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《梨小食心虫线粒体基因全分析及进化树的构建毕业论文》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、梨小食心虫线粒体基因全分析及进化树的构建摘要：伴随着生物信息学的发展，现在越来越多的学科接受了生物信息学的分析手段和分析方法，并将生物信息学的分析结果作为验证实验成果的有力依据。梨小食心虫的危害也越来越突出，并且梨小食心虫的研究也已经进入了分子研究阶段，非常需要生物信息学的科学分析方法和分析结论，为其分子水平的结果作有力论证。本论题的研究主要内容为运用生物信息学的各种成熟软件对从NCBI数据库中获取的梨小食心虫体内的线粒体基因全序列进行生物学分析，重点对基因的数列、外显子信息、编码蛋白及其理化性质进行分析，并预测其
2、编码蛋白的结构与功能，并通过与代表性的生物进行同源进化树的构建。通过实验论证，我们得出梨小食心虫线粒体基因的NCBI的登录号NC014806，基因全长为15717bp，为一环形的双链DNA，于6748~7299处存在一个长552bp的开放阅读框，可编码为183个氨基酸，其翻译的蛋白质为酸性蛋白，亲水性较强，且以α–螺旋肽链盘绕为主，其序列与日本的野桑蚕线粒体有很高的同源性。经过与八种物种进行多序列比对，构建进化树，我们可以得知梨小食心虫与其中的茶小卷叶蛾、朝灰蝶进化关系关系最近。关键词：生物信息学;梨小食心虫;线粒
3、体基因序列;基因分析;进化树ThecompleteanalysisofGrapholitamolestamitochondrialDNAandtheconstructionoftheevolutionarytreeAbstract:Withthedevelopmentofbioinformatics,moreandmoresubjectsacceptofthetoolsandanalyticalmethodsofbioinformatics,andtheresultofbioinformaticsanalysisc
4、anbeasastrongbasisfortheverification.Grapholithamolesta’shazardshasbecomeincreasinglyprominent,andGrapholithamolesta’sresearchhasenteredaphaseofmolecularstudies,agreatneedforthescientificanalysismethodsandconclusionsofthebioinformatics,makeastrongargumentforth
5、eresultsofitsmolecular.ThemaincontentofthisstudyistouseavarietyofsophisticatedbioinformaticssoftwaretoanalysisthemitochondrialgenesequencesofthepearborerobtainedfromtheNCBIdatabase,focusingonthegenesequence,exoninformation,codingproteinsandtheirphysicalandchem
6、icalproperties,andforecastitsencodedproteinstructureandfunction,toexpectthevaluablebiologicaldataobtainedfromthemassofbiologicaldata,andtoconstructtheevolutiontreethroughthecomparewiththerepresentationofthebiology.Throughexperiments,wecanknowthattheGrapholitha
7、molestamitochondrialgenesequencesiscirculardouble-strandedDNA,theNCBIaccessionnumberfortheNC014806,Full-lengthis15717bp,andbetween6748and7299existofalongopenreadingframeof552bp,encoding183aminoacids,whosetranslationoftheproteinisacidicprotein,astronghydrophili
8、c,andcoiled-basedbyα-helicalpeptidechain,thesequencehaveahighhomologywiththeJapanwildsilkwormmitochondria.Throughtheconstructionofevolutionarytree,weknowthatGrapholithamolestawithA
