24unigeneswererelatedtoanthocyanidin收稿日期：2016–03–28；修回日期：2016–05–02基金项目：福建省自然科学基金项目（2013J0109