微生物检验细菌的分类与命名

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1、第八章 细菌的分类与命名本章考点:  1.概述  (1)概念  (2)分类法  2.微生物在生物化学分类中的地位  (1)细菌与原核生物界  (2)真菌与真菌界  (3)病毒与病毒界  3.细菌的分类单位、系统和命名  (1)细菌分类单位  (2)细菌命名  (3)细菌分类系统  4.细菌的分类方法  (1)生理学与生物化学分类法  (2)遗传学分类法  细菌分类是根据每种细菌各自的特征,并按照它们的亲缘关系分门别类,以不同等级编排成系统。分类有两种:①以细菌的形态和生理生化特征为依据的生理生化分类法,包括有传统分类法和数值分类法;②用化学分析和核酸分析,以细

2、菌大分子物质(核酸、蛋白质)结构的同源程度进行分类称种系分类或自然分类。  一、微生物在生物化学分类中的地位  (一)细菌与原核生物界  细菌、衣原体、立克次体、螺旋体、放线菌、支原体等归属于原核生物界,其分类等级依次为界、门、纲、目、科、属、种。有时在两个相邻等级间可添加次要的分类单位,如亚门、亚纲、亚属、亚种,科和属之间还可添加族。  (二)真菌与真菌界  真菌是真核细胞型微生物,归属真菌界,与原核生物具有明显不同(见表5-8-1)。一般医学上有关的真菌主要分属于真菌界的无鞭毛菌门。表5-8-1 原核生物和真核生物细胞结构比较 原核生物真核生物核无核膜、核

3、仁,只有拟核有核膜、核仁和染色体细胞器无线粒体、细胞器不完整有完整的细胞器和线粒体细胞壁基本成分肽聚糖无肽聚糖细胞分裂二分裂有丝分裂、芽生  (三)病毒与病毒界  病毒没有典型的细胞结构,无产生能量的酶系统,只能在宿主活细胞内增殖,归属于病毒界。病毒的分类等级依次为科、属、种,有时在科的下面添加亚科。  二、细菌的分类单位、系统和命名  (一)细菌的分类单位  细菌的分类等级(分类单位)和其他生物相同,为界、门、纲、目、科、属、种。  临床细菌检验常用的分类单位是科、属、种。种是细菌分类的基本单位。形态学和生理学性状相同的细菌群体构成一个菌种;性状相近、关系密

4、切的若干菌种组成属;相近的属归为科,依次类推。在两个相邻等级之间可添加次要的分类单位,如亚门、亚纲、亚属、亚种等。  同一菌种不同来源的细菌称该菌的不同菌株。它们的性状可以完全相同,也可以有某些差异。具有该种细菌典型特征的菌株称为该菌的标准菌株,在细菌的分类、鉴定和命名时都以标准菌株为依据,标准菌株也可作为质量控制的标准。  (二)细菌的命名  国际上一个细菌种的科学命名采用拉丁文双命名法,由两个拉丁字组成,前一字为属名,用名词,首字母大写;后一字为种名,用形容词,首字母小写,印刷时用斜体字。中文译名则是以种名放在前面,属名放在后面。例如:Mycobacter

5、iumtuberculosis(结核分枝杆菌),Salmonellatyphi(伤寒沙门菌)等。有时某些常见的细菌也可用习惯通用的俗名,如Tuberclebacillus(结核杆菌)、Typhoidbacillus(伤寒杆菌)等。  (三)细菌的分类系统  细菌分类系统有多种,为了便于文献资料的相互比较、分析和交流,目前国际上普遍采用伯杰分类系统。也有采用CDC(美国疾病预防和控制中心)分类系统。包括有细菌的鉴定以及细菌分类资料。  三、细菌的分类方法  (一)生理学与生物化学分类法  细菌的形态,染色以及细菌的特殊结构是最早和最基本的分类依据;而细菌的生理生

6、化特征一直作为分类的主要依据。  目前,以生理生化学作细菌分类的广泛采用方法有两种,即传统分类法和数值分类法。  1.传统分类法:传统分类的原则是将生物的基本性质分为主要的和次要的(主次原则),然后将主次顺序一级一级地往下分,直至最小区分。按细胞形态、革兰染色性、鞭毛及代谢特点作为较高一级分类依据。科、属、种水平的分类主要依靠生化特性和抗原结构。  2.数值分类法:数值分类法集数字、电子、信息及自动化分析技术于一体,将细菌的一些基本性质视为同等重要(等重要原则),采用标准化、成品化和配套生化反应试剂条,检测细菌的数十个生理生化特性。每个细菌都能产生一套阴阳性结

7、果,然后转换成数字,通过电子计算机进行复杂计算,比较每一株与其他类同株,测定其相似度。根据相似度,区分细菌的种群,并确定各种细菌的亲缘关系。  (二)遗传学分类法  遗传学分类是以细菌的核酸、蛋白质等在组成的同源程度分类。目前较为稳定的应用遗传学的细菌分类方法有下列几种:  1.DNAG+Cmol%测定。同一种细菌的G+Cmol%相当稳定,不受菌龄、培养条件和其他外界因素影响,亲缘关系越接近的细菌,G+Cmol%越接近。  2.核酸同源值测定。G+Cmol%相同,并不一定是同一种细菌,不能反应碱基的序列。  3.核糖体RNA碱基序列测定。rRNA的序列比较保守

8、。  本章练习题:  细菌分类的基本单

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