真菌多样性研究方法进展

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1、·60·中国真菌学杂志2014年2月第9卷第1期ChinJMycol，February2014，Vol9，No．1·综述·真菌多样性研究方法进展12石莉娜刘晓峰(1．云南昆明长水国际机场医疗急救中心，昆明650500;2．昆明理工大学生命科学与技术学院，昆明650500)【摘要】真菌广泛存在于自然界，在生态系统中发挥着重要的作用。随着分子生物学技术在微生物多样性研究中的广泛应用以及宏基因组学技术的出现，打破了传统微生物培养法的局限性，人们对于真菌多样性的认识日渐提高。该文主要综述了研究真菌多样性方法

2、的主要发展历程，介绍几种有关真菌多样性研究常用的分子生物学方法，包括基于PCＲ的克隆文库方法、变性梯度凝胶电泳、末端限制性长度多态性、实时荧光定量PCＲ、荧光原位杂交、序列标签标记的高通量测序以及宏基因组技术，并且阐述宏基因组学技术在此领域蕴含的巨大发展潜力。【关键词】真菌;多样性;研究方法【中图分类号】Ｒ379【文献标识码】A【文章编号】1673-3827(2014)09-0060-05Advancesinthemethodoffungidiversity12SHILi-na，LIUXiao-fe

3、ng(1．MedicalEmergencyDepartment，Changshuiinternationalairport，Kunming650500;2．CollegeofLifeScienceandTechnology，KunmingUniversityofScienceandTechnology，Kunming650500，China)【Abstract】Fungiwidelyexistsinnature，playinganimportantroleintheecosystem．Theperv

4、asiveapplicationofmolecularbiol-ogytechnologyinmicrobialdiversityandtheemergenceofmetagenomicbreakedthelimitationsoftraditionalmicrobialculturemeth-od，sothatimprovethehuman＇srecognitionoffungaldiversity．Thispaperreviewedthemaindevelopmentcourseofstudyi

5、ngfungaldiversityapproaches，introducedseveralcommonlyusedmethodsofmolecularbiologyonfungaldiversityresearch，mainlyincludingclonelibraryPCＲbased，Denaturinggradientgelelectrophoresis，Terminalrestrictionfragmentlengthpolymorphism，Ｒeal-timeflu-orescentquan

6、titativePCＲ，Fluorescenceinsituhybridizationandbarcodedpyrosequencing，andexpoundedthehugepotentialofmetagenomicsinthisfield．【Keyword】fungi;diversity;method［ChinJMycol，2014，9(1):60-64］自然界中的微生物分布广、种类多、资源极其有较高的真菌多样性。丰富，主要包括细菌、病毒、真菌等。迄今人们已发真菌多样性的研究方法很多，从国内外

7、目前采现的微生物物种仅为自然界中微生物总数的1%用的方法来看，大致上可分为:传统的微生物培养［1］～10%。微生物群落多样性是环境微生物多样法、分子生物学方法以及宏基因组学技术。随着现性研究的核心内容。目前微生物多样性研究多局代科学技术的发展，越来越多的新技术、新方法用限于细菌，而对真菌的研究相对较少。研究真菌群于真菌多样性领域的研究，使人们对真菌多样性的落多样性可以了解真菌群落结构、真菌的种类和数认识更加全面深入。量分布特点，并且可以进一步为控制和优化真菌群1传统微生物培养法落结构提供参考，同时也

8、是研究微生物群落多样性从传统上讲，真菌多样性的研究主要利用分离的重要内容。真菌遍布于自然界，据估计约有数百培养及形态学检测的方法，该技术在实验室被广泛万种，已发现的仅9万余种，已发现的导致人类疾［2］使用。尽管各种新的培养技术不断出现，但此方法病的仅约400种。人类也生活在真菌包围的环费时费力，敏感度和特异性也较低，也不能反应全境中，日常工作、生活中所接触到的真菌种类远超［3-4］［5］部的真菌群落信息。Amann等曾根据微生目前的认知。因此，不论是自然环境还是人体都