脉冲场凝胶电泳技术的应用及其发展趋势

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1、·22·《上海畜牧兽医通讯》2014年第6期脉冲场凝胶电泳技术的应用及其发展趋势董栋122商军钱晓璐(1上海海洋大学上海2013062上海市兽药饲料检测所上海201103)DOI:10.14170/j.cnki.cn31-1278/s.2014.06.008基因分型方法即分子分型方法,是用现代分子分型与鉴定的血清型呈现明显关系,但通过研究吸附生物学技术分析菌株间基因组的相似程度,进而弥能力的结果显示,单核细胞增生李斯特菌的PFGE分〔6〕补表型分型在分型能力、重复性及分辨力上的欠型与其吸附能力之间不存在联系。此实验是PF-〔1〕缺。

2、脉冲场凝胶电泳(PFGE)是一种重要的分子GE对细菌特性的一次分子水平上的探索。分型技术,其工作原理是:大小不同的DNA分子在1.2PFGE在耐药菌株溯源性中应用交替变换方向的电场中作出反应所需的时间不同,在研究香港海鸥菌时,发现从2个不相关的患一般较小的分子重新定向较快,在凝胶中移动快,者上获得的2株香港海鸥菌的遗传与最初从青蛙中大的DNA分子比小的DNA分子定向慢,在凝胶中分离的菌株相关。这是对引发病症的溯源起到很移动比较慢,根据各DNA分子迁移距离的不同,从好的作用。如果用PFGE分析细菌耐药性,就可以而可以达到分离不同大小的

3、DNA分子的目的。在追踪病原菌来源,从而对病原菌引发的疾病做预所有分子分型方法中,脉冲场凝胶电泳以重复性防。PFGE应用于细菌耐药性已有研究。以2011好、分辨性强,被作为细菌分子分型的“金标准”。年台湾报道了2000年到2005年从台北超市鸡肉中现在PFGE已被广泛应用于菌株遗传关系比较、食获得的多重耐药性菌株施瓦岑格隆德沙门氏菌为源性和疫源性致病菌的溯源、疫情的传染源追踪以例,这些菌株有相同的耐药性。PFGE分析结果表及临床诊断治疗、药学等各个方面。本文分别介绍明,菌株耐药性的主要亚型在2000年到2005年间了PFGE技术在细

4、菌传播污染控制、耐药菌株溯源重复出现。然后收集了2006年台湾中部和南部的性、耐药菌株流行趋势分析中应用及其该技术有待菌株,PFGE分析后却没有得出同样的亚型。这样解决的问题及发展趋势。通过施瓦岑格隆德沙门氏菌进行PFGE分型,可对1PFGE技术应用疾病进行溯源,表明鸡肉中施瓦岑格隆德沙门氏菌1.1PFGE在细菌传播污染控制中应用的反复侵染最有可能是残留在仪器设备中的菌株〔7〕〔8〕所带来的。2005年,杨玲丽等采用PFGE分型PFGE用于追踪细菌传染性疾病,通过对细菌进行分子分型,可以在表面散在分布的病例中寻找可能方法对分离自养殖

5、场动物、环境和饲养员的86株耐的联系,通过监测而发现引发病情的传染源。如药谱相近多重耐药大肠杆菌进行DNA指纹图谱分2010年,韩国在研究泛耐药鲍曼不动杆菌(extensive-型,比较菌株间的亲缘关系,结果发现同一养殖场lydrug-resistantAcinetobacterbaumannii,XDR-AB)不同动物个体、养殖环境不同采样点、动物和环境的风险因素时,通过用PFGE分析XDR-AB的基因和以及饲养员和环境都存在PFGE指纹图谱完全相来自医院的克隆流行病菌株,得出第三代头孢菌素的同菌株,说明同一养殖场不同动物、动物和

6、环境之使用与在典型的成年患者上获得的XDR-AB相关,间以及环境与饲养员之间存在着耐药大肠杆菌的〔2〕。克隆传播。PFGE的结果也说明该菌株在医院内不存在传播又如2012年,陈荀等〔3〕在进行鸡肉生产链中空肠弯在分析单核细胞增生李斯特菌时,尽管做了很曲杆菌的污染分析的研究时,从所分离的空肠弯曲杆多努力,但聚类分析时菌株的视觉区分差异仍有不菌中选取83株进行PFGE分型,结果产生了45种不同。有研究表明,因为有相同的PFGE分型的敏感同的谱型,其中有谱型同时具有养殖场、屠宰场和市菌株和抗性菌株,它们在分型和抗生素抗性间没有〔9〕场中的

7、菌株,说明空肠弯曲杆菌在鸡肉生产链中可能关系,这说明难区分的菌株可能是不同的来源。存在水平传播现象。这些都是近年来PFGE在医学这也说明了PFGE分析方法可能并不足以辨别菌〔10〕和生产养殖中的成功应用。在研究单核细胞增生李株。用计算机分析时,视觉上的PFGE匹配也发斯特菌菌株中,PFGE分型表明了分子类型与特定菌现不同,为了提高分型数据的正确解释度,需要建株来源的关系〔4〕,这种关系在研究香港海鸥菌时有一立一种数量大、种类多的PFGE数据库来提高PF-〔11〕个有意思的发现,在同一采样地点不同的采样时间采GE的实用性。现已有人建立

8、了对从业人员健康集的8株香港海鸥菌呈现同样的PFGE分型,这表明体检分离到的人沙门氏菌PFGE图谱数据库,可有香港海鸥菌的传播污染在繁殖地已经发生〔5〕。这是效地应用于沙门氏菌溯源分析及分子流行病学研究。这是PFGE在沙门氏菌分析的成

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