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《梨小食心虫线粒体基因全分析与进化树的构建.doc》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、梨小食心虫线粒体基因全分析及进化树的构建摘要：伴随着生物信息学的发展，现在越来越多的学科接受了生物信息学的分析手段和分析方法，并将生物信息学的分析结果作为验证实验成果的有力依据。梨小食心虫的危害也越来越突出，并且梨小食心虫的研究也已经进入了分子研究阶段，非常需要生物信息学的科学分析方法和分析结论，为其分子水平的结果作有力论证。本论题的研究主要容为运用生物信息学的各种成熟软件对从NCBI数据库中获取的梨小食心虫体的线粒体基因全序列进行生物学分析，重点对基因的数列、外显子信息、编码蛋白及其理化性质进行分析，并预测其编码蛋白的结构与功能，并通过与代表性的生物进行同源进化树的构建。通过实验论证，我
2、们得出梨小食心虫线粒体基因的NCBI的登录号NC014806，基因全长为15717bp，为一环形的双链DNA，于6748~7299处存在一个长552bp的开放阅读框，可编码为183个氨基酸，其翻译的蛋白质为酸性蛋白，亲水性较强，且以α–螺旋肽链盘绕为主，其序列与日本的野桑蚕线粒体有很高的同源性。经过与八种物种进行多序列比对，构建进化树，我们可以得知梨小食心虫与其中的茶小卷叶蛾、朝灰蝶进化关系关系最近。关键词：生物信息学;梨小食心虫;线粒体基因序列;基因分析;进化树ThecompleteanalysisofGrapholitamolestamitochondrialDNAandthecons
3、tructionoftheevolutionarytreeAbstract:Withthedevelopmentofbioinformatics,moreandmoresubjectsacceptofthetoolsandanalyticalmethodsofbioinformatics,andtheresultofbioinformaticsanalysiscanbeasastrongbasisfortheverification.Grapholithamolesta’shazardshasbecomeincreasinglyprominent,andGrapholithamolesta
4、’sresearchhasenteredaphaseofmolecularstudies,agreatneedforthescientificanalysismethodsandconclusionsofthebioinformatics,makeastrongargumentfortheresultsofitsmolecular.Themaincontentofthisstudyistouseavarietyofsophisticatedbioinformaticssoftwaretoanalysisthemitochondrialgenesequencesofthepearborero
5、btainedfromtheNCBIdatabase,focusingonthegenesequence,exoninformation,codingproteinsandtheirphysicalandchemicalproperties,andforecastitsencodedproteinstructureandfunction,toexpectthevaluablebiologicaldataobtainedfromthemassofbiologicaldata,andtoconstructtheevolutiontreethroughthecomparewiththerepre
6、sentationofthebiology.Throughexperiments,wecanknowthattheGrapholithamolestamitochondrialgenesequencesiscirculardouble-strandedDNA,theNCBIaccessionnumberfortheNC014806,Full-lengthis15717bp,andbetween6748and7299existofalongopenreadingframeof552bp,encoding183aminoacids,whosetranslationoftheproteinisa
7、cidicprotein,astronghydrophilic,andcoiled-basedbyα-helicalpeptidechain,thesequencehaveahighhomologywiththeJapanwildsilkwormmitochondria.Throughtheconstructionofevolutionarytree,weknowthatGrapholithamolestawithAdo
